我国广东、福建地区2000～2001年手足口病肠道病毒71型分离株的种系进化分析

目的 采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测我国广东、福建地区2000-2001年手足口病(HFMD)散发病例中的肠道病毒71型(EV71)，进而通过扩增VP1节段的核苷酸序列，进行毒株的种系进化分析。方法以肠道病毒特异引物对EV-1、EV-2进行RT-PCR，经琼脂糖凝胶电泳鉴定为阳性的标本，进一步用EV71特异引物对159S、162A进行RT-PCR，扩增的VP1节段经纯化后与测序载体pGEM-T连接，转化大肠埃希菌DH5a，筛选后测序。所得序列与我国深圳、上海、武汉地区的EV71流行株，中国台湾1998年4例HFMD暴发分离的EV71毒株，及来自美国、日本、匈牙利等国家地区的EV71毒株的核苷酸序列，用ClustalX1．8和PHYuP3．5进行比对分析，构建种系进化树。结果 25份标本检测EV71的阳性率为20％，所得序列经种系进化分析，与肠道病毒71型的其他毒株同源，与深圳1998年HFMD散发分离的EV71毒株同源性为94％，与上海2000年HFMD暴发分离株同源性为94％～96％，与武汉1987年HFMD病例中分离的毒株同源性为91％，而与国外EV71毒株同源性仅为82％～84％。结论 EV71是我国南方地区HFMD的主要病原之一；我国大陆地区的EV71毒株在种系进化上有较高的同源性；与我国台湾地区大部分分离株亦有90％～91％的核苷酸同源性，但大陆EV71引起的HFMD发病症状较轻，有别于1998年台湾地区EV71的大暴发。