人正常宫颈上皮细胞感染沙眼衣原体的基因表达谱分析

目的分析人正常宫颈上皮细胞(HcerEpic)感染沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis, Ct)前后基因表达谱差异。方法 HcerEpic细胞经DEAE-D预处理后加入E型Ct标准株, 培养44 h后收集HcerEpic细胞(感染组), 并以未感染Ct的HcerEpic细胞作为对照组, 提取两组总RNA后反转录并构建cDNA文库。通过高通量测序分析两组基因表达谱差异, 并选择代表性基因通过实时荧光定量PCR(qPCR)验证。结果共检测23 997个基因, 差异基因125个, 其中上调基因119个, 下调基因6个;GO分析显示差异基因富集于对病毒防御反应、Ⅰ型干扰素(interferon, IFN)信号通路、对Ⅰ型IFN的细胞反应等条目;KEGG富集通路为甲型流感、单纯疱疹病毒感染、EB病毒感染、HPV感染、NOD样受体通路等相关通路。结论人正常宫颈上皮细胞感染Ct前后转录组存在差异, 差异基因主要富集于IFN通路, 与细胞抗病毒过程密切相关。qPCR验证了ISG15、IFIT2、OASL、UBE2L6等差异显著且与IFN通路密切相关的基因。