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目的 对天津市1例输入基孔肯雅热病例开展病毒基因分型,确定基孔肯雅病毒(CHIKV)与全球主要流行株的关系。方法 提取临床症状疑似为CHIKV感染患者血清中RNA,采用荧光定量RT-PCR法检测CHIKV核酸。两步RT-PCR法扩增编码CHIKV包膜糖蛋白E1的基因,扩增产物经测序后开展测序分析。将测序结果与全球其他地区流行毒株一同构建系统发生树。结果 天津市输入型CHIKV基因分型属于能够感染白纹伊蚊并在其体内繁殖的东/中/南非基因型印度洋亚型(ECSA-IOL)。系统发生树分析表明,此次输入的CHIKV与2016-2017年在巴基斯坦、意大利、孟加拉国等国家流行的CHIKV毒株高度同源,序列的同源性高达99.4%,并与这些国家流行的CHIKV毒株共同组成1个基因分型簇。结论 此次输入性基孔肯雅热病例感染的毒株更容易在人群中传播,提示应加强对基孔肯雅热输入性病例的防控工作,以防止该蚊媒传染病在我国发生本地聚集性传播。 相似文献
2.
目的 鉴定天津市手足口病病原体柯萨奇病毒A组2、4、5、6和10型,并分析其VP1区基因及分子流行病学特征.方法 提取45株非EV71非CV-A16肠道病毒分离株核酸,利用RT-PCR法扩增其VP1基因并测序,然后根据VP1区基因核酸序列,进行肠道病毒型别鉴定和同源性分析,构建种系发生树.结果 45株非EV71非CV-A16肠道病毒天津分离株分别为6株柯萨奇病毒A组2型(Coxsackie virus A2,CV-A2),14株CV-A4,3株CV-A5,8株CV-A6和14株CV-A10.柯萨奇病毒各型的株间核酸序列同源性均在80%以上,各型分离株与原型株的同源性均在71.2% ~ 85.8%之间.天津各型分离株在种系发生树上均聚集于各自相对独立的分支,与国内流行株处在同一分支内,而与国外原型株处于不同的进化分支.结论柯萨奇病毒A组2、4、5、6和10型成为天津市手足口病的流行病原体,各型天津分离株株间核酸序列同源性较高,呈现一定的区域聚集性. 相似文献
3.
目的构建汉坦病毒SEO型代表株L99G2蛋白的多表位抗原基因(mea)。方法通过生物信息学软件对L99株G2蛋白氨基酸序列进行综合分析及预测,优选B细胞表位,引入GPG间隔序列串联表位,设计mea,然后应用重叠PCR法构建mea,并将其克隆到原核表达质粒pET32a(+)。结果优选出5个B细胞表位,设计并成功构建mea,PCR定向克隆获得pET32a-mea重组表达质粒。结论首次构建了汉坦病毒G2糖蛋白mea及其原核表达系统E.coliBL21/pET32a-mea,为其表达及免疫学应用奠定基础。 相似文献
4.
目的 对截至2020年2月18日涉及天津市某百货大楼关联确诊新型冠状病毒肺炎病例流行病学特征进行描述性分析,为制定防控策略提供参考。方法 对某百货大楼关联病例进行分析,包括病例特征、时间地区分布、临床表现、流行病学史及传播情况等。结果 某百货大楼关联病例40例,占辖区确诊病例数(53例)的75.47%,发病主要分布在 ≥ 60岁(35.00%);职业以农民为主(40.00%);临床表现主要为发热(95.00%),其次为咳嗽(35.00%),存在腹泻(15.00%),确诊重型比例为32.50%;流行曲线显示发病高峰出现在1月31日。聚集性疫情中涉及一代病例百货大楼员工6例(15.00%)、顾客19例(47.50%),二代密切接触续发病例15例(37.50%);最早发病员工1月21日发病,潜伏期内有外省市批发市场进货史,有3名员工发病后在岗工作;顾客发病潜伏期平均为6 d,发病就诊间隔7 d。结论 此次宝坻百货大楼关联病例为一起新型冠状病毒肺炎聚集性疫情,目前采取防控措施后已取得阶段性效果。 相似文献
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目的调查天津市部分地区蚊虫携带流行性乙型脑炎(乙脑)病毒状况,为乙脑防治提供依据。方法 2010年7-9月,使用灯诱法,每月在天津市5个区(县)采集蚊虫2次,用RTPCR检测乙脑病毒核酸;扩增的目标片段进行序列测定;用Mega 4.0软件以邻位相连法构建进化树。结果共捕获成蚊10285只,2属3种(淡色库蚊、三带喙库蚊、中华按蚊),一组淡色库蚊样品,经分子生物学鉴定呈乙脑病毒感染阳性,命名为TJ01(HQ718463),基因分型为Ⅰ型乙脑病毒。结论天津市蚊虫中存在基因Ⅰ型乙脑病毒感染,与上海市乙脑病毒分离株进化关系较近。 相似文献
6.
目的 对天津市2010年的手足口病(HFMD)病例进行病原学分析,并对引起该市HFMD流行的肠道EV71型和柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)进行分子生物学特征分析。 方法 利用Real-time PCR检测HFMD病例标本,用人横纹肌肉瘤(RD)细胞对Real-time PCR检测阳性的部分病例标本进行病毒分离,用RT-PCR法扩增VP1全基因,使用生物学软件进行序列和系统发生分析。 结果 共检测HFMD病例1766例,肠道病毒总检测阳性率为71.52%(1263/1766),其中EV71占43.94%,Cox A16占41.65%,其他EV占14.41%。15株EV71分离株与C4亚型的C4a分支代表株具有最高的核苷酸序列同源性,均归属于C4a分支;9株Cox A16分离株与B1亚型的代表株具有最高的核苷酸序列同源性,其中8株属于B1b分支,1株属于B1a分支。 结论 导致天津市2010年HFMD流行的EV71流行株为C4亚型中的C4a病毒株,Cox A16流行株为B1亚型的B1b病毒株。 相似文献
7.
目的:分析天津市1例输入性基孔肯亚病毒(CHIKV)的全基因组序列特征与进化,为CHIKV的监测与防控提供科学依据。方法:收集2019年11月4日于天津市第二人民医院采集的血清标本200 μl提取核酸,设计叠瓦式引物扩增CHIKV基因组全长,然后利用Illumina Miniseq平台进行高通量测序。结果:本研究的CH... 相似文献
8.
摘要:目的 探讨实验室确诊病毒性脑炎的流行特征及经济负担,为做好监测、防控和治疗提供理论依据。
方法 2015年,天津市哨点医院就诊的病毒性脑炎患者进行流行病学调查,采集血清和/或脑脊液样本,
采用RT PCR 和/或ELISA 方法进行病原学检测,对实验室确诊的病毒性脑炎开展经济负担调查。结果
2015年,天津市实验室确诊的病毒性脑炎患者44例,其中肠道病毒阳性23例(52.27%),单纯疱疹病毒
阳性12例(27.27%),腮腺炎病毒阳性7例(15.91%),巨细胞病毒阳性2例(4.55%)。<10岁患者最
多,19例(43.18%),20~岁组14例(31.82%)。学生患者数最多13例(29.55%),其中单纯疱疹病毒
阳性5例(38.46%),腮腺炎病毒阳性4 例(30.77%)。全年均有发病,5~9 月监测32 例, 占全年的
72.73%。不同年龄组人群中住院时间(犉=6.25,犘=0.0015);住院费用(犉=4.03,犘=0.0139) 和间
接费用(犉=2.91,犘=0.047)差异均有统计学意义。结论 天津市病毒性脑炎主要的病原体是肠道病毒,
其次是单独疱疹病毒和腮腺炎病毒。病毒性脑炎造成的经济负担较重,应加强病毒性脑炎的监测,做到早
诊断、早治疗。
关键词:病毒性脑炎;实验室确诊;病原;经济负担;监测;流行病学调查
中图分类号:R512.3 文献标识码:A 文章编号:1009 6639 (2017)10 0765 05 相似文献
9.
目的建立一种用于检测肾综合征出血热(HFRS)特异性抗体IgG的ELISA方法—免疫磁性微球(IMMS)ELISA。方法利用重组菌株E.coli BL21(DE3)/pET32a-L99S诱导表达SEO型汉坦病毒(HV)重组核蛋白(rNP),并进行镍亲和层析纯化,以纯化rNP为抗原,分别建立检测HFRS特异性抗体IgG的3种ELISA法:间接ELISA、捕获ELISA和IMMS-ELISA,并进行方法学比较。结果新建立的3种ELISA的检测灵敏度和特异度为≥90%,总符合率≥95%。其中间接ELISA的灵敏度达100%,而假阳性率为10%;捕获ELISA特异度达100%,灵敏度较低(92.5%),且假阴性率为7.5%;IMMS-ELISA的灵敏度和特异度均达到100%。结论 IMMS-ELISA较其他2种ELISA检测方法更为简单、安全和准确,易于在基层公共卫生和临床医疗机构推广使用。 相似文献
10.
目的 调查天津市健康人群肠道病毒71型(EV71)隐性感染状况.方法 采集1611名天津市健康人静脉血标本进行EV71中和抗体测定,对检测结果进行分析.结果 以抗体滴度1:4作为临界值,调查对象EV71中和抗体阳性率为66 79%(1076/1611),0~5岁年龄组的抗体阳性率最低为32 71%,16~25岁年龄组的抗体阳性率最高为76.67%,不同年龄组的抗体阳性率差异有统计学意义.市内六区EV71的抗体阳性率最低为59.05%,远郊五县的抗体阳性率最高为72 35%;不同区域间的抗体阳性率差异有统计学意义.EV71抗体滴度≥1:256的人数占5.71%.经logistic回归分析,年龄、流动人口数量和区域都是影响EV71抗体阳性率的因素.结论 年龄的增长增加了EV71隐性感染的机会,但抗体水平不可能持久保持;流动人口较多、卫生条件差的地区应作为手足口病防控的重点.Abstract: Objective To investigate the latent infection caused by enterovirus 71 (EV71) among healthy people in Tianjin and to provide evidence on prevention and control hand-food and mouth diseases (HFMD). Methods 1611 sera specimens were collected from healthy people in Tianjin while EV71 antibody was detected by neutralization test, and then the results were analyzed statistically. Results For determining positivity, the cut-point was set at 1:4. The positive rate was 66.79%( 1076/1611) for EV71 neutralizing antibody. The lowest positive rate was 32.71% in the 0-5 age group while the highest rate was 76.67% in the 16-25 age group. Significant difference was seen in the positive rates among different age groups. The lowest positive rate (59.05%) was seen in the city areas while the highest rate (72.35%) was seen in the surrounding counties. 5.71% of the people being tested showed their neutralizing antibody as ≥1:256. The difference was statistically significant on positive rates among different areas. We constructed logistic regression models with the EV71 neutralizing antibody positive rate as the dependent variable and age, sex, floating population, area etc. as independent variables. There appeared statistical significances in all the independent variables. Conclusion Age seemed a risk factor for recessive infection of EV71, and the neutralizing antibody against EV71 might not be kept permanently. In order to prevent and control the HFMD, more attention should be paid to the areas where more floating population were resided. 相似文献