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目的：利用基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)和巨噬细胞炎症反应模型,基于通路水平阐释补肺健脾方干预慢性阻塞性肺疾病的配伍机制。方法：利用LPS诱导巨噬细胞建立炎症反应模型,分别给予补肺健脾方的12味中药干预,利用Illumina高通量测序平台得到基因表达谱数据。采用GSEA方法鉴定巨噬细胞炎症反应相关通路,通过富集评分(normalized enrichment score, NES)筛选中药干预后显著回调的通路,揭示补肺健脾方及其配伍的干预机制。结果：与对照组比较,模型组筛选到244条显著扰动通路(GSEA,FDR<0.05)。以得到的显著扰动通路为对象,补肺健脾方所含中药显著回调通路的NES为-1 041.56,其中补肺配伍的为-71.25,健脾配伍的为-17.45,温肾配伍的为-211.42,止咳化痰配伍的为-363.94,活血通络配伍的为-377.5;补肺健脾方可显著回调214条通路(逆转率为87.70%),其中补肺配伍的为43条,健脾配伍的为19条,温肾配伍的为133条,止咳化痰配伍的为142条,活血通络配伍的为187... 相似文献
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目的 探究多发性硬化外周全血mRNA差异表达的来源及其特异性.方法 利用外周全血mRNA表达谱数据,分别筛选多发性硬化和炎症性疾病(感染性休克、肺结核)患者相对正常人群的差异表达基因并进行比较.筛选正常外周血中髓系相对淋巴系细胞的差异表达基因,并与多发性硬化患者相对正常人群的差异表达基因作比较.结果 比较多发性硬化患者与两种炎症性疾病(感染性休克、肺结核)患者相对正常人群的差异表达基因,发现交叠基因上/下调方向的一致性分别为91.32%(P<0.05),93.23%(P<0.05).比较多发性硬化患者相对正常人群的差异表达基因及正常人群髓系相对淋巴系细胞的差异表达基因,发现交叠基因上/下调方向的一致性为96.82%(P<0.05).结论 多发性硬化患者相对于正常人群的差异表达基因与炎症性疾病患者相对正常人群的差异表达基因高度一致,同时与髓系相对淋巴系细胞的差异表达基因同样高度一致.上述结果表明多发性硬化患者外周全血中观察到的基因表达的改变可能是由于髓系/淋巴系细胞构成比例改变所致,是非特异的炎症性改变. 相似文献
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