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目的 评估全基因组测序技术在结核病分子流行病学调查中的应用。方法 对2008-2012年在上海市两家结核病定点医院发现9名耐多药患者中分离的结核分枝杆菌具有相同的可变数目串联重复序列,本研究对此进行流行学调查,并对9株结核分枝杆菌进行全基因组测序,分析其传播关系。结果 全基因组序列分析将9株结核分枝杆菌分为两个有传播关系的网络,一个为包括7株结核分枝杆菌(5例和2例患者分别来自不同的医院)的大簇,一个为只有2株结核分枝杆菌的小簇。两个簇之间相差15个单核苷酸多态性(SNP)位点,提示两个簇的遗传距离相对较远,基于菌株SNP差异构建的传播链显示了每个簇内菌株的传播方向和耐药突变积累的过程。结论 基于全基因组测序数据研究耐药结核病的传播网络,能准确判断传播路径和方向,识别传染源和传播缺失环节。 相似文献
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目的 分析肺结核患者治疗药品的使用和支出费用情况,为完善“减轻结核病患者经济负担”的政策提供依据。方法 纳入2014年12月1日至2015年12月31日于上海市松江区完成疗程且符合入组标准的248例肺结核患者,整理汇总全部患者治疗全疗程的收费票据,统计各类药品的使用及药费支出情况。药品支出及占比等非正态分布资料均以“中位数(四分位数)[M(Q1,Q3)]”描述,数据的比较采用Mann-Whitney U检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果 248例患者每例平均药品总费用为3719.0 (2483.4, 5634.9)元,其中用于抗结核药品、保肝药、其他辅助用药分别为16.8% (11.5%,24.0%)、62.1% (47.5%,74.6%)和23.0% (12.2%,40.7%)。除抗结核药品外,全部患者均使用过保肝药,其中241例(97.2%)在就诊1个月内使用,179例(72.2%)于就诊后每月规律服用,82例在治疗期间使用2种及以上保肝药。大部分患者间歇性使用其他辅助用药,其中中草药/中成药、抗生素和免疫调节剂的费用占比分别为14.8% (5.9%, 28.9%)、9.7% (5.3%, 17.2%)和8.6% (0.7%, 14.0%);使用上述药品的患者占比分别为58.1% (144/248)、40.3% (100/248)和27.0% (67/248)。市级定点医院每例平均药品总费用和其他辅助用药的费用分别为6392.7 (3371.5, 9769.0)元和2097.6 (789.0, 3828.0)元,明显高于区级定点医院的3424.1 (2362.0, 4796.1)元和889.2 (305.5, 1826.0)元(Z=-3.534, P<0.001;Z=-3.113, P=0.002)。结论 保肝药和其他辅助用药的费用占比均高于抗结核药品支出,无减免额度,是造成患者经济负担的主要原因;应规范保肝药与其他辅助用药的临床使用,减免相应的合理费用,切实减轻患者经济负担。 相似文献
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结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)作为引发结核病的主要病原体,其遗传多态性相对保守,随着二代全基因组测序技术的发展和普及,在不同宿主甚至同一宿主内都可观察到MTB菌株丰富的遗传异质性。宿主内异质性的成因包括不同菌株的多重(混合)感染和同一菌株的微进化。宿主内异质性的发生机制及其对MTB耐药、传播和诊疗等方面的影响及应用尚未完全清楚。本文综述了MTB宿主内遗传异质性的鉴定及相关研究进展,以期为结核病防控工作提供更多新思路。 相似文献
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目的 了解上海地区肺结核病患者氧氟沙星耐药的分布情况及可能的危险因素.方法 收集2009-2010年上海市各结核病定点医院的447株对任意一种一线抗结核药物(异烟肼、利福平、链霉素和乙胺丁醇)耐药的菌株,同期随机选取151株对上述4种一线抗结核药物全敏感菌株,对这598株结核分枝杆菌菌株进行氧氟沙星敏感性检测,分析氧氟沙星耐药的分布情况.收集肺结核患者的年龄、性别、抗结核治疗史和户籍资料,采用多因素分析研究氧氟沙星耐药可能的危险因素.用DNA测序分析氧氟沙星耐药菌株gyrA、gyrB基因耐药突变的特征.结果 447株耐药菌株中,72株(16.1%)对氧氟沙星耐药,MDR(至少同时对异烟肼、利福平耐药)结核分枝杆菌中氧氟沙星耐药44株(39.6%).在151株一线抗结核药物全敏感菌株中,4株(2.6%)耐氧氟沙星.多因素分析结果显示MDR和多耐药(对一种以上抗结核药物耐药,但不对异烟肼和利福平同时耐药)等与氧氟沙星耐药有关(OR分别为19.5、5.6,95% CI 分别为6.4~59.4、1.7~18.1,P均<0.05).患者为复治病例与氧氟沙星耐药相关(OR=2.3,95%CI:1.2~4.0,P<0.05).氧氟沙星耐药与年龄偏大有关(OR=1.03,95%CI:1.01~1.05,P<0.05).76株氧氟沙星耐药菌株的gyrA、gyrB基因序列分析显示62株(81.6%)发生耐药突变.结论 上海地区MDR结核病患者中氧氟沙星耐药率高于对一线抗结核药物全敏感的肺结核病患者.MDR、多耐药、复治、年龄为氧氟沙星耐药可能的危险因素,其中以MDR与氧氟沙星耐药的关联强度最大. 相似文献
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目的 应用全基因组测序技术解析耐多药结核分枝杆菌的传播路径。方法 对2009-2012年上海市一起经VNTR分型鉴定的耐多药结核病传播案例中8例簇病例进行全基因组测序,描述耐多药结核分枝杆菌的传播路径。结果 该起传播案例中源病例是1例复发耐多药结核病患者,在3年内传播耐药菌株导致另外至少7例患者发病。结论 全基因组测序技术可以弥补传统流行病学调查与基因分型技术的不足,准确地描述结核病传播的方向与细节,鉴定传染源与缺失病例,有助于准确揭示耐多药结核病的传播路径。 相似文献
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