走近医学研究领域中的基因芯片技术

生物芯片是高密度固定在固相支持介质上的生物信息分子（如寡核苷酸,基因片段, cDNA 片段或多肽、蛋白质）的微阵列。基因芯片是生物芯片的一种。随着人类基因组计划的提前完成。基因芯片技术在生命科学研究领域中有着广泛的应用,其具有高通量、多样化、自动化、反应微型化等突出特点。基因芯片技术已在基因功能表达、基因调控网络、疾病病理、临床诊断、药物开发及筛选等研究方面取得重大进展。本文简要介绍基因芯片技术的基本原理和种类,论述基因芯片技术在医学领域中的应用。     

FBXW7过表达可抑制乳腺癌MCF-7细胞增殖和迁移并促进细胞凋亡

目的:探讨F框/WD-40域蛋白7(F-box and WD-40 domain protein 7,FBXW 7)基因过表达对乳腺癌MCF-7细胞增殖、迁移、周期和凋亡的影响。方法:构建FBXW 7过表达的重组载体pEZ-M02-FBXW7质粒,并将其转染乳腺癌MCF-7细胞,应用实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法检测pEZ-M02-FBXW7转染后MCF-7细胞中FBXW7 mRNA和蛋白的表达,CCK-8和Transwell法检测细胞增殖、迁移和侵袭情况,FCM法检测细胞周期和细胞凋亡情况。结果:pEZ-M02-FBXW7转染后,乳腺癌MCF-7细胞中FBXW7 mRNA和蛋白的表达水平高于阴性对照组(将空载体pEZ-M02质粒转染至MCF-7细胞)和空白对照组(未进行转染的MCF-7细胞)(P值均<0.01),MCF-7细胞的增殖、迁移和侵袭能力均明显下降(P值均<0.05),MCF-7细胞被阻滞于G0/G1期(P<0.05),且细胞凋亡率明显升高(P<0.05)。结论:FBXW7高表达可抑制乳腺癌MCF-7细胞的增殖、侵袭和迁移,并可促进细胞凋亡。     

妊娠期乳腺癌相关基因的生物信息学分析

目的通过生物信息分析途径对妊娠期乳腺癌患者与正常人群的差异基因进行分析,从分子水平探讨妊娠期乳腺癌的发病机制。方法从公共数据库基因表达数据库(GEO)中下载妊娠期乳腺癌相关数据集,采用Qlucore Omics Explore(QOE)筛选差异表达基因,用DAIVID、STRING等在线分析工具对差异表达基因进行功能富集分析,信号转导通路分析以及预测蛋白质之间的关系。结果共筛选出148个差异表达基因,其中表达上调24个,下调124个,对其进行生物信息学分析发现,TAGLN、ACTG2、TPM2、TPM3、MYLK、ACTA2、MTH11等基因以及MAPK信号通路、黏着斑信号通路、血管平滑肌细胞收缩信号通路等在妊娠期乳腺癌的发生发展中可能起着重要作用。通过STRING分析发现,20个基因处于核心节点位置。结论利用生物信息学的方法能有效分析基因芯片数据并获取生物内在信息。