大鼠肝再生启动阶段肝细胞CCAAT增强子结合蛋白αmRNA、微小RNA-144-3p和3种环状RNA的表达和作用

目的 了解大鼠肝再生启动阶段CCAAT增强子结合蛋白α(CEBPα) mRNA、微小RNA(miR)-144-3p、rno-LOC100365958_0001、rno-Usp3_0010和rno-AC241873_0010调节肝细胞处于G0期还是G1期的途径和方法.方法 按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsrod等方法分离肝细胞,用大规模定量分析技术检测大鼠肝再生中肝细胞竞争性内源RNA(ceRNA)表达的变化,用Cytoscape 3.2软件构建ceRNA的相互作用网络,用ceRNA综合分析等方法解析它们表达的相关性和作用相关性.结果 PH后0h和6h时,CEBPαmRNA的比值为4.88±0.78和1.12±0.27,miR-144-3p为1.30±0.11和2.97±0.81,rno-LOC 100365958_0001为6.99±0.55和0.16±0.05,rno-Usp3_0010为8.48±0.67和0.13±0.01,rno-AC241873_0010为11.85±0.93和0.09±0.02.CEBPα促进的G0期相关基因细胞周期蛋白依赖性激酶2相关蛋白2(CDK2AP2)为2.55±0.42和0.74±0.11,G0/G1开关2(G0S2)为3.85±0.23和0.64±0.08,信号转导子和转录激活因子1(STAT1)为2.57±0.13和1.32±0.13,转化生长因子β受体2(TGFBR2)为2.77±0.20和0.79±0.13,抑制的G0期相关基因细胞周期蛋白依赖性激酸酶抑制剂1a(CDKN1a)为0.39±0.07和0.93±0.15.CEBPα促进的G1期相关基因细胞周期蛋白G2 (CCNG2)为1.19±0.09和0.25±0.06,抑制的G1期相关基因ETS变异转录因子6(ETV6)为0.77±0.05和2.22±0.68,血红蛋白加氧酶1(HMOX1)为1.05±0.21和4.57±0.88,MAPK14为1.01±0.15和2.01±0.32,STAT3为0.74±0.15和2.88±0.24,肿瘤坏死因子(TNF)为0.80±0.14和2.29±0.51.结论 PH后0h时,CEBPα mRNA上调,有利于CEBPα促进的G0期相关基因表达和肝细胞处于G0期.相反,PH后6h时,rno-LOC 100365958_0001、rno-Usp3_0010、rno-AC241873_0010和miR-144-3p的相互作用加强了后者对CEBPα mRNA的抑制,不利于CEBPα形成,有利于CEBPα抑制的G1期相关基因表达和肝细胞处于G1期.     

大鼠肝再生终止阶段肝细胞CCAAT增强子结合蛋白αmRNA、微小RNA-144-3p和3种环状RNA的表达和作用

目的 了解大鼠肝再生终止阶段CCAAT增强子结合蛋白α(CEBPα) mRNA、miR-144-3p、rno-LOC100365958_0001、mo-Usp3_0010和mo-AC241873_0010调节肝细胞进入G1期的途径和方法.方法 按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsrod等方法分离肝细胞,用大规模定量分析技术检测大鼠肝再生中肝细胞竞争性内源RNA(ceRNA)表达的变化,用Cytoscape 3.2软件构建ceRNA的相互作用网络,用ceRNA综合分析等方法解析它们表达的相关性和作用相关性.结果 PH后6h和72 h时,CEBPα mRNA的比值为1.12±0.27和2.52±0.15,miR-144-3p为2.97±0.81和0.99±0.36,rno-LOC 100365958_0001为0.16±0.05和6.78±0.62,rno-Usp3_0010为0.13±0.01和7.61±0.69,rno-AC241873_0010为0.09±0.02和7.53±0.69.CEBPα促进的G1期相关基因细胞周期蛋白G2(CCNG2)为0.25±0.06和1.10±0.22,抑制的G1期相关基因ETS变异转录因子6(ETV6)为2.22±0.68和0.99±0.27,MAPK14为2.01±0.32和0.85±0.11,信号转导子和转录激活因子3(STAT3)为2.88±0.24和1.08±0.07,肿瘤坏死因子(TNF)为2.29±0.51和0.86±0.51.CEBPα促进的G0期相关基因G0/G2期开关2(G0S2)为0.64±0.08和4.71±0.91,磷脂酶A2-IVA(PLA2G4A)为0.42±0.13和2.83±0.62.结论 PH后6h时,rno-LOC 100365958_0001、rno-Usp3_0010、rno-AC241873_0010和miR-144-3p的相互作用加强了后者对CEBPα mRNA的抑制,不利于CEBPα形成,有利于CEBPα抑制的G1期相关基因表达和肝细胞处于G1期.相反,PH后72 h时,CEBPα mRNA上调,有利于CEBPα促进G0期相关基因表达和肝细胞处于G0期.     

大鼠肝再生终止阶段肝细胞CCAAT增强子结合蛋白αmRNA、微小RNA-144-3p和3种环状RNA的表达和作用

目的 了解大鼠肝再生终止阶段CCAAT增强子结合蛋白α(CEBPα) mRNA、miR-144-3p、rno-LOC100365958_0001、mo-Usp3_0010和mo-AC241873_0010调节肝细胞进入G1期的途径和方法.方法 按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsrod等方法分离肝细胞,用大规模定量分析技术检测大鼠肝再生中肝细胞竞争性内源RNA(ceRNA)表达的变化,用Cytoscape 3.2软件构建ceRNA的相互作用网络,用ceRNA综合分析等方法解析它们表达的相关性和作用相关性.结果 PH后6h和72 h时,CEBPα mRNA的比值为1.12±0.27和2.52±0.15,miR-144-3p为2.97±0.81和0.99±0.36,rno-LOC 100365958_0001为0.16±0.05和6.78±0.62,rno-Usp3_0010为0.13±0.01和7.61±0.69,rno-AC241873_0010为0.09±0.02和7.53±0.69.CEBPα促进的G1期相关基因细胞周期蛋白G2(CCNG2)为0.25±0.06和1.10±0.22,抑制的G1期相关基因ETS变异转录因子6(ETV6)为2.22±0.68和0.99±0.27,MAPK14为2.01±0.32和0.85±0.11,信号转导子和转录激活因子3(STAT3)为2.88±0.24和1.08±0.07,肿瘤坏死因子(TNF)为2.29±0.51和0.86±0.51.CEBPα促进的G0期相关基因G0/G2期开关2(G0S2)为0.64±0.08和4.71±0.91,磷脂酶A2-IVA(PLA2G4A)为0.42±0.13和2.83±0.62.结论 PH后6h时,rno-LOC 100365958_0001、rno-Usp3_0010、rno-AC241873_0010和miR-144-3p的相互作用加强了后者对CEBPα mRNA的抑制,不利于CEBPα形成,有利于CEBPα抑制的G1期相关基因表达和肝细胞处于G1期.相反,PH后72 h时,CEBPα mRNA上调,有利于CEBPα促进G0期相关基因表达和肝细胞处于G0期.     

大鼠肝再生启动阶段肝细胞CCAAT增强子结合蛋白ζmRNA、微小RNA-136-3p和4种环状RNA的表达和作用

目的 了解大鼠肝再生启动阶段CCAAT增强子结合蛋白ζ(CEBPζ) mRNA、miR-136-3p、rno-Got1_0001、rno-Crebrf_0009、rno-Slc38a9_0001和rno-LOC 100362999_0001调节肝细胞处于G0期还是G1期的途径和方法.方法 按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsrod等方法分离肝细胞,用大规模定量分析技术检测大鼠肝再生中肝细胞的ceRNA表达变化,用Cytoscape 3.2软件构建竞争性内源RNA(ceRNA)的相互作用网络,用ceRNA综合分析等方法解析它们表达的相关性和作用相关性.结果 PH后0h和6h时,CEBPζ mRNA的比值为0.97±0.15和2.56±0.12,miR-136-3p为1.05±0.32和0.38±0.04,mo-Got1_0001为0.33±0.03和4.35±0.78,rno-Crebrf_0009为1.17±0.32和2.99±0.28,rno-Slc38a9_0001为0.67±0.08和2.64±0.29,mo-LOC 100362999_0001为0.25±0.02和0.92±0.22.CEBPζ抑制的G0期相关基因细胞周期蛋白依赖性激酶2相关蛋白2(CDK2AP2)为2.55±0.42和0.74±0.11,myb1膜运输蛋白的靶标(TOM1)为2.80±0.91和1.40±0.36,含缬草肽蛋白质(VCP)为2.63±0.17和1.10±0.10.CEBPζ促进的G1期相关基因cAMP响应元件结合蛋白3样4(CREB3L4)为1.13±0.63和2.00±0.81,硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)为1.03±0.07和2.50±0.19.结论 PH后0h时,CEBPζ mRNA未上调,有利于CEBPζ抑制G0期相关基因的表达和肝细胞处于G0期.相反,PH后6h时,rno-Got1_0001、rno-Crebrf_0009、rno-Slc38a9_0001、rno-LOC100362999_0001和miR-136-3p的相互作用解除了后者对CEBPζ mRNA的抑制,有利于CEBPζ的形成,有利于CEBPζ促进G1期相关基因的表达和肝细胞处于G1期.     

大鼠肝再生启动阶段肝细胞CCAAT增强子结合蛋白βmRNA、微小RNA-369-3p和rno-Rmdn2_0006的表达和作用

目的 了解大鼠肝再生启动阶段CCAAT增强子结合蛋白3(CEBPβ)mRNA、miR-369-3p和mo-Rmdn2_0006调节肝细胞处于G0期还是G1期的途径和方法.方法 按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsrod等方法分离肝细胞,用大规模定量分析技术检测大鼠肝再生中肝细胞竞争性内源RNA(ceRNA)表达的变化,用Cytoscape 3.2软件构建ceRNA的相互作用网络,用ceRNA综合分析等方法解析它们表达的相关性和作用相关性.结果 PH后0h和6h时,CEBP3 mRNA的比值为1.11±0.11和2.57±0.10,miR-136-3p为0.70±0.22和0.28±0.03,rno-Rmdn2_0006为1.26±0.34和2.62±0.70.CEBPp促进的G0期相关基因生长停滞和DNA损伤诱导型β(GADD45β)为0.12±0.09和2.50±0.44,细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1A(CDKN1A)为0.39±0.07和0.93±0.15,抑制的G0期相关基因细胞周期蛋白依赖性激酶2相关蛋白2(CDK2AP2)为2.55±0.42和0.74±0.11,信号转导子和转录激活因子1(STAT1)为2.57±0.13和1.32±0.13.CEBPβ促进的G1期相关基因ETS变异转录因子6(ETV6)为0.77±0.05和2.22±0.68,血红蛋白加氧酶1(HMOX1)为1.05±0.21和4.57±0.88,丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)为1.01±0.15和2.01±0.32,硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)为1.03±0.07和2.50±0.19,抑制的G1期相关基因红细胞衍生核因子2样蛋白2(NFE2L2)为0.66±0.09和0.35±0.05.结论 PH后0h时,CEBPβ mRNA未上调,有利于CEBPβ抑制的G0期相关基因表达和肝细胞处于G0期.相反,PH后6h时,rno-Rmdn2_0006和miR-369-3p通过相互作用解除了后者对CEBPp mRNA的抑制,有利于CEBPp形成,有利于CEBPβ促进的G1期相关基因表达和肝细胞处于G1期.     

#br# microRNAs在肝再生中的作用研究进展

目的 microRNAs是一类非编码蛋白的小RNA分子,通过与靶基因mRNA 3’端的非编码区（3’UTRS）结合而在转录后水平调控基因表达,调节细胞增殖、分化、代谢、凋亡、器官发育等生物学过程。肝脏有很强的再生能力,是研究再生的重要材料。因此,我们在文中总结了microRNAs对肝再生调节作用的研究进展。     

大鼠肝再生启动阶段肝细胞CCAAT增强子结合蛋白δmRNA、微小RNA-3553和rno-Acad8_0002的表达和作用

目的 了解大鼠肝再生启动阶段CCAAT增强子结合蛋白δ(CEBPδ) mRNA、miR-3553和rno-Acad8_0002调节肝细胞处于G0期还是G1期的途径和方法.方法 按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsrod等方法分离肝细胞,用大规模定量分析技术检测大鼠肝再生中肝细胞竞争性内源RNA (ceRNA)表达的变化,用Cytoscape 3.2软件构建ceRNA的相互作用网络,用ceRNA综合分析等方法解析它们表达和作用的相关性.结果 PH后0h和6h时,CEBPδ mRNA的比值为0.40±0.08和2.15±0.24,miR-3553为2.53±0.47和1.17±0.31,rno-Acad8_0002为1.24±0.04和2.66±0.54.CEBPδ抑制的G0期相关基因转化生长因子β受体2(TGFBR2)为2.77±0.20和0.79±0.13,磷脂酶A2-IVA(PLA2G4A)为2.56±0.76和0.42±0.13.CEBPδ促进的G1期相关基因纤溶酶原激活剂尿激酶受体(PLAUR)为0.27±0.08和2.62±0.31,丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)为1.01±0.15和2.01±0.32,ETS变异转录因子6(ETV6)为0.77±0.05和2.22±0.68,血红蛋白加氧酶1(HMOXl)为1.05±0.21和4.57±0.88.结论 PH后0h时,CEBPδmRNA下调,有利于CEBPδ抑制的G0期相关基因表达和肝细胞处于G0期.相反,PH后6h时,rno-Acad8_0002和miR-3553的相互作用解除了后者对CEBPδ mRNA的抑制,有利于CEBPδ形成,有利于CEBPδ促进的G,期相关基因表达和肝细胞处于G1期.     

大鼠肝再生的肝脏炎症反应中骨髓瘤基因mRNA、微小RNA-540-3p、环状RNA＿04996的表达变化与作用

目的 了解大鼠肝再生(LR)0 h和6 h时骨髓瘤基因(MYC)及其mRNA相互作用的微小RNA(miRNA,miR)和环状RNA(circRNA)的表达变化、相互作用和调节残肝炎症反应的途径与方式。方法 按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型，用大规模定量检测技术测定大鼠肝再生中残肝的mRNA、miRNA和circRNA[合称内源竞争RNA(ceRNA)]表达变化，用Cytoscape 3.2软件构建ceRNA的相互作用网，用ceRNA综合分析等方法解析它们的表达相关性和作用相关性。结果 PH后0 h和6 h时，MYC mRNA的比值为0.15±0.03和2.36±0.20,miR-540-3p为3.00±0.43和0.79±0.01,circRNA＿04996为1.43±0.43和3.14±0.94。同时，PH后0 h时，MYC促进的纤溶酶原激活剂尿激酶受体(PLAUR)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素1受体2型(IL1R2)等3个炎症反应相关基因表达下调，抑制的炎症反应相关基因利钠肽A(NPPA)、核受体亚家族O组B成员2(NROB2)和过氧化物酶体增殖物激活...     

大鼠肝再生的肝细胞周期启动及终止中骨髓瘤基因mRNA与其他非编码RNA的表达变化与作用

目的 了解大鼠肝再生(LR)0 h、6 h和72 h时骨髓瘤基因(MYC)及其mRNA相互作用的微小RNA(miRNA)和环状RNA(circRNA)调节肝细胞周期启动及终止的途径与方式。方法 按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型，按Smedsrod等方法分离肝细胞，用大规模定量检测技术测定大鼠肝再生中肝细胞的mRNA、miRNA和circRNA[合称内源竞争RNA(ceRNA)]表达变化，用Cytoscape 3.2软件构建ceRNA的相互作用网，用ceRNA综合分析等方法解析它们的表达相关性和作用相关性。结果 在PH后肝细胞周期启动0～6 h间的0 h和6 h时，MYC mRNA的比值为0.15±0.03和2.36±0.2,miR-134-5p为3.22±0.61和0.08±0.02,circRNA＿12112为0.68±0.21和13.35±3.53。同时，PH后0 h时，MYC促进的细胞周期启动相关基因Ras关联域家族成员1(RASSF1)、细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、超氧化物歧化酶2(SOD2)表达下调，抑制的细胞周期启动相关基因嵌套蛋白(NES)...     

大鼠肝再生的肝细胞干性变化中性别决定区转录因子2 mRNA和其他非编码RNA的表达变化与作用

目的 了解大鼠肝再生(LR)0 h和2 h时性别决定区转录因子2(SOX2)基因及其mRNA相互作用的微小RNA(miRNA,miR)和环状RNA(circRNA)的表达变化、相互作用和调节肝细胞干性变化的途径与方式。方法 按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(partial hepatectomy, PH)模型，按Smedsrod等方法分离肝细胞，用大规模定量检测技术测定大鼠肝再生中肝细胞的mRNA、miRNA合称内源竞争RNA(ceRNA)的表达变化，用Cytoscape 3.2软件构建ceRNA的相互作用网，用ceRNA综合分析等方法解析它们的表达相关性和作用相关性。结果 PH后0 h和2 h时，SOX2 mRNA的比值为1.00±0.09和2.15±0.48,miR-3558-3p为4.53±0.10和0.81±0.16,circRNA＿18404为1.24±0.04和11.10±0.57,circRNA＿18045为1.97±0.47和4.44±0.23。同时，PH后0 h时，SOX2促进的富含AT的交互域5A(ARID5A)、激活转录因子3(ATF3)、BTG抗增殖因...