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目的 观察增强动脉期CT影像组学特征联合临床术前预测胃癌脉管浸润(LVI)的价值。方法 回顾性纳入298例胃癌患者,根据是否伴LVI将其分为阳性组(n=155)及阴性组(n=143),并按7 ∶ 3比例分为训练集(n=208)及测试集(n=90)。基于增强动脉期CT图提取病灶影像组学特征,采用logistic回归分析筛选胃癌LVI的临床影响因素;分别采用支持向量机(SVM)、逻辑回归(LR)、随机森林(RF)及极端梯度提升树(XGBoost)建立影像组学模型、临床模型及临床-影像组学模型,评估各模型预测胃癌LVI的效能。结果 以SVM、LR、RF及XGBoost建立的影像组学模型预测训练集胃癌LVI的曲线下面积(AUC)分别为0.896、0.821、1.000及1.000,其在测试集的AUC分别为0.744、0.801、0.740及0.747。基于4种机器学习建立的临床模型在训练集的AUC均为0.810,在测试集均为0.840。基于SVM、LR、RF及XGBoost建立的临床-影像组学模型预测训练集胃癌LVI的AUC分别为0.920、0.900、1.000及1.000,其在测试集的AUC分别为0.900、0.890、0.840及0.790。测试集中,基于SVM、LR及RF的临床-影像组学模型的AUC均大于影像组学模型和临床模型(P均＜0.05)。结论 增强动脉期CT影像组学联合临床有助于术前预测胃癌LVI。 相似文献
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目的本研究旨在探讨胃癌中CCAAT/增强子结合蛋白β(CEBPB)的潜在预后价值。方法从肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因表达数据库(GEO)数据集中下载CEBPB相关表达谱和相关临床数据, 验证CEBPB在胃癌细胞系中的表达。采用基因集富集分析(GSEA)方法鉴定胃癌中CEBPB相关通路, 并通过统计学分析评估胃癌中CEBPB表达与临床特征的相关性。通过细胞增殖实验(CCK-8)法、细胞划痕实验和菌落形成实验探讨CEBPB在胃癌中的具体功能。结果 CEBPB在胃癌组织中表达显著高于非肿瘤组织(2 870.0±4 485.0比908.1±957.6, t=6.264, P<0.05), 并且CEBPB在胃癌细胞系AGS, MKN-45, HGC-27中表达高于GES-1。此外, CEBPB高表达患者组平均总生存期(OS)显著低于低表达患者组;CEBPB高表达患者组平均首次进展期(FP)低于低表达组。GSEA发现与CEBPB与多种肿瘤进展相关信号通路及生物学过程有关(PID SMAD2 3NUCLEAR通路、凋亡负调控信号通路、VEGFA-VEGFR2信号通路、IL-4信号通路、RN... 相似文献
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目的通过机器学习结合生物信息学方法分析胃黏液分泌性腺癌(GMA)的特征基因及特征通路, 探索GMA的诊断标志物及其与免疫细胞浸润的关联。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载胃癌(GC)测序数据, 以P<0.05为标准筛选99例GMA与311例胃普通型腺癌(GTA)样本差异表达基因(DEGs)。通过功能富集方法分析GMA特征通路和功能途径, 进一步通过机器学习算法, 使用套索回归(LASSO)结合支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)获取23个特征基因, 并通过绘制受试者工作特征曲线(ROC)分析DEGs的诊断效能, 及其与免疫细胞浸润的相关性。在基因表达谱数据库(GEO)数据集GSE113255中对DEGs的表达和诊断效能进行验证。结果在TCGA数据库中检测到1 769个DEGs (P<0.05), 其中759个在GMA中上调, 而1 010个在GTA中上调。这些基因与磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、细胞黏附、细胞外基质、细胞骨架调节等途径显著相关(P<0.01)。GMA组中CMTM8(11.416比17.845, P<0.... 相似文献
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