基于宏基因组测序的细菌株水平研究进展

宏基因组指样本中全部生物遗传物质的集合。目前,细菌的宏基因组学研究主要包含群落组成结构、遗传多样性以及重要功能基因谱等内容,相关分析通常基于细菌的属或种水平开展。随着高通量测序技术和生物信息学分析技术的发展,宏基因组研究已初步达到细菌株水平解析度,为推断细菌生态和进化规律等提供了新的工具和科学认识。本研究从遗传多样性、疫情暴发溯源研究以及重要功能基因谱3个方面,对基于宏基因组测序的细菌株水平研究进展进行了总结,以期为该技术的发展应用提供参考。     

基于正气的趋向性探析饮食异常的六经辨治

饮食是人类生命得以延续的根本保障。传统观点认为,饮食异常为机体患病的症状表现,多表现为食欲减退、消谷善饥、餐后不适与反能食4种类型。通过“邪之所凑,其气必趋”,即实者正气趋而攻之,虚者正气趋而补之,探讨饮食异常实为正邪斗争过程中,正气保护机体的反应。借助张仲景的六经辨证体系,参考《伤寒论》原文,探索饮食异常的辨证论治,以期为临床因势利导辨治饮食异常提供参考,从而提高临床辨治饮食异常的疗效。     

自拟健脾化痰方治疗非酒精性脂肪性肝炎57例疗效观察

目的：观察自拟健脾化痰方治疗非酒精性脂肪性肝炎的疗效。方法：112例非酒精性脂肪性肝炎患者,随机分为治疗组57例,对照组55例。两组患者均给予包括控制饮食、适当有氧运动等一般基础治疗,在此基础上,治疗组给予自拟健睥化痰方中药免煎剂,1剂／d,分两次冲服,对照组给予多烯磷脂酰胆碱456mg／次,3次／d,疗程3个月。疗程结束时比较两组患者肝功能、血脂及综合疗效。结果：健脾化痰方能改善患者肝功能,降低患者血清TG,总有效率89．47％,多烯磷脂酰胆碱也能改善患者肝功能,其总有效率为58．18％。两组总有效率比较,健脾化痰方优于多烯磷脂酰胆碱（P〈0．05）。结论：健脾化痰方是治疗非酒精性脂肪性肝炎的有效药物,综合疗效优于多烯磷脂酰胆碱。     

仲景欲症思辨

本文基于张仲景著作中“欲”所引出的临床表现,提出“欲症”概念。从“欲”的本义出发,结合《伤寒论》《金匮要略》中的不同表述方式,对其进行分类、概括,立足中医思维方式与临证指导思想,探析欲症蕴含的理论特色,追溯欲症的形成根源,明确欲症的临床指导意义。在理论特色方面,依据“欲求症”与“欲作症”的不同分类,指出前者集中体现的生命形神一体观,后者反映的既病防变思想;在形成根源方面,认为人体之气的开阖运动变化与消长数量变化是欲症发生的内在原由,总结了欲症治疗中遵循的“开后气消”“消后气阖”规律与“长而不开”“开阖失职”的异常状态;在临床指导方面,认为欲症的有无、性质的差异可作为病机辨析的立足点,通过内在驱动、自主调节的基本特点,从病家真实身心整体状况出发,把握疾病发展趋势,为解决疑难病证提供新思路。对于仲景著作欲症内涵的探析,有助于理解临床经典隐含的指导思想,提升症状辨识能力,深化实践指导意义。     

利甩小RNA高通量测序筛查媒介昆虫携带的病原体

高通量测序方法筛查媒介昆虫携带病原体是一种新的重要方法。研究表明小RNA高通量测序可用于昆虫携带病毒的检测。本工作尝试用小RNA高通量测序法筛查昆虫携带的病毒,发现该方法不仅可用于媒介昆虫携带病毒的检测,也可以用于原核和真核病原体的筛查。用该方法对野外采集的3种蚊虫和3种蜱进行分析,用blast程序对NCBI核酸序列库（nt）进行比对搜索,从测序结果中查找到多种病毒、原核及真核的病原体。上述结果表明,小RNA高通量测序可以用于各种病原体的发现,有望发展成为一种通用的病原体筛查技术。     

不同样本测序前处理方案对冠状病毒基因组高通量测序结果的影响

目的以基因组最大RNA病毒(冠状病毒)为代表,研究不同测序前样本处理模式对高通量测序获得病毒全基因组序列信息质量的影响。方法以细胞培养的人冠状病毒HCoV-OC43样本为代表,分为4种测序前样本处理模式,即:未处理组、核酸提取前DNase和RNase处理组、核酸提取后DNase处理组、核酸提取前DNase和RNase处理且核酸提取后DNase处理组。不同模式处理后的核酸分为两份,一份直接RNA测序(未扩增),另一份经序列非依赖的单引物扩增(SISPA)后DNA测序。结果尽管不同处理方式下获得的病毒基因组覆盖率差别不大,但是样本核酸提取后经DNase处理组直接测序获得了最高的基因覆盖度和测序准确性,而SISPA扩增可有效提高病毒测序读长(reads)比例与基因组各位点的测序深度。结论本研究为优化冠状病毒等RNA病毒全基因组测序策略提供了技术参考。