广东地区汉族人群TLR1 基因多态性的测序研究

目的: 人类Toll样受体1(TLR1)在先天性免疫中起着重要作用。本文将着重研究广东地区汉族正常人群中TLR1 基因功能区的单核苷酸多态性(SNPs)图谱和频率分布。方法: 随机收集50例健康、无亲缘关系的中国广东地区汉族人外周血液,对TLR1 基因的启动子区、5'和3'非翻译区、4个外显子区的序列进行PCR扩增和直接测序,找出多态性位点及其频率分布规律。在此基础上对多态性位点进行Hardy-Weinberg平衡分析、中性进化分析和连锁不平衡分析。结果: 共发现17个SNPs以及2个插入/缺失多态位点,其中2个是首次发现的新多态性位点。位于编码区的新SNP位点+1 378 A/G为非同义突变位点,能导致460位丝氨酸(Ser)残基替换为甘氨酸(Gly)残基,并且这个氨基酸残基的替换处于TLR1胞外区的LRR结构域中,从而有可能影响蛋白的识别功能。另外,频率最高的SNPs是+743 A/G和+1 518 A/G,其次要等位基因频率均达到48%。所有多态性位点均符合Hardy-Weinberg平衡。中性检验显示广东汉族人群 TLR1 基因不符合中性进化假说,很可能是其调控区受到平衡选择作用的原因。连锁不平衡分析显示多态性位点-6 912 C/TA、-6 876 C/T、-6 399 C/T和-6 375 C/T之间,-6 847 A/G和-6 737 A/T之间,以及-5 984 -/CT、-5 531 A/G和-5 490 C/G之间完全连锁。结论: 本研究首次报道了汉族正常人群TLR1 基因的功能性多态性图谱,发现了一些种族特异性的多态性位点及频率分布规律,为今后开展汉族人基因多态性与疾病相关性研究打下一定的基础。     

中国广东妇女子宫内膜异位症与HLA—DPB1的相关性研究

目的：探讨子宫内膜异位症与人类白细胞抗原－DPB1（HLA－DPB1）等位基因的相关性，从而分析子宫内膜异位症患者的遗传易感性。方法：采用DNA序列分析的分型技术（sequence-based typing ,SBT)对38例经腹腔镜或外科手术证实为子宫内膜异位症患者和36例非子人膜异位症妇女进行HLA－DPB1等位基因的基因分型。结果：两组人群HLA－DRB1等位基因表型频率的差异无显著性。结论：子宫内膜异位症与HLA－DRB1等位基因可能无相关性。     

广州地区汉族人乙型肝炎病毒感染与HLA-DPB1基因的相关性研究

目的：探讨人类白细胞抗原（HLA）的DPB1基因与广州地区汉族人乙型肝炎病毒（HBV）感染的相关性。方法：采用测序分型技术（SBT）对广州地区汉族人中58例乙型肝炎患者和75例正常个体的HLA-DPB1基因位点进行了基因分型。结果：两者的HLA-DPB1等位基因表现型频率差异均无显著性。结论：本研究检验的广州地区部分汉族人的HBV感染与HLA-DPB1基因无显著相关性。     

广东汉族人群TLR2基因的多态性研究

目的:人类Toll样受体2(TLR2)是先天免疫系统中一个重要的病原微生物识别受体。本研究将建立广东汉族人群TLR2基因座位的功能性多态性图谱,为下一步疾病相关性研究打下基础。方法:收集200例健康、无亲缘关系的中国广东汉族人外周血液,随机抽取其中24例样品,对TLR2基因的启动子区、3个外显子以及它们周围的部分内含子序列进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和直接测序,找出多态性位点,对剩余176例样品分别用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)及PCR技术对发现的单核苷酸多态性(SNPs)和插入/缺失(INDEL)多态性位点进行基因分型,分型结果进行Hardy-W e inberg平衡分析、中性进化分析以及连锁不平衡分析。结果:发现5个SNPs位点,其中2个位于启动子区的SNPs是首次发现,位于编码区的3个SNPs位点均为同义突变,频率最高的SNP是rs3804099,其次要等位基因频率为26.3%;在第1外显子区发现1个长度为22bp的INDEL多态位点(-196到-174),其缺失等位基因所占的频率为31.8%。所有多态性位点均符合Hardy-W e inberg平衡。中性检验显示广东汉族人群TLR2基因符合中性进化假说。连锁不平衡分析显示位于调控区的-18945 C/T和-18883 C/G 2位点之间完全连锁,而位于编码区的rs3804099和rs3804100两位点之间紧密连锁。结论:本研究首次建立了汉族正常人群TLR2基因座位的功能性多态性图谱,并研究了其分布频率,发现了一些种族特异性的多态性位点,为今后开展汉族人基因多态性与疾病相关性研究以及人群进化研究提供了重要资料。     

广东汉族正常人群TLR4基因单核苷酸多态性研究(英)

目的：人类Toll样受体4（TLR4）是先天免疫系统中一个重要的病原微生物识别受体。本研究将建立中国汉族正常人群TLR4基因座位的单核苷酸多态性图谱。方法：收集191例健康、无亲缘关系的中国广东汉族人外周血液,通过对TLR4基因的启动子区、3个外显子区以及它们周围的内含子区进行PCR扩增和测序,得到汉族正常人群TLR4基因座位单核苷酸多态性图谱及其频率分布特点。结果：共发现8个单核苷酸多态性位点,其中5个是首次发现的新位点。分布频率最高（0.283）的单核苷酸多态性位点是-1607 C/T。常见于高加索人中的2个非同义突变Asp299Gly和Thr399Ile在汉族人中没有被发现。中性检验显示汉族人群TLR4基因符合中性进化模型。结论：本研究建立了汉族正常人群TLR4基因座位的单核苷酸多态性图谱,发现了一些种族特异性的单核苷酸多态性位点,这些工作将为今后开展汉族人基因多态性与疾病相关性研究以及人群进化研究提供一定的帮助。