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宏基因组学利用新一代高通量测序技术, 以特定环境下病原体基因组为研究对象, 在分析病原体多样性、种群结构、进化关系的基础上, 进一步探究病原体的群体功能活性、相互作用及其与环境之间的关系, 发掘潜在的生物学意义。目前, 绝大部分的宏基因组学研究都集中在临床价值评价, 宏基因组检测临床应用前分析性能确认的研究相对空白, 北京协和医院检验科研究团队结合多年病原宏基因组检测的经验和国内外相关研究成果, 就病原宏基因组项目医院本地化开展前的性能确认工作, 从临床预期用途、方法学建立、性能确认、标准操作作业书4个方面提出了具体的实施方案, 具体包含:标本类型和病原体范围、生物信息流程建立、生物信息分析参考盘制备和评估、湿实验流程的建立、背景核酸数据模型的建立、参考盘制备和全流程的性能确认等。 相似文献
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目的分析xTAG脑脊液病毒多重检测试剂盒(cerebral spinal fluid viral panels,xTAG CSFVP)对成人疑似病毒性脑炎、脑膜炎病原体检测结果。方法收集2014年10月~2016年9月就诊于北京协和医院的115例疑似病毒性脑炎或脑膜炎的成人患者脑脊液标本115例,使用xTAG CSFVP进行检测并对结果进行分析。结果 115例脑脊液标本中,有28例检测出病毒,阳性率为24.3%,其中单纯疱疹病毒1型的检出率最高(7.8%),水痘-带状疱疹病毒和EB病毒检出率次之(均为6.1%)。共检出病毒30例,其中单一感染占92.86%(26/28),混合感染占7.14%(2/28)。xTAG CSFVP阳性和阴性患者的临床症状和脑脊液生化指标差异无统计学意义(均P0.05)。结论成人病毒性脑炎脑膜炎患者xTAG脑脊液病毒检出率最多的病原体为单纯疱疹病毒1型,水痘-带状病毒和EB病毒,检出2例混合感染。 相似文献
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目的:评价采用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)方法检测人类白细胞抗原B位点5801(HLA-B*5801)等位基因的重复性、准确性和最低检出限。方法:选取HLA-B*5801阳性和阴性样本各2例,每一样本每批内测定5次,连续测定2 d,共重复测定10次,评价方法的重复性。收集20例已知阳性和阴性样本,实时荧光定量PCR方法进行检测,同时与金标准DNA测序法的结果进行比对,评价方法的准确性。同时进一步选取其中1例阳性DNA样本进行梯度稀释后再行检测,评价方法的最低检出限。结果:4例样本重复性检测阳性和阴性符合率为100%;实时荧光定量PCR法与DNA测序法检测结果符合率为100%,收集的20例已知阳性和阴性样本中HLA-B*5801阳性8例,阴性12例;实时荧光定量PCR的最低检出限为2.5 ng/μl DNA。结论:实时荧光定量PCR可方便、快捷地检测HLA-B*5801等位基因,其准确度高,重复性好,适用于临床常规样本的检测。 相似文献
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2013年4—5月,北京协和医院诊治2例人副流感病毒(human parainfluenza virus,HPIV)感染引起的重症肺炎患者,报道如下。 相似文献
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年龄相关性黄斑变性(Age-relatedmacalardegeneration,ARMD),又名老年性黄斑变性(Senilemaculardegeneration,SMD),是目前致盲主要的眼病之一。属于中医"视瞻昏渺""暴盲"的范畴。黄斑部脉络膜新生血管膜(CNV)的形成,是致盲的根本原因。目前西医尚无确切有效的方法治疗,也无有效的预防措施,目前西医治疗ARMD均集中于CNV的抑制或消退。CNV所表现的出血、渗出、水肿等引起的瘢痕形成是致盲的最重要因素。目前光动力疗法(PDT)治疗CNV性疾病在临床也取得一定疗效,但依旧无法从本质上阻止CNV的发生,无远期治疗效果。近年来CNV性疾病得到越来越多的重视,随着新的中西医治疗方法逐步出现,中医在其治疗上的优势也得以渐渐体现。本文将主要论述老年性黄斑变性的研究现状及其展望。 相似文献
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目的 研究儿童社区获得性肺炎(CAP)的常见呼吸道病原体分布,并为儿童CAP的合理用药治疗提供参考依据.方法 收集2011年1月—2012年12月医院的387例住院CAP儿童病例,年龄1月龄~14岁,采集血液、痰液和咽拭子进行细菌培养,同时用直接免疫荧光法检测病毒;应用酶联免疫法测定肺炎支原体、衣原体属或病毒.结果 在387例患儿中病原体感染有312例,其中157例存在混合感染,占40.57%;不同患儿年龄段的病原体分析结果显示,细菌和病毒感染患儿的年龄显著低于非典型病原体感染的患儿年龄(P=0.010).结论 细菌、病毒及非典型病原体均是儿童CAP的常见病原体,大量的混合感染显著增加了儿童CAP病因判断及临床经验用药的难度. 相似文献
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目的 比较应用自动粪便前处理系统(简称为仪器法)和手工法对轮状病毒(RV)和腺病毒(AdV)抗原检测的结果。方法 收集2014年9月~10月在北京协和医院肠道门诊就诊的腹泻患者粪便标本100份,分别用仪器法和手工法对粪便进行处理后,检测RV和AdV抗原,并用液相芯片法对阳性标本进行核酸检测验证结果。结果 仪器法检测对RV,AdV及二者共同感染的抗原阳性率分别是17.0%(17/100),25.0%(25/100)和12.0%(12/100),手工法的抗原阳性率分别是4.0%(4/100),13.0%(13/100)和2.0%(2/100)。以核酸检测结果为金标准,仪器法检测RV,AdV及二者共同感染的假阳性率分别是23.5%(4/17),20.0%(5/25)和33.3%(4/12),手工法的假阳性率分别是75.0%(3/4),69.2%(9/13)和50.0%(1/2)。采用配对资料的检验进行χ2统计分析,两种方法检测RV和AdV总阳性率,RV的假阳性率和AdV假阳性率差异均有统计学意义(χ2=15.0,52.8和47.5,P值均<0.05); 两种方法检测结果一致性较差(Kappa值为0.25,Kappa值<0.4)。结论 仪器法检测RV和AdV抗原阳性率及假阳性率方面均优于手工法,更有利于临床应用。 相似文献