NGS检测乙型肝炎病毒耐药基因突变情况及其临床意义

目的 检测乙型肝炎患者的HBV YMDD突变情况,探究下一代测序技术(next generation sequencing,NGS)检测HBV耐药基因突变的可行性及患者性别与其YMDD突变的相关性,并为临床用药提供参考. 方法 运用NGS测序技术对收集的100例临床样本进行HBV YMDD突变的检测,并与临床检测金标准Sanger测序法的测序结果进行比对. 结果 运用NGS检测100例HBV样本,其中YMDD野生型88例,HBV YMDD耐药基因突变12例,与Sanger测序法的测序结果完全相符.结论 本研究结果显示,NGS技术可用于HBV耐药基因突变检测,患者性别与HBV耐药突变无明显相关性.     

DA8600测序平台对EGFR基因检测最低DNA用量的探讨

目的 基于DA8600测序平台,探讨AmpliSeq建库方法检测EGFR基因突变所需最低样本DNA用量,以评估下一代测序(next generation sequencing,NGS)检测技术的性能. 方法 本研究选择10例EGFR突变的石蜡包埋组织样本,分别取1 ng、5 ng、10 ng、20 ng样本DNA进行文库构建,使用DA8600半导体测序仪进行检测,并比较检测结果. 结果 10 ng和20 ng DNA用量均可全部准确检出EGFR基因突变;5 ng DNA用量准确检出7例EGFR基因突变,1例文库质量不合格无法进行测序,1例无法检出EGFR突变,1例测序数据量不足检测失败;1 ng DNA用量构建文库全部质量不合格,无法进行测序. 结论 通过对10例样本不同DNA用量构建文库的检测结果分析,说明10 ng DNA即可采用AmpliSeq建库方法在DA8600半导体测序仪进行EGFR基因突变检测.     

核桃楸皮化学成分的鉴定及其抗肝癌活性成分筛选

目的：鉴定核桃楸皮的化学成分,并对其进行体外抗肝癌活性成分筛选。方法采用75％乙醇回流法提取核桃楸皮,经分级萃取、硅胶柱层析及制备型高效液相色谱分析等方法得到单体化合物,通过化合物的理化性质及核磁共振技术鉴定化合物成分;采用MTT法评价其体外抗肝癌活性。结果从核桃楸皮中分离得到2种黄酮类化合物,经鉴定分别为木犀草素和刺芒柄花素。 MTT检测结果表明,木犀草素对肝癌细胞HepG2和正常肝细胞LO2都有一定的毒性作用,IC50分别为（103．32±21．34）、（131．13±13．48）μmol/L;刺芒柄花素对肝癌细胞HepG2的毒性作用较小,其IC50＞200μmol/L。结论核桃楸皮含2种黄酮类化合物：木犀草素和刺芒柄花素,其中木犀草素具有明显的抗肝癌作用。