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目的了解杭州市男男性行为人群(men who have sex with men, MSM)HIV-1感染者的分子网络及治疗前耐药特征。方法收集杭州市2020—2021年新确证HIV-1感染且未经抗病毒治疗的MSM病例血样, 扩增HIV-1pol区基因并测序。使用MEGA6.0软件构建系统进化树判断亚型, 通过Cytoscape3.7.0软件绘制分子传播网络图。使用美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线分析耐药情况。结果共获得1 158条pol基因序列和9种HIV-1亚型, 以CRF07BC(49.9%, 573/1 158)和CRF01AE (36.7%, 425/1 158)为主。初始CD4+T淋巴细胞个数在不同亚型间的差异有统计学意义(χ2=37.02, P<0.001)。以1.0%基因距离阈值绘制HIV-1分子传播网络, 形成104个传播簇(簇内病例数2～72例), 入网率34.7%(402/1 158);发现一个包含72例患者的CRF07BC活跃传播簇。治疗前耐药株流行率为7.5%(87/1 158);对蛋白... 相似文献
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目的了解杭州市新报告HIV感染者/艾滋病患者(HIV/AIDS)抗逆转录病毒治疗(ART)前HIV-1亚型流行特征及耐药情况。方法收集杭州市2020—2022年新确证且未经抗病毒治疗的HIV/AIDS病例血样, 扩增HIV-1pol区基因并测序。使用MEGA7.0软件构建系统进化树判断亚型, 提交序列至斯坦福大学耐药数据库, 确定耐药突变位点及毒株对药物的敏感性。结果获得2 700条pol基因序列, 发现12种HIV-1亚型, 以CRF07BC (46.8%, 1 263/2 700)和CRF01AE (34.6%, 933/2 700)为主。ART前HIV-1耐药率8.1%(220/2 700), 其中, 蛋白酶抑制剂(PIs)、核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)和非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)耐药率分别为2.8%(75/2 700)、1.3%(36/2 700)和4.4%(119/2 700)。220例耐药病例中, PIs耐药突变位点为Q58E(21.4%, 47/220), NRTIs耐药突变位点为M184V/I(5.9%, 1... 相似文献
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