珠海市2012～2013年登革病毒基因特征研究

目的:测定珠海市2012~2013年登革病毒的E基因序列,探讨其来源和基因型。方法:采集2012~2013年珠海登革热疑似病例的所急性期血清184份,采用荧光RT-PCR检测登革病毒核酸,取19份登革病毒核酸阳性标本扩增E基因并测序分型。结果:16例标本属于DVⅠ型,3例标本属于DVⅡ型。DVⅠ型同源性与2008年新加坡、越南等地DVⅠ型流行株接近,DVⅡ型同源性与2013年新加坡、马来西亚等地DVⅡ型流行株接近。结论:2012~2013年珠海市DV流行主要以Ⅰ型为主,近几年珠海市DV流行方式属于东南亚国家输入性病例引起的本地流行。     

珠海市2008年H1N1亚型流感病毒血凝素HA1基因特征分析

目的了解2008年珠海地区流行的H1N1亚型流感病毒血凝素重链区HA1基因特征。方法按照时间不同选取7株2008年珠海市分离到的H1N1亚型流感毒株,选取的毒株进行血凝素HA1片段序列测定并推导出其氨基酸序列进行基因进化特性分析。结果H1N1亚型流感毒株为珠海市2008年的优势株,与该年WHO推荐疫苗株比较有多个氨基酸发生了替换,造成抗原性发生一定的变化。结论2008年根据WHO疫苗推荐株生产的疫苗对该年珠海市H1N1亚型流感预防效果并不理想,导致2008年珠海市H1N1亚型的流行强度增加。     

2019年珠海市登革病毒传播影响因素分析

目的 根据2019年珠海市登革病毒(DENV)的流行病学数据统计分析、DENV包膜蛋白(E)基因序列测定、登革抗体水平回顾分析及蚊媒密度监测,分析珠海市登革病毒传播的影响因素.方法 收集2019年登革热流行病学资料开展统计学分析;采集登革热临床诊断病例的血清标本,提取RNA,用RT-PCR方法检测,阳性标本针对E基因测...     

2019年珠海市登革病毒流行情况及E基因演化分析

目的 通过对2019年珠海市登革热流行病学数据及及登革病毒包膜蛋白基因（E基因）序列进行分析,了解珠海市登革热流行规律和病毒遗传进化特点。方法 2019年珠海疾病预防控制中心采集登革热临床诊断病例的血液标本,对病例进行流行病学调查,磁珠法提取病毒核酸,用Real-time RT-PCR进行检测,阳性标本用RT-PCR扩增E基因并进行测序分型获得的基因序列,采用MEGA6.0软件进行系统进化分析。结果 共收集登革热临床诊断病例185例,实验室诊断病例99例,实验室诊断病例较2018年同期增长154%。其中输入性病例53例,本地感染病例46例,男性61例,女性38例,进入9月份本地感染病例增多,以散发状态为主,其中本地暴发疫情2起;75例成功测序,以DENV-1型为主,占88.00%,全部属于基因Ⅰ亚型,分布在3个不同分支上,分别与2017年越南、2015柬埔寨、2014年马来西亚、新加坡,2012、2014年斯里兰卡等流行株高度同源;DENV-2和DENV-3病例均为输入病例。结论 珠海市登革热主要由东南亚输入,极易发生输入性病例引起本地暴发流行,定期对流行的登革病毒进行序列分析有利于分析该病毒的基因进化方向。     

珠海市男男性行为人群HIV-1感染者原发性耐药基因突变分析

目的 研究珠海市男男性行为（MSM）人群中未经治疗的HIV-1感染者耐药突变发生和基因亚型分布。方法 采集2011—2016年珠海市386名未经治疗的MSM人群HIV-1抗体阳性血浆标本,提取病毒RNA,采用In-house方法扩增HIV-1 pol基因并进行测序,通过系统进化树和数据库分析基因亚型和耐药情况。结果 共得到309份样本的pol区序列。CRF07_BC（占48.87%,151/309）和CRF01_AE（占32.03%,99/309）重组亚型占主要地位,其次是CRF55_01B亚型（30/309,占9.71%）。原发性耐药率为1.29%（4/309）,传播性耐药（TDR）相关突变率为15.53%（48/309）,30例CRF55_01B亚型中有25例出现TDR相关突变,位点均在非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）的V179E。结论 珠海市MSM人群HIV-1基因亚型以CRF01_AE和CRF07_BC重组亚型为主,其他多种基因亚型共同流行;该人群HIV-1耐药率处于低度水平,应关注复杂的亚型组成、CRF55_01B亚型高占比及大部分携带V179E突变等特点,加强对该人群耐药株的监测。     

珠海市男男性行为人群HIV-1感染者基因突变分析

目的分析珠海市男男性行为(MSM)人群HIV-1流行亚型的分布与变化。方法收集珠海市2011年-2016年386例MSM人群HIV-1抗体阳性血清标本,提取病毒RNA,套式PCR对HIV-1 pol基因进行扩增、测序亚型序列分析。结果 CRF_07BC和CRF_01AE基因亚型占主要地位,分别为155例(占48.87%)和99例(占32.03%);其次是CRF55_01B亚型30例(占9.71%),同时也发现了B亚型11例(占3.56%)、CRF59_01B亚型10例(占3.24%)、CRF_08BC亚型3例(占0.97%)、CRF65_01B亚型3例(占0.97%)、CRF_01C亚型2例(占0.65%)。系统进化树显示CRF_07BC内部未见明显的分簇,CRF_01AE内部可分为两簇。结论珠海市MSM人群HIV-1基因亚型以CRF_01AE和CRF_07BC为主,其他多种基因型共同流行的现象,应加强该人群的干预和监测力度。     

两种菌种保藏方法对金黄色葡萄球菌抗力影响的研究

目的 研究菌种保藏管法和冷冻真空干燥保藏法中对金黄色葡萄球菌抗力的影响.方法 菌种分别用以下两种保存方法进行保存:冷冻真空干燥保藏法4℃保存和菌种保藏管法-80℃保存.测试速干手消毒液对不同菌种保藏方法的金黄色葡萄球菌的杀菌率.结果 随着保存时间延长,菌种保藏管法的金黄色葡萄球菌抗力下降明显,而冷冻真空干燥保藏法的金黄...     

2009年珠海市肠道病毒71型分子流行病学特征分析

目的分析2009年珠海市手足口病(HFMD)患者中,肠道病毒71型(HEV71)的分子流行病学特征。方法2009年1—10月采集珠海市各医院就诊的HFMD患者的粪便标本558份,经HEV71通用引物扩增分析,确定为HEV71阳性158份。选取其中HEV71阳性标本24份用RT-PCR扩增衣壳蛋白vp1全长基因,核苷酸序列测定并分析病毒遗传学特征。结果珠海市24例HEV71的vp1基因核苷酸序列的测定结果显示,所有核苷酸序列长度都是891bp,编码297个氨基酸。该24株HEV71全部属于C4基因亚型C4b进化分支,与C4基因型相比较核苷酸同源性在95.4%～98.9%之间,氨基酸同源性在99.3%～99.7%之间,与2008—2009年中国流行的HEV71同源性极高;但24株HEV71在vp1区的核苷酸和氨基酸同源性分别为95.2%～100.0%和99.0%～100.0%,在核苷酸和氨基酸水平上存在一定差异;24例HEV71可划分为7条传播链,75%(18/24)流行株分布在其中的2条传播链,且这2条主要传播链只由珠海市HEV71分离株构成。结论2009年珠海市流行的HEV71属于C4基因亚型C4b进化分支,与中国2008—2009年流行的HEV71在基因亲缘关系和流行时间关系上都很接近,但珠海市HEV71流行株的基因特征存在其特殊性。