山西省太原市MSM人群HIV-1毒株传播与耐药特征研究

目的了解山西省太原市男男同性性行为(man who sex with man, MSM)人群新报告I型艾滋病病毒(human immunodeficiency virus-1, HIV-1)感染者毒株传播与耐药特征。方法对山西省太原市2016—2021年MSM人群中部分新报告HIV-1感染者进行调查和采样, 提取病毒RNA并扩增获得pol区序列, 对序列进行亚型判定、耐药位点和分子网络分析, 通过SAS 9.4对数据进行分析。结果共获得505条序列, 发现流行的主要亚型为CRF01_AE(44.0%, 222/505)和CRF07_BC(37.6%, 190/505);2019—2021年较2016—2017年CRF01_AE亚型占比下降13.9%(P=0.007)。该人群的治疗前耐药率为4.6%(23/505), 针对非核苷类反转录酶抑制剂和核苷类反转录酶抑制剂的耐药位点, 2019—2021年种类有所增加。在1.5%基因距离下构建分子网络, 入网率为45.9%(232/505), 发现一个含耐药位点G190A的传播簇。lo...     

基于分子网络方法研究HIV感染者传播特征的相关进展

HIV分子网络是近期被广泛报道的一种研究HIV感染者传播特征的方法,各国利用此方法在传播关系、传播热点、疫情监控等方面进行了大量的研究,有望为实现精确干预和防控提供依据。目前国际上主要报道有3种构建分子网络的方法：基于两两比对基因距离法、基于系统进化树节点校验值法、基于两者联合参数法。本文综述3种构建HIV分子网络方法研究HIV感染者传播特征的相关进展,以期为应用于指导防控HIV提供数据支撑。自分子网络方法出现以来,我国北京市、上海市、浙江省、四川省等陆续报道了应用分子网络方法分析的相关研究结果,为进一步开展精准防控提供了科学数据。近期国际上相关研究也预测基于分子网络的传播簇检测有望成为终结艾滋病流行的一种新方法。     

2018年新报告HIV-1感染者省际传播特征分析

目的 分析省际1 型艾滋病病毒(HIV-1)的传播特征,为实施精准防控进而减少HIV-1在我国的流行提供科学数据.方法 对2018年当年新报告的HIV-1感染者进行抽样调查.收集血样并提取病毒核糖核酸,获得pol区部分片段的序列,构建系统进化树.运用HIV-TRACE构建分子网络并筛选出跨省分子簇.结果 共调查31个省...     

我国HIV-1 CRF55_01B感染者抗病毒治疗前耐药分析

目的:了解我国HIV-1 CRF55_01B感染者抗病毒治疗前对蛋白酶类抑制剂(PI)、核苷类逆转录酶抑制剂(NRTIs)、非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)、整合酶抑制剂(INSTIs)的耐药程度以及耐药株的传播关系。方法:对2018年全国抗病毒治疗前HIV耐药监测中CRF55_01B重组亚型感染者的血浆样本提取...     

2016-2017年山西省太原市艾滋病病毒感染者毒株基因特征及耐药分析

目的了解山西省太原市2016-2017年新报告未经治疗艾滋病病毒(HIV)感染者毒株亚型分布以及耐药毒株的传播。方法对太原市2016年8月至2017年12月新报告未经治疗的HIV/艾滋病患者(AIDS)进行调查。采集血样,提取RNA,获得pol区序列,构建系统进化树判定亚型。应用美国斯坦福大学HIVdb Program库进行耐药解读,并运用HyPhy 2.2.4软件和Cytoscape 3.6.1软件进行HIV-1分子网络分析。结果从调查的251名新报告未经治疗HIV/AIDS中获得227条pol区序列。发现太原市HIV-1毒株以CRF01AE亚型为主,占52.0%(118/227),其次为CRF07BC亚型占32.6%(74/227);2016-2017年新报告未经治疗HIV/AIDS中HIV-1耐药率为5.3%(12/227),针对非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)耐药率为5.3%(12/227),针对核苷类反转录酶抑制剂(NRTI)耐药率为1.3%(3/227),未发现有蛋白酶抑制剂(PI)的耐药;按1.5%基因距离阈值构建分子网络入网率为40.1%(91/227),发现12个分子簇;亚型为CRF790107(P=0.01)的感染者入网率较高。结论太原市HIV-1流行毒株CRF01AE和CRF07BC两种亚型合计超过80%,针对NNRTI耐药率已超过5%;感染新型重组亚型CRF790107的感染者已形成簇传播,需加强该人群的调查和干预。