中国女性卵巢癌流行现状和趋势及预测分析

目的：　对1990至2019年中国女性卵巢癌流行趋势及危险因素进行分析,为我国卵巢癌的预防提供更科学的依据。方法：　从全球疾病负担2019数据库获取中国及其他地区卵巢癌发病、死亡及伤残调整寿命年指标的估计数和标准化率,比较评估中国卵巢癌的流行负担及危险因素变化。用GLOBOCAN库对2020至2040年中国卵巢癌发病及死亡人数进行预测。结果：　1990至2019年,中国大陆和中国台湾省卵巢癌的年龄标准化发病率分别由2.56/10万和4.72/10万增至4.54/10万和8.68/10万,年龄标准化死亡率由1.76/10万和2.63/10万增至2.77/10万和3.84/10万,增幅超过全球、日本及新加坡。其中,50~54岁年龄组女性发病人数最多,发病率的峰值出现在70~74岁。2019年卵巢癌死亡的三大危险因素分别是高空腹血糖、高体质指数和职业性石棉暴露。30年间,中国卵巢癌的年龄标准化伤残调整寿命年率（disability-adjusted life year,DALY）随社会人口学指数（socio-demographic index,SDI）增加而增加。此外,据GLOBOCAN数据库预测,中国卵巢癌疾病负担会持续加重,预计到2040年,发病人数较2020年增加17.9%,死亡人数增加33.0%。结论：　中国女性卵巢癌疾病负担仍然较重,且在不断上升,需要针对不同年龄段及风险人群采取相应的有效预防措施,加强对高风险人群的监测,以进一步降低疾病负担。     

银屑病发病关键基因筛选、与免疫细胞浸润关系及有治疗潜力的中药预测

目的 筛选银屑病发病关键基因,分析银屑病发病关键基因与免疫细胞浸润水平之间的关系,并筛选对银屑病有治疗潜力的中药,为研究银屑病的发病原因、发病机制提供参考。方法 在GEO数据库检索银屑病基因芯片,筛选出银屑病差异共表达基因（DEGs）;通过WGCNA包筛选出银屑病相关性最高的基因模块;将获取的银屑病DEG s与银屑病相关性最高的模块取交集,获得银屑病高度相关DEG s,并对其进行GO分析、KEGG分析。采用MCC、DEGREE、EPC和CLOSENESS算法从银屑病高度相关DEG s中筛选出与银屑病相关性更强的DEGs为银屑病发病关键基因。利用CIBERSORT反卷积法、Pearson相关分析银屑病发病关键基因与免疫浸润细胞比例的关系。通过将银屑病发病关键基因映射至COREMINE medical数据库,筛选出对银屑病有治疗潜力的中药。结果 共筛选出348个DEG s。GO富集分析显示DEGs主要富集在对外部生物刺激的反应、线粒体蛋白复合体、内肽酶活性、丝氨酸型肽酶活性等方面;KEGG富集分析显示其主要涉及NF-κB信号通路、Toll样受体信号通路、细胞因子-细胞因子受体的相互作用、P...     

亚洲五个国家和地区肾癌负担趋势分析与预测

目的 估计1990—2019年亚洲5个国家和地区肾癌发病率、死亡率和伤残调整寿命年率(DALY率)的长期趋势,以及2019年中国肾癌的疾病负担现状,并预测到2029年的未来趋势。方法 数据来源于“2019年全球疾病负担研究”(GBD 2019),从中获取中国内地、中国台湾、韩国、日本和新加坡的疾病负担指标,分析1990—2019年的疾病负担变化趋势。利用ARIMA模型预测中国内地2020—2029年的发病率和死亡率。结果 1990—2019年亚洲5个国家和地区中,中国内地、中国台湾和韩国的年龄标化发病率、死亡率和DALY率均呈上升趋势(EAPC 95%CI>0),增长变化最大的是中国台湾,其次是中国内地。2019年亚洲5个国家和地区肾癌DALY率随年龄增加呈上升趋势,各个国家和地区男性肾癌疾病负担均高于女性,由高BMI、吸烟和三氯乙烯职业暴露3种危险因素导致肾癌DALY率最高的是中国台湾。ARIMA模型预测结果显示中国内地2020—2029年肾癌发病率和死亡率仍持续上升。结论 1990年以来,肾癌发病率在亚洲5个国家和地区均呈上升趋势。且到2029年中国内地的发病率和死亡率仍会继续上升。     

基于多组学的儿童系统性红斑狼疮与皮肌炎相关共病基因分析

目的基于生物学信息多组学技术对儿童系统性红斑狼疮和皮肌炎共病患者相关基因的特征进行分析。方法从GEO数据库下载儿童系统性红斑狼疮(childhood-onset systemic lupus erythematos, cSLE)与皮肌炎(juvenile dermatomyositis, JDM)相关基因芯片表达谱, 将两者的差异基因取交集后进行GO功能富集及KEGG信号通路分析, 通过Cytoscape软件构建蛋白质互作网络, 筛选hub基因;使用CIBERSORT反卷积法分析关键基因和免疫细胞浸润的相关性, 将经验证的关键基因导入Coremine Medical数据库筛选出治疗cSLE和JDM共病药物。结果差异表达基因功能主要富集于I型干扰素通路以及抗病毒反应等;网络拓扑学分析、经外部数据集验证后共筛选出5个关键基因STAT1、ISG15、MX1、OASL、DDX58, (P均<0.05)免疫浸润细胞相关性分析显示JDM和cSLE患者的M1巨噬细胞显著上调时与关键基因呈正相关, (P均<0.05)干扰素免疫调节、抗病毒制剂与JDM和cSLE共病患者的治疗存在密切关联, ...     

应用单细胞测序识别银屑病致病相关的潜在生物标志物以及细胞互作关系

目的在单细胞水平上探究与银屑病致病相关的潜在生物标志物和细胞间的异质性水平。方法对银屑病皮肤活检组织的单细胞测序数据进行质控、降维聚类及细胞亚群注释, 以及对细胞类群进行差异基因(differentially expressed genes, DEGs)、细胞通讯及拟时序分析, 并构建TFs-miRNA-hub基因调控网络。结果基于多算法共鉴定出6个共同交集的hub基因, 分别为SPRR2A、SPRR2D、IL7R、IL1RN、IER3、LCN2。KEGG显示其主要涉及NF-κB信号通路、TNF信号通路、MAPK信号通路等。在内皮细胞、成纤维细胞以及免疫细胞如朗格汉斯细胞、CD8+ T细胞、M1巨噬细胞、静息T细胞里SPRRs基因表达量均显著上调, IL7R则主要在多种免疫细胞中过表达。成纤维细胞、树突状细胞、Treg细胞和CD8+ T细胞在银屑病皮损的含量显著增多(P=0.023、P=0.007、P=0.046、P=0.028)。皮损组内细胞间的相互作用数量、强度和通路富集程度的活跃性均高于对照组, Treg细胞、CD8+ T细胞以及静息T细胞仅在银屑病组内与其他细胞有交互作用。拟时...     

整合生物信息学分析痤疮的关键基因与免疫浸润水平

 目的 通过整合分析多芯片数据，探究与痤疮发病相关的关键基因及免疫细胞浸润水平。方法 从GEO数据库获取基因芯片数据集，采用“limma” R包和加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与痤疮表型相关基因模块中的差异表达基因(DEGs)，并进行GO功能富集和KEGG通路分析；利用STRING在线数据库及Cytoscape软件构建蛋白质互作网络，并筛选出关键基因；基于CIBERSORT算法分析免疫细胞浸润情况。 结果 共筛选到154个DEGs。DEGs与信号受体结合、细胞因子活性、趋化因子受体结合等有关，主要集中在病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体的相互作用、细胞因子-细胞因子受体的相互作用、趋化因子信号传导、NF-κB信号传导、IL-17信号传导等通路。构建的PPI网络中，得到139个节点，1 597条边，筛选到两个关键基因(CCR5、CXCL8）。22种免疫细胞浸润中，相对于正常对照组，皮损组中有更多的中性粒细胞、活化的肥大细胞、活化的树突状细胞、活化的CD4记忆T细胞等，而调节性T细胞、静息的树突状细胞、静息的肥大细胞等相对更少。 结论 本研究利用生物信息学方法筛选的关键基因及免疫细胞浸润水平的变化可能在痤疮发病中起到重要作用。     

1990—2019年亚洲青少年皮肤病疾病负担研究

目的 评估1990—2019年亚洲48个国家及地区10～19岁青少年皮肤及皮下组织疾病的疾病负担情况。方法 选取1990—2019全球疾病负担（Global Burden of Disease,GBD）年GBD数据库中的发病率、患病率、伤残调整生命年（disability-adjusted life years,DALYs）、死亡率等指标，以及估计年百分比变化（estimated annual percentagechanges, EAPCs）对亚洲10～19岁青少年人群皮肤及皮下疾病疾病负担情况进行描述。结果 1990—2019年亚洲10～19岁青少年皮肤病的发病率、患病率、伤残调整生命年（disability adjusted life year,DALYs）都持续上升；死亡率有所下降。48个国家及地区的青少年皮肤病患病数、DALY涨幅最快为卡塔尔（314.74%,313.80%），降幅最快的是格鲁吉亚（51.79%,52.17%）。2019年12种皮肤病中寻常性痤疮患病数、DALY数最多，发病、患病、DALY率增长最明显。结论 1990年以来亚洲青少年皮肤及皮下疾病疾病负担较重，...     

基于网络药理学和分子对接探讨蒺藜治疗白癜风的作用机制

目的 基于网络药理学的方法,探讨蒺藜治疗白癜风的作用机制。方法 将口服生物利用度(OB)和类药性(DL)这两项筛选标准分别设定为OB≥30%和DL≥0.18,使用Cytoscape 3.9.1软件,通过中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)、OMIM、Swiss Target Prediction和GeneCards等多种主流数据库,筛选出蒺藜主要活性成分的作用靶点基因并构建“活性成分-作用靶点”网络,再将蒺藜主要活性成分的作用靶点基因与白癜风疾病靶点基因取交集,构建蒺藜治疗白癜风的“疾病-通路-靶点-成分-药物”网络。将交集作用靶点分别导入至STRING平台用以构建蛋白质相互作用(PPI)网络,导入DAVID数据库用以进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。利用有机小分子生物活性数据库(PubChem)和蛋白质结构数据库(PBD)找出药物关键成分的小分子结构和疾病蛋白结构,设置受体与配体后对两者进行分子对接。结果 筛选出12种活性成分,包括山奈酚、蒺藜酰胺、异鼠李素、谷甾醇等,该活性成分可能在对应的71个靶点上发挥功效。依赖PPI网络分析,挖掘出RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(...     

1990—2019年中国蛋白质能量营养不良发病趋势及预测研究

背景 蛋白质能量营养不良(PEM)是常见的营养缺乏症之一,随着生活方式以及饮食习惯的改变,人们对营养健康问题的关注度日益增加,而PEM可对不同年龄人群的健康产生不同程度影响。目的 分析1990—2019年中国PEM发病趋势以及不同年龄的PEM发病状况,并预测2020—2029年PEM发病趋势。方法 本研究数据来源于2019年全球疾病负担研究(GBD 2019),从该数据库中获取1990—2019年中国不同年龄段的PEM发病和死亡指标,各标化率的计算均采用世界标准人口计算。将发病数据分为18个年龄组(<5岁,5～9岁,以此类推至80～84岁和85岁及以上)。采用Joinpoint回归分析计算发病率的年度百分比变化(APC)和年度平均百分比变化(AAPC)以及95%置信区间(CI),并描述其变化趋势。利用自回归求和移动平均模型(ARIMA模型)预测中国2020—2029年PEM发病趋势。结果 (1) 2019年中国全人群PEM标化发病率为1996.5/10万,男性PEM标化发病率(2 444.7/10万)高于女性(1 536.0/10万)。2019年中国全人群PEM标化发病率低于全球...     

中国1990年与2019年新生儿疾病负担比较

目的 比较中国1990年与2019年新生儿疾病的疾病负担，为新生儿疾病的预防控制提供参考依据。方法 收集2019年全球疾病负担研究(GBD 2019)中1990年和2019年中国新生儿疾病负担的相关数据，采用患病数、标化患病率、死亡数、标化死亡率、过早死亡损失寿命年(YLLs)、标化YLLs率、伤残损失健康寿命年(YLDs)、标化YLDs率、伤残调整寿命年(DALYs)和标化DALYs率和年估计变化百分比(EAPC)等指标分析中国1990年与2019年新生儿疾病负担的变化情况。结果 2019年与1990年比较，中国新生儿疾病的患病数和标化患病率均呈上升趋势，EAPC分别为2.83%(95%UI=2.59%～3.07%)和2.52%(95%UI=2.33%～2.72%)；而死亡数和标化死亡率均呈下降趋势，EAPC分别为–6.40%(95%UI=–6.64%～–6.16%)和–5.10%(95%UI=–5.59%～–4.62%);YLDs和标化YLDs率上升，EAPC分别为4.05%(95%UI=3.88%～4.21%)和3.86%(95%UI=3.68%～4.04%)；而YLLs、标化Y...