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目的探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用。方法采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等位基因编号及基因序列型(ST型),并利用MEGA6.0软件Neighbor-joining法构建遗传进化树,与大肠埃希菌、志贺氏菌、艾伯特埃希菌和伤寒沙门氏菌参考菌株进行亲缘性分析。结果30株菌可分为7种新序列型(16株)和4种已知序列型(14株),N-J分析显示与艾伯特埃希菌参考菌株具有高度亲缘性,而与大肠埃希菌、志贺氏菌、弗格森埃希菌和鼠伤寒沙门氏菌存在较大差异。结论MLST在管家基因水平上准确地确定艾伯特埃希菌的种属关系,首次在国内发现艾伯特埃希菌的存在。 相似文献
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目的 通过16S rRNA基因序列分析快速鉴定艾伯特埃希菌。方法 以30株疑似艾伯特埃希菌为材料,使用通用引物扩增其16S rRNA基因并进行测序。获得的序列与艾伯特埃希菌型菌株LMG 20976,基因组测序菌株KF1、NBRC107761、TW07627以及其他密切相关的细菌种(大肠埃希菌、赫曼埃希菌、费格森埃希菌、志贺菌和Shimwellia blattae)的16S rRNA基因序列进行比较,并使用N-J法构建进化树来分析其相关性。结果 30株疑似艾伯特埃希菌的16S rRNA基因序列与艾伯特埃希菌参考菌株的序列相似性最高,并与其聚类为一簇,为艾伯特埃希菌。结论 16S rRNA基因测序分析可用于艾伯特埃希菌的快速鉴定。 相似文献
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目的 回顾性分析自贡市2007-2010年分离到的沙门菌菌株,评估分子分型技术在食源性传染病暴发识别和处置中的价值。 方法 对自贡市2007-2010年从食品和腹泻患者中分离的沙门菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)实验,用 BioNumerics软件分析菌株之间的相似度。 结果 55株沙门菌中,来源于2007-2008年的10个腹泻患者粪便和2008年的15个皮蛋中的25株鼠伤寒沙门菌菌株PFGE带型相似度为100%,均为P9带型。 结论 感染鼠伤寒沙门菌的皮蛋是导致自贡市2007-2008年10名患者腹泻暴发的污染源,为快速准确识别食源性疾病暴发并及时溯源、控制,应在食品安全监测中普及PFGE等分子分型技术。 相似文献
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目的探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用。方法采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等位基因编号及基因序列型(ST型),并利用MEGA6.0软件Neighbor-joining法构建遗传进化树,与大肠埃希菌、志贺氏菌、艾伯特埃希菌和伤寒沙门氏菌参考菌株进行亲缘性分析。结果 30株菌可分为7种新序列型(16株)和4种已知序列型(14株),N-J分析显示与艾伯特埃希菌参考菌株具有高度亲缘性,而与大肠埃希菌、志贺氏菌、弗格森埃希菌和鼠伤寒沙门氏菌存在较大差异。结论 MLST在管家基因水平上准确地确定艾伯特埃希菌的种属关系,首次在国内发现艾伯特埃希菌的存在。 相似文献
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目的 探索自贡市农贸市场食品中单核细胞增生性李斯特菌(单增李斯特菌,Listeria monocytogenes, L. monocytogenes)的污染状况。方法 2014年12月采集四川自贡市农贸市场的各类食品样品,分离单增李斯特菌,采用血清分型,多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)对分离的单增李斯特菌进行分子分型,并用脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)研究菌株之间的同源性。结果 从农贸市场626份各类食品中检出单增李斯特菌48株(阳性率7.67%),牛羊肉样品的菌株分离率(37.50%)最高。菌株分为 3种血清型:1/2a(17株,占35.41%)、1/2b(22株,占45.83%)、1/2c(9株,占18.75%)。9种ST型,以ST87型(13株,占27.08%)、ST8型(12株,占25.00%)、ST9型(9株,占18.75%)为主;PFGE分为21 种PT型,9个PFGE带型的菌株来自不同种类的食品。结论 自贡市各类食品中单增李斯特菌污染情况广泛存在,不同食品存在交叉污染,食品监督部门应加强市场卫生情况的监管。 相似文献
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目的对食物中毒事件中所采集样本进行副溶血性弧菌的分离鉴定,快速查明食物中毒原因并进行同源性分析。方法采用现行标准检验方法及实时荧光定量PCR对样本进行副溶血性弧菌分离鉴定;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对分离到的副溶血性弧菌进行分子分型。结果运用标准检验方法在22份食物样本中分离到副溶血性弧菌1株,7份粪便样本中分离到5株;实时荧光定量PCR在食物样本中检出核酸阳性1份,粪便样本中检出6份;所分离到的6株副溶血性弧菌经PFGE聚类分析得到4种PFGE带型,指纹图谱相似度为93.48%~97.44%。结论此次食物中毒由同一克隆副溶血性弧菌污染所致,PFGE可有效用于食物中毒的分型研究及溯源分析,实时荧光PCR可作为现行标准检验方法的有效补充。 相似文献
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目的 探究45~47℃温热水刺激下被动等待鼻肠管留置技术在超声引导置管困难患者中的应用效果。方法 纳入2020年4月1日-2021年3月31日入住青岛市某三级甲等医院重症医学科需留置鼻肠管,且在超声引导下置管困难的48名患者为研究对象,采用温热水刺激下被动等待鼻肠管留置技术进行鼻肠管留置。结果 纳入研究的48名患者中,40名患者采用温热水刺激下被动等待鼻肠管留置技术一次置管成功,占比83.33%;置管失败的8名患者中,7名患者在病情允许的情况下采用床旁胃镜下置管或X线下置管成功,1名患者采用肠外营养联合少量经胃管实施肠内营养进行营养支持。结论 针对鼻肠管置管困难的危重患者,本方法采用改良式被动等待技术同时利用45~47℃温热水刺激胃肠蠕动可保证鼻肠管留置成功率,尽早实施早期肠内营养,操作简便,可以为危重患者早期肠内营养提供可靠途径,值得临床推广。 相似文献
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