转录因子FOXP2调控先天性巨结肠相关基因表达的生物信息学分析

目的鉴定与肠神经系统发育以及先天性巨结肠(HSCR)发生相关的转录因子。方法运用ChEA3数据库对调控HSCR易感基因表达的转录因子进行预测以及富集分析,使用GeneMANIA在线工具构建转录因子与靶基因的蛋白-蛋白相互作用网络图,探讨其可能调控的分子通路,以Human Protein Atlas数据库对转录因子进行蛋白表达定位,探究其在神经系统和结肠的表达情况。采用实时荧光定量PCR方法,验证相关转录因子在30例HSCR患儿的狭窄段和扩张段肠管标本中的表达差异。结果用ChEA3数据库对已报道的119个HSCR易感基因的转录因子预测及富集分析发现,FOXP2可以靶向作用于其中46个基因。在GeneMANIA数据库中分析显示FOXP2可能调控多个HSCR易感基因的表达,与Hedgehog通路的GLI3共表达,与PTCH1存在遗传相互作用。Human Protein Atlas数据库分析显示,FOXP2蛋白在脑神经元细胞和结肠组织中高表达。30例HSCR患儿中位年龄为1岁,其中男23例、女7例,荧光定量PCR结果显示,FOXP2的mRNA表达量在病变组织较临近正常组织下降,差异有统计学意义(t=5.819,P0.001)。结论 FOXP2可能通过调控Hedgehog信号通路,影响肠神经细胞发育过程,与HSCR的发病相关。     

巨细胞病毒相关性胆道闭锁患儿临床特征分析

摘 要：目的:描述中国胆道闭锁（BA）患儿巨细胞病毒（CMV）感染的流行情况，分析CMV IgM阳性和CMV IgM阴性胆道闭锁的临床特点。方法: 纳入2007年3月至2021年12月，在上海交通大学医学院附属新华医院接受Kasai手术治疗的281例胆道闭锁患儿，收集BA患儿的基本资料和临床资料，包括年龄、性别、出生月份、CMV感染情况和肝脏生化指标等，回顾性分析BA患儿CMV感染的情况，比较CMV IgM阳性与CMV IgM阴性BA患者之间的临床差异。结果: 281例BA患儿中，CMV IgM阳性患儿106例占37.72%；CMV IgM阳性患儿的手术时年龄（72.5（63-86）天）显著大于CMV IgM阴性患儿（59（47-69）天；P < 0.0001）。11月份出生的CMV IgM阳性患儿例数显著多于CMV IgM阴性患儿（13.21% vs. 5.71% ; P = 0.0294）。CMV IgM阳性BA患儿出生于冬季（11月～1月）的发病率是夏季（6～8月）的1.6倍，但无统计学差异。单因素分析结果提示，CMV IgM阳性BA患儿的胆汁酸、天冬氨酸氨基转移酶、碱性磷酸酶、总胆红素和直接胆红素水平高于CMV IgM阴性BA患者，差异均有统计学意义（P < 0.05）。CMV IgM值与与各项生化指标无线性相关关系。结论: 中国BA患儿CMV IgM阳性率为37.72%，出生于11月最常见，但无季节性聚集；相比CMV IgM阴性BA，CMV IgM阳性BA患儿手术时年龄更大，胆汁酸、天冬氨酸氨基转移酶、碱性磷酸酶、总胆红素和直接胆红素水平更高。