2017—2020年度济宁市乙型流感病毒监测及 HA和 NA基因变异和进化分析

目的:分析济宁市2017—2020年度乙型流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因变异情况及分子进化特征。方法:采集2017—2020年度济宁市哨点医院和流感暴发疫情病例咽拭子标本,进行核酸检测、病毒分离,选取20株乙型流感病毒代表毒株进行 HA和 NA基因测序,利用生物信息学软件构建进化...     

新型冠状病毒非结构蛋白3结构和功能的生物信息学分析

目的利用生物信息学方法分析新型冠状病毒非结构蛋白3(NSP3)的生物学特征。方法在NCBI数据库获得NSP 3氨基酸序列,利用软件分析其分子式、等电点、亲水性、跨膜结构域、蛋白翻译后修饰、二级结构、抗原表位等特点,并构建其三级结构。结果NSP3由1945个氨基酸组成,分子式为C_(9722)H_(15175)N_(2489)O_(2969)S_(88),是一种含有4个跨膜结构域的稳定亲水蛋白质。二级结构以无规卷曲为主(占45.1%),含有丰富的磷酸化位点、糖基化位点、泛素化位点、SUMO化位点、甲基化位点、乙酰化位点、琥珀酰化位点和棕榈酰化位点。NSP3含有15个二硫键,具有7个保守蛋白结构域,存在丰富的抗原表位,主要分布于内质网。并以同源建模法构建其三级结构模型。结论利用生物信息学方法分析NSP3的性质、结构、功能特征和抗原表位,为新冠肺炎的防控和药物研发提供参考依据。     

一例境外输入新型冠状病毒奥密克戎BA.2.3突变株的全基因组特征分析

目的 分析1例境外输入新型冠状病毒（SARS-CoV-2）奥密克戎BA.2.3突变株的全基因组序列分子特征。方法 对1例境外输入SARS-CoV-2感染者进行核酸检测和全基因组测序，利用生物信息学软件进行分型、同源性分析、氨基酸位点变异分析、磷酸化位点分析和构建进化树等。结果 获得1条长29 609 bp的SARS-CoV-2全基因序列，在进化树上位于B.1.1.529进化分支BA.2.3进化小枝。与wuhan-hu-1相比，共发生71个核苷酸位点变异和27个核苷酸位点缺失；62个氨基酸位点发生变异或缺失，其中S蛋白和N蛋白变异或缺失位点最多，分别发生31个和7个。结论 加强境外归国人员SARS-CoV-2的核酸检测和全基因组测序，有利于防控由境外输入引起的新型冠状病毒感染暴发。     

手足十二针联合偏瘫复原丸治疗轻中度中风偏瘫的疗效观察

目的：观察手足十二针联合偏瘫复原丸治疗轻中度中风偏瘫的临床疗效。方法：选取2020年11月～2022年11月收治的110例轻中度中风偏瘫患者，通过黑白色球法随机分为对照组和试验组，各55例。对照组采用偏瘫复原丸治疗，试验组在对照组基础上采用手足十二针治疗。比较两组临床疗效和不良反应发生情况，治疗前后的表面肌电信号、本体感受测量值、肢体运动和神经功能。结果：试验组总有效率96.36%,明显高于对照组的81.82%(P<0.05)。治疗后，两组肱四头肌、胫骨前肌、腓肠肌的肌电积分值(iEMG)均显著提高，试验组比对照组明显更高；肱四头肌、胫骨前肌、腓肠肌的均方根振幅(RMS)均显著降低，试验组比对照组明显更低(P<0.05)。治疗后，两组多轴平均轨迹差(ATE)、测试执行时间(TTE)均显著降低，试验组比对照组明显更低(P<0.05);治疗后，两组上肢、下肢及Fugl-Meyer运动功能(FMA)评分均显著提高，试验组比对照组明显更高；神经功能缺损(NIHSS)评分均显著降低，试验组比对照组明显更低(P<0.05)。对照组和试验组不良反应发生率相近(P>0.0...     

一起学校甲型H1N1流感聚集疫情的流行特征和全基因组测序分析

目的 了解济宁市一起聚集流感疫情的甲型H1N1流感病毒全基因组特征,为甲型H1N1流感防控提供依据。方法 对在一起聚集流感疫情采集的12份患者咽拭子标本进行流感病毒实时荧光定量PCR法核酸检测,对阳性标本进行病毒培养和全基因组测序,利用DNASTAR软件分析核苷酸和氨基酸同源性,利用MEGA软件构建进化树,利用NetNGlyc、GPS-SUMO、NetPhos软件分别分析糖基化位点、类泛素蛋白修饰分子化位点和磷酸化位点。结果 12份咽拭子标本中,4份标本甲型H1N1流感病毒核酸检测阳性,分离流感病毒株4株。同2018—2019年度北半球疫苗株A/Brisbane/02/2018相比,8个基因节段核苷酸同源性范围为98.5%～99.8%;编码的10种蛋白氨基酸同源性范围为98.2%～100.0%。在进化树上,4株毒株位于两个进化簇,其中3株毒株位于同一进化簇,1株毒株位于不同进化簇。4株毒株编码的10种蛋白共发生50处氨基酸位点置换,血凝素蛋白抗原表位2个氨基酸位点发生置换,神经氨酸酶蛋白酶活性位点和神经氨酸酶抑制剂耐药位点均未发生变异,聚合酶酸性蛋白、聚合酶碱性蛋白1和聚合酶碱性蛋白2...     

济宁市2021年第一季度流感样病例病原谱特征分析

目的 了解济宁市2021年第一季度流感样病例中呼吸道病原体分布情况,为临床诊断和治疗提供参考依据。方法 采集济宁市2021年第一季度208例流感样病例咽拭子标本,利用QIAstat-Dx全自动多重病原体检测平台检测23种常见呼吸道病原体。结果 呼吸道病原体总检出率为20.67%(43/208),其中混合感染占6.98%(3/43)。病原体以病毒为主,占比97.67%(42/43),其中腺病毒(ADV)、肠道病毒(EV)、副流感病毒1 (PIV1)、冠状病毒NL63(NL63)占比最高。不同月份和不同年龄组总检出率不同,其中1月份总检出率最高,为32.00%(24/75);0岁～5岁年龄组总检出率最高,为35.06%(27/77);而不同性别总检出率差异无统计学意义(χ²=1.804,P=0.18)。结论 2021年第一季度济宁市呼吸道病原体以ADV、EV、PIV1和NL63为主,应加强呼吸道病原体监测和防控力度,特别是低年龄组人群应当是监测的重点。