广西结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药基因突变特征

目的 了解广西壮族自治区结核分枝杆菌乙胺丁醇(EMB)耐药基因突变特征及其影响因素，为结核病的分子诊断和临床治疗用药提供依据。方法 对2018-2019年广西30个结核病耐药监测点连续不间断收集的655株结核分枝杆菌(其中52株乙胺丁醇耐药菌株，603株乙胺丁醇敏感菌株)进行全基因组测序，分析乙胺丁醇耐药基因突变特征及其影响因素。结果 655株结核分枝杆菌中，54株发生乙胺丁醇耐药基因突变，突变率为8.24%(54/655)。在比例法检测EMB耐药的52株菌株中，21株发生基因突变，突变率为40.38%(21/52);603株EMB敏感株中，33株发生基因突变，突变率为5.47%(33/603)，耐药株中的基因突变率高于敏感株(χ²=77.133,P=0.000)。EMB耐药表型与基因突变的符合率为40.38%(21/52)，二者检测结果吻合度不高(Kappa值=0.343,P <0.001)。54株发生基因突变的菌株，突变基因为emb A、emb B和emb C，突变形式有20种，其中单位点突变29株，占53.70%(29/54)，联合位点突变25株，占4...     

广西地区结核分枝杆菌异烟肼耐药基因突变特征分析

目的 分析广西地区结核分枝杆菌异烟肼(INH)耐药基因的突变特征,为耐药结核病的分子诊断提供依据。方法 选取2018年广西30个结核病耐药监测点收集的结核分枝杆菌菌株库中122株耐INH菌株和530株全敏感菌株进行全基因组测序。结果 652株结核分枝杆菌复合群菌株中,127株(19.48%)发生INH耐药基因突变,分别为katG(15.64%,102株)、fabG1(1.69%,11株)、ahpC(1.07%,7株)、kasA(0.61%,4株)和inhA(0.46%,3株)基因突变。INH耐药表型与基因突变的符合率为90.03%,比例法药敏检测INH耐药与基因测序检测基因突变结果吻合度不高(Kappa=0.677)。突变类型共有19种,单位点突变占96.85%,联合位点突变占3.15%。突变比率最高的位点为katG315(71.65%),碱基变化以AGC-ACC形式占比最高(12.13%)。katG、ahpC和kasA基因突变比例在INH耐药株中高于敏感株(均P<0.05),INH耐药株和敏感株inhA、fabG1基因突变比例比较,差异均无统计学意义(均P>0.05)。北...     

广西壮族自治区结核分枝杆菌异烟肼与利福平耐药基因联合突变特征分析

  目的   了解广西壮族自治区（广西）结核分枝杆菌异烟肼与利福平耐药基因联合突变特征，为耐多药结核病的分子诊断和治疗提供依据。  方法   2017—2018年从广西30个结核病防治定点机构收集的结核分枝杆菌中选取49株耐多药菌株和459株全敏感菌株进行全基因组测序。  结果   耐多药表型与基因联合突变的符合率为71.43%。 单基因突变率和基因联合突变率在耐多药菌株中均高于全敏感菌株（χ2=5.753，P=0.016; χ2=284.034，P<0.001）。 katG和rpoB的单基因突变率在耐多药菌株中高于全敏感菌株（χ2=7.524，P=0.006; χ2=4.353，P=0.037）。 katG＋rpoB基因联合突变在耐多药菌株中高于全敏感菌株（χ2=279.956，P<0.001）。 在基因联合突变的位点分布中，以katG315＋rpoB450和katG315＋rpoB445位点突变为主，占40.82%（20/49），2种形式的基因位点联合突变率在耐多药菌株中均高于全敏感菌株（χ2=144.232，P<0.001; χ2=19.014，P<0.001）。  结论   对异烟肼和利福平耐药基因联合突变的检测可作为广西耐多药筛查的重要指标。 广西结核分枝杆菌异烟肼和利福平耐药基因突变以katG315、rpoB450和rpoB445位点突变为主，基因联合突变以katG＋rpoB形式为主。 katG315＋rpoB450和katG315＋rpoB445位点突变是广西地区耐多药产生的主要分子机制。     

广西壮族自治区结核分枝杆菌吡嗪酰胺耐药基因突变特征及影响因素分析

目的 了解广西壮族自治区(广西)结核分枝杆菌吡嗪酰胺耐药基因突变特征及其影响因素，为吡嗪酰胺耐药的分子诊断和临床治疗用药提供依据。方法 从2018年广西30个结核病耐药监测点收集的结核分枝杆菌中获取31株吡嗪酰胺耐药菌株和624株吡嗪酰胺敏感菌株进行全基因组测序，采用多因素logistic回归，分析吡嗪酰胺基因突变和耐药表型的相关因素。通过Kappa一致性检验，比较比例法药敏检测和基因测序检测结果的一致性。结果 655株结核分枝杆菌中22株发生了吡嗪酰胺耐药基因突变，为pnc A和pan D基因突变，其中pnc A基因突变21株，pan D基因突变1株。31株吡嗪酰胺表型耐药株中，6株发生基因突变，吡嗪酰胺耐药表型与基因突变的符合率为19.35%(6/31)，二者检测结果吻合度不高(Kappa=0.195)。吡嗪酰胺耐药株基因突变率(19.35%)高于吡嗪酰胺敏感株基因突变率(2.56%)，差异有统计学意义(χ²=25.651,P<0.01)。吡嗪酰胺耐药基因突变类型有16种，以单位点突变为主，占90.91%(20/22)。突变比例最高的位点为pnc A90...