GenoType MTBDRplus方法对结核杆菌耐药性的检测

目的应用Geno Type MTBDRplus方法和传统比例法,对结核分枝杆菌利福平耐药性进行对比检测。方法同一份痰标本分别进行Geno Type MTBDRplus方法和传统比例法检测,检测结核分枝杆菌对利福平的耐药性。结果 52份涂片阳性痰标本,Geno Type MTBDRpuls方法检测结核分枝杆菌利福平耐药性的敏感度为75%,特异度为97.9%。结论Geno Type MTBDRpuls方法检测利福平耐药性,为临床早期诊断耐药结核病提供快速检测依据,利于临床早期合理治疗。     

心房利钠肽与心血管疾病

心房利钠肽属于利钠肽家族,其通过与受体结合激活鸟苷酸环化酶,促进细胞内环鸟苷酸水平升高而发挥生物学功能。心房利钠肽具有利钠、利尿、舒张血管平滑肌、抑制细胞增殖等多种作用,在维持血压,水、钠平衡以及在心血管疾病的病理生理过程中发挥重要作用。     

Xpert Mtb/RIF、痰涂片和培养在疑似肺结核诊断中的对比研究

目的探讨Xpert Mtb/RIF法、痰涂片、固体培养对临床疑似肺结核诊断的应用价值。方法收集315例疑似肺结核患者痰样本,分别进行金胺O荧光涂片镜检、固体培养、传统药敏、Xpert Mtb/RIF检测,并将结果进行分析。结果Xpert Mtb/RIF阳性率高于金胺O荧光涂片镜检,差异有统计学意义(χ2=40,P0.05);Xpert Mtb/RIF检测的阳性率与结核分枝杆菌培养比较,差异无统计学意义(χ2=2.57,P0.05)。Xpert Mtb/RIF检测结核分枝杆菌的敏感度和特异度分别为66.7%(36/54)和88.9%(232/261),以传统比例法药敏为金标准,Xpert Mtb/RIF检测利福平耐药的敏感度和特异度分别为100.0%(2/2)和97.1%(33/34)。对Xpert Mtb/RIF试验和固体培养法及传统比例法药敏试验进行Kappa检验,检测结果一致性均较好(K值分别为0.514、0.785)。结论 Xpert Mtb/RIF与痰涂片、固体培养相结合可进一步提高结核分枝杆菌的检出率,对临床诊断具有重要意义。     

基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法对MGIT960阳性管中微生物的菌种鉴定

目的 应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS）法对BACTECTMMGIT960（简称“MGIT960”）仪器报告阳性的培养管中的微生物进行菌种鉴定，并分析不同菌株的分布情况。方法 收集2021—2022年天津市结核病控制中心参比实验室MGIT960仪器报告的阳性管2 662管，将液体培养物分别转种至血平板和中性罗氏培养基，对获得的分离株应用MALDI-TOF MS法进行鉴定，根据质谱结果将同一患者在同一种培养基上不重复的结果全部纳入菌种分布情况的构成比分析。对于质谱未检出的菌株，选取38株进行16S rRNA基因测序。结果 血平板共获得分离株605株，将501株纳入分析，其中分枝杆菌属占17.76%(89/501)，以脓肿拟分枝杆菌10.18%(51/501)和偶发分枝菌酸杆形菌3.19%(16/501)为主,分枝杆菌以外的细菌占68.06%(341/501)，以皮疽诺卡菌15.57%(78/501)、痰液...     

天津市耐异烟肼或利福平的结核分枝杆菌相关基因突变特征

目前已知多个基因突变与MTB对异烟肼和利福平的耐药有关,但是不同的基因密码子突变率存在地区差异.为此,我们检测了天津市结核病患者异烟肼耐药株katG和inhA启动子以及利福平耐药株rpoB的突变情况,探讨其耐药相关基因的突变特征及基因突变与耐药表型的相关性.     

天津地区结核分枝杆菌可变串联重复序列多态性研究

目的:分析天津地区流行结核分枝杆菌(MTB)基因组中分布的可变串联重复序列(VNTR)拷贝数目多态性,探讨不同MTB菌株分辨能力强的VNTR基因分型方法.方法:根据VNTR位点PCR扩增产物片段长度分析临床分离的102株MTB菌基因组中22个VNTR位点中重复序列拷贝数目,使用Hunter-Gaston分辨指数(H)评估各个VNTB位点的多态性和VNTR基因分型方法对菌株的综合辨别能力.结果:13个VNTR位点对不同MTB菌株具有较强的分辨能力,其分辨指数达0.9963.其中QUB11b、11a、18、26,MIRU-26、31和Mtub21的多态性较好(H值为0.442～0.699);MIRU-10、27、39、40,QUB1895和ETR-A位点的多态性尚可(H值为0.203～0.316);而MIRU-2、4、16、20、23、24,QUB1451,ETR-B和C的多态性差(H值为0.000～0.150),其中MIRU-2、20、24和QUB1451在北京家族菌株中没有多态性(H=0).结论:选择多态性好的位点组合可以有效地区分不同的MTB北京家族菌株,建立起菌株分辨能力强的VNTR分型方法.     

二代线性探针技术在结核分枝杆菌耐药性检测中的价值

目的 评价二代线性探针技术(GenoType MTBDRplus VER 2.0,简称“GenoType 2.0”)快速检测结核分枝杆菌(MTB)临床分离株对异烟肼与利福平耐药性的临床应用价值。方法 收集2017年4月至2019年4月天津市结核病控制中心参比实验室中疑似肺结核患者的痰标本共6315份,纳入涂阳、培阳且经菌群鉴定为MTB的349 株菌株为研究对象,分别采用表型药物敏感性试验(简称“比例法药敏试验”)和GenoType 2.0检测菌株对利福平、异烟肼的耐药性;并以比例法药敏试验结果为参考标准,评价GenoType 2.0的检测效能。结果 GenoType 2.0、比例法药敏试验和GenoType 2.0+比例法药敏试验检测349株MTB菌株对利福平敏感、单耐、耐利福平+异烟肼菌株的检出率分别为86.53%(302/349)、87.97%(307/349)、86.25%(301/349),2.58%(9/349)、2.29%(8/349)、2.29%(8/349),10.89%(38/349)、9.74%(34/349)、11.46%(40/349),前者与后两者及后两者对敏感、单耐、耐利福平+异烟肼菌株检出率差异均无统计学意义(χ²=0.322,P=0.851;χ²=0.112,P=0.946;χ²=0.546,P=0.761);对异烟肼敏感、单耐、耐利福平+异烟肼菌株的检出率分别为79.94%(279/349)、80.23%(280/349)、79.65%(278/349),9.17%(32/349)、9.46%(33/349)、9.46%(33/349),10.89%(38/349)、10.32%(36/349)、10.89%(38/349),前者与后两者及后两者对敏感、单耐、耐利福平+异烟肼菌株检出率差异均无统计学意义(χ²=0.071,P=0.965;χ²=0.017,P=0.991;χ²=0.061,P=0.970)。以比例法药敏试验为参考标准,GenoType 2.0对利福平和异烟肼耐药性检测的敏感度、特异度、符合率、Kappa值分别为91.67%(44/48)和95.89%(70/73)、99.00%(298/301)和100.00%(276/276)、97.99%(342/349)和99.14%(346/349)、0.91和0.97。结论 GenoType 2.0对于利福平和异烟肼的耐药性检测具有较高的敏感度和特异度,加上其检测周期较短,可以满足临床对结核病早期诊断和及时治疗的需求。     

GenoType MTBDRplus VER 2.0试剂盒检测痰标本中结核分枝杆菌复合群的效果评价

目的评价GenoType? MTBDRplus VER 2.0试剂盒检测痰标本中结核分枝杆菌复合群(MTBC)的检测效能。方法对177例疑似肺结核患者的痰标本同时进行涂片,MGIT液体培养和GenoType? MTBDRplusVER 2.0检测。对培养阳性菌株进行菌种鉴定。使用SPSS 22.0统计软件对结果进行统计学分析,计数资料的一致性比较使用Kappa检验。K值≥0.75认为一致性很好。对MTBC检测的效能比较分析用敏感度、特异度进行效果评估。结果以MGIT液体培养结果为判断标准,GenoType? MTBDRplusVER 2.0检测痰标本中MTBC的敏感度为91.67%,特异度为95.58%,阳性预测值为91.67%,阴性预测值为95.58%,总符合率为94.22%。对两种方法进行一致性Kappa检验,K=0.872(P<0.001)。结论GenoType? MTBDRplus VER 2.0试剂盒检测痰标本中MTBC具有较高的敏感度和特异度,对于结核病的早期诊断有很好的应用价值。     

天津市监狱羁押人员中结核病患者临床分离菌株的基因型分析

为揭示结核分枝杆菌(MTB)北京基因型菌株中基于差异区域(RD)多态性形成的各个进化分支在天津监狱羁押人员中的流行情况,笔者收集2013年1月至2016年6月从天津市监狱羁押人员结核病患者痰标本中分离培养获得的124株MTB菌株进行基因型分析。结果发现,124株菌株中经鉴定为北京基因型者有116株(93.5%)。116株北京基因型菌株中,96株(82.8%)为北京基因型现代株,20株(17.2%)为北京基因型古代株。基于大片段多态性分析,北京基因型MTB分为4个进化分支。20株北京基因型古代株中有7株(6.0%)为RD181(+)菌株,13株(11.2%)为RD181(-)菌株;96株北京基因型现代株中,95株(81.9%)为RD150(+)菌株,仅1株(0.9%)为RD150(-)菌株。北京基因型MTB的各个进化分支中,RD150(+)北京基因型现代株在监狱中传播流行最为广泛。结果提示需加强RD150(+)北京基因型现代株在天津监狱羁押人员中流行的监测工作。     

基于全基因组测序的72株耐多药结核分枝杆菌耐药基因突变特征分析

目的 利用全基因组测序(whole genome sequencing, WGS)了解天津地区72株耐多药结核分枝杆菌(multidrug-resistant tuberculosis, MDR-TB)的耐药基因突变特征，评估WGS预测MDR-TB耐药性的效果。方法 收集2020年1—9月天津市结核病控制中心门诊部就诊患者的临床菌株，使用硝基苯甲酸(PNB)培养基进行菌种鉴定和固体比例法药敏试验。排除重复菌株后，筛选出72株MDR-TB进行WGS。使用在线数据库进行数据分析，对表型药敏结果与WGS预测的耐药谱进行比较。结果 72株MDR-TB基因型均为L2分支，准广泛耐药(pre-extensive drug-resistant tuberculosis, pre-XDR-TB)在现代株和古代株中的差异无统计学意义(χ²=0.287,P=0.592)。共发现与12种药物耐药相关基因的突变类型81种，对不同药物耐药的菌株中常见突变类型分别为链霉素：rpsL Lys43Arg；异烟肼：katG Ser315Thr；利福平：rpoB Ser450Leu；乙胺丁醇：emb...