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目的 应用网络药理学和分子对接技术探讨中药外敷1号(TCM-EAN1)对于唇炎的相关作用机制。方法 在TCMSP数据库中获取TCM-EAN1的活性成分和潜在靶点,疾病靶点利用DisGeNet和GeneCards获取,采用Venny取疾病-药物的交集,采用String数据库构建蛋白互作网络,采用Cytoscape软件构建疾病-靶点-中药有效成分-药物网络,应用David数据库将TCM-EAN1进行GO和KEGG富集分析,应用AutoDock对TCM-EAN1的活性成分和关键治疗唇炎靶点进行分子对接验证。结果 TCM-EAN1与唇炎的相关作用靶点共35个,蛋白相互作用(PPI)结果显示核心靶点分别是TP53、TNF、HIF1A、BCL-2、RXRA、EGFR、IL-6、PTGS2、CDKN1A,通过网络构建核心有效成分分别为槲皮素、汉黄芩素、木犀草素、山柰酚、β-谷甾醇、白鲜明碱、前茵芋碱、豆甾醇和苦参素。GO分析共获得429条生物过程,主要有:基因表达的正向调控、凋亡过程的负调控、转录的正调控、炎症反应、细胞外空间、细胞因子活性、生长因子活性等,KEGG共获得107条通路,主要与IL-1... 相似文献
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目的:通过高通量测序筛选口腔扁平苔藓(oral lichen planus, OLP)患者和正常人口腔黏膜组织中差异表达的微小RNA(miRNAs),探讨miRNAs在OLP发病机制中的作用。方法:收集3例就诊于河北医科大学第四医院口腔科的OLP患者病变组织(P组)和3例正常口腔黏膜组织(N组),进行illumina高通量测序,筛选差异表达的miRNAs,利用生物信息学分析对差异最显著的6个miRNA进行靶基因预测和功能富集分析。结果:应用DESeq软件,筛选出两组间差异表达的miRNAs共61个(|log2FoldChange|> 1,P<0.05),其中表达上调的23个,下调的38个。选择上调(miR-449c-5p、miR-663b和miR-196a-5p)和下调(miR-133b、miR-1-3p和miR-133a-3p)最显著的miRNA各3个进行靶基因预测,GO分析显示这些靶基因主要富集在细胞膜区域,可能参与了细胞迁移、分化、代谢和分泌调节等生物过程,KEGG分析显示这些靶基因显著富集在MAPK、Rap1、NF-κB、Ras等信号通路上。结论:OLP和正常口腔黏... 相似文献
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目的 探讨口腔扁平苔藓临床病理特征与COX-2、Ki67的相关性。方法 选取79例口腔扁平苔藓组织样本,其中包括17例糜烂型口腔扁平苔藓(EOLP)以及62例非糜烂型口腔扁平苔藓(NEOLP),31例口腔鳞状细胞癌组织(oral squamous cell carcinoma,OSCC)以及作为阴性对照的18例正常口腔黏膜组织(normal oral mucosa,NOM)。采用组织芯片技术进行实验,并对制作的切片检测COX-2、Ki67的表达。结果 NOM与NEOLP的COX-2、Ki67的表达无统计学差异(P> 0.05),EOLP中COX-2、Ki67的表达均高于NEOLP且有统计学意义(P<0.05),但低于OSCC中的表达(P <0.05)。Spearman分析显示,COX-2、Ki67的阳性表达具有相关性(P <0.01)。在OLP中,COX-2、Ki67的表达与该病患者的性别、年龄以及OLP的发病部位在统计学上没有差异(P> 0.05),但在糜烂组与非糜烂组之间存在明显差异(P<0.05)。结论 在NOM、NEOLP、EOLP、OSCC... 相似文献
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目的:通过网络药理学方法研究青蒿治疗系统性红斑狼疮(SLE)的潜在作用机制.方法:通过中国传统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选青蒿的有效活性成分和作用靶点,运用Uniprot数据库将药物靶点进行基因名字标准化处理,在GeneCards、OMIM数据库中检索SLE相关靶点,使用R软件绘制Venny图找出青蒿与SLE共同作用靶点,String数据库构建蛋白质互作(PPI)网络,Cytoscape软件中进行PPI网络可视化,构建"药物-活性成分-潜在靶点-疾病"网络,并筛选出核心基因,对共同作用靶基因进行GO、KEGG富集分析.结果:筛选得到青蒿的有效活性成分22个,111个青蒿有效成分与SLE共同作用靶基因,30个核心基因.GO功能富集显示青蒿治疗SLE生物学过程和功能主要集中在细胞因子受体结合、细胞因子活性、核受体活性、转录因子活性、受体配体活性、类固醇激素受体等.KEGG通路富集显示,青蒿治疗SLE主要涉及TNF、IL-17、Toll样受体、Th17细胞分化等信号通路.结论:通过构建"药物-活性成分-潜在靶点-疾病"网络,阐释了青蒿多成分、多靶点、多条通路治疗SLE的作用机制,为深入研究青蒿治疗SLE的机制提供一定参考意义. 相似文献
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