基于高通量测序数据的微生物检测算法研究进展

新一代高通量测序技术的发展,推动了多个相关研究领域的发展。国际上许多研究机构正在研究利用高通量测序数据进行微生物检测的算法,目前已有一些基于高通量测序数据的微生物检测算法流程设计成功并公开发布。该文通过调研利用高通量测序数据进行微生物检测的相关文献,研究已发布的基于高通量测序数据的微生物检测算法的功能和实现流程,分析几个有代表性算法的优点和不足。最后,对这些检测算法的设计思路进行总结和分类,提出基于高通量测序数据的微生物检测算法的改进设想。     

ER、PR的表达与乳腺癌患者化疗相关认知障碍的相关性研究

目的：探讨雌激素受体( ER)和孕激素受体( PR)与乳腺癌患者化疗相关认知障碍( CICI)的相关性。方法60例术后辅助化疗后乳腺癌患者作为乳腺癌组,其中 ER 和PR双阴性患者30例为A组、ER和PR双阳性患者30例为B组;另以年龄及教育程度相匹配的60例健康女性志愿者为对照组。分别对其进行简易精神状态量表( MMSE)和中文听觉词语学习测验( AVLT)测查。结果乳腺癌组与对照组MMSE成绩相比差异有统计学意义( t =-12．824, P <0．05);A组和B组在MMSE、即刻记忆和延迟记忆成绩方面差异均有统计学意义( t=-3．311、-3．616、-2．264, P<0．05)。结论化疗后乳腺癌患者存在不同程度的认知功能障碍,且ER和PR双阴性患者在总体认知功能及记忆方面损害较ER和PR双阳性患者显著( P<0．05),提示ER、PR的不同表达可能与乳腺癌CICI的异质性有关。     

circZFR促进HT29和LOVO细胞增殖和迁移

目的 研究环状RNA锌指样RNA结合蛋白(circular RNA zinc finger RNA binding protein,circZFR)在结直肠癌(colorectal cancer,CRC)组织及细胞系中表达及其对HT29和LOVO细胞增殖和迁移能力的影响.方法 应用GEO2R软件分析circZFR在Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中结直肠癌相关数据集GSE 126094及GSE 147597中的表达;实时荧光定量PCR检测circZFR在收集的50例结直肠癌组织样本以及其在结直肠癌细胞系中的表达;在HT29和LOVO细胞中转染circZFR特异性短发夹RNA(short hairping RNA,shRNA),同步转染对照(negative control shRNA,shNC),RT-qPCR验证转染效率;克隆形成实验(colony formation assay)及Transwell实验(transwell assay)检测不同circZFR表达水平对HT29和LOVO细胞增殖及迁移能力的影响.结果 在GSE 126094中,circZFR在结肠癌组织中的表达明显高于其在正常结直肠组织中的表达;在GSE147597中,circZFR在合并肝转移的结直肠癌组织中表达高于无肝转移的结直肠癌组织;circZFR在收集的结直肠癌组织中的表达大部分(44/50,88.00％)高于相应的癌旁组织;相比于正常肠上皮细胞系NCM460,circZFR在结直肠癌细胞系中的表达升高;在HT29和LOVO细胞中转染circZFR siRNA后,circZFR的表达水平明显下调;下调circZFR的表达可明显抑制HT29和LOVO细胞的增殖和迁移能力.结论 circZFR在结直肠癌组织及细胞系中表达增高,在HT29和LOVO细胞中下调circZFR的表达可明显抑制细胞的增殖及迁移能力.     

肝嗜铬细胞瘤1例报告

正嗜铬细胞瘤是一种起源于肾上腺嗜铬细胞的神经内分泌肿瘤,它可以持续或间断分泌儿茶酚胺,包括去甲肾上腺素、多巴胺及肾上腺素。肾上腺外来源的嗜铬细胞瘤称为转移性嗜铬细胞瘤。嗜铬细胞瘤典型的临床表现有血压异常波动、心悸、头疼等,严重者可导致高血压危象,危及生命。本文报道了1例位于肝右后叶的嗜铬细胞瘤的青年患者,并讨论了临床表现、影像学表现、组织学病理和治疗方法。1病例资料     

微型金属螺钉治疗骨性锤状指的临床体会

目的 探讨微型金属螺钉治疗骨性锤状指畸形的疗效。方法 12例骨性锤状指畸形患者,采用手指背侧“S”形切口显露骨折断端,应用微型金属螺钉固定末节指骨骨折块。术后以低温塑料夹板行单指固定,4周后去除外固定并开始循序渐进的功能锻炼,早期练习程度以患指轻度肿胀为止,晚期根据X线片显示的骨折愈合情况予以加强,术后随访时采用Dargan功能评定标准评定治疗效果。结果 12例全部获得随访,切口均一期愈合,未出现伤口感染,关节无明显疼痛,通过4～20个月的随访,治疗效果优良率为91.7%。结论 微型金属螺钉治疗骨性锤状指的操作方法简便易行,术后患指可以早期活动,避免了关节僵直及皮肤感染等并发症,功能恢复效果肯定,值得推广。     

基于新机制的抗乙肝病毒药物的研究进展

乙型肝炎是由乙型肝炎病毒感染引起的,以肝脏炎症和坏死病变为主的一种全身性感染病。因其高致死率在世界范围内引起广泛被关注,在我国更是一个严重的医疗卫生问题。目前为止有多种治疗乙肝的药物已应用于临床但未达到理想疗效,同时有许多药物正处于研发阶段,并且乙型肝炎的治疗理念也在不断地更新。针对基于新机制的抗乙肝病毒药物的研究近况进行综述,以期为临床用药提供参考。     

征稿通知

指骨关节内骨折为手外科常见外伤,一般常规手术治疗能达到满意效果.但有些不当处理会导致骨折畸形愈合、骨不连、关节肿大、疼痛等,严重者可导致手指功能部分或完全丧失.治疗上主张以缓解疼痛、纠正畸形、重建手指功能为主,一般可根据病情及医生经验采用内或外固定手术矫正.畸形较轻、时间较短、周围软组织条件较好者可一次矫正,反之分次矫正.我们于2009年12至2012年12月采用手术截骨矫形、AO皮质骨螺钉加压内固定治疗10例手指指间关节内骨折畸形愈合患者,疗效满意,报告如下.     

联合内固定治疗Ⅲ度肩锁关节脱位

肩锁关节脱位是常见的肩部运动性损伤,约占肩部损伤的12%.治疗时要求复位内固定及修复喙锁韧带,治疗不当会导致肩关节不稳、关节僵硬等并发症.我们采用Roekwood分型方法[1],自2002年～2006年10月,收治肩锁关节脱位44例,切开复位内固定及喙锁韧带动力性重建治疗,取得良好效果,现报道如下.     

湘西少数民族地区高血压知晓率、治疗率和控制率现状及其影响因素

目的  了解湘西少数民族地区高血压知晓率、治疗率和控制率现状, 探讨其可能的影响因素。 方法  应用多阶段随机抽样方法抽取湘西少数民族地区≥35岁的428名个体进行调查, 分析高血压患者高血压知晓、治疗和控制情况, 并采用多因素Logistic回归分析模型分析其可能的影响因素。 结果  湘西少数民族地区高血压患病率、知晓率、治疗率和控制率分别为52.34%(95%CI:47.6%~57.1%)、59.38%(95%CI:52.9%~65.9%)、44.20%(95%CI:37.6%~50.8%)和8.48%(95%CI:4.8%~12.2%)。多因素Logistic回归分析模型结果显示, 年龄是高血压知晓率、治疗率和控制率的共同影响因素(均有P < 0.05)。男性(OR=2.481, 95%CI:1.308~4.703)高血压知晓率低于女性; 超重者和每年至少测量一次血压者其高血压知晓率和治疗率较高(均有P < 0.05)。而有慢性疾病史者(OR=0.269, 95%CI:0.090~0.808)高血压控制率高于无慢性疾病史者。 结论  湘西少数民族地区35岁及以上居民高血压知晓率、治疗率和控制率总体上仍处于较低水平, 尤其是血压控制率低。     

联合内固定治疗Ⅲ度肩锁关节脱位

肩锁关节脱位是常见的肩部运动性损伤,约占肩部损伤的12%,治疗时要求复位内固定及修复喙锁韧带,治疗不当会导致肩关节不稳、关节僵硬等并发症。我们采用Rockwood分型方法,自2002年-2006年10月,收治肩锁关节脱位44例,切开复位内固定及喙锁韧带动力性重建治疗,取得良好效果,现报道如下。