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71.
利用cDNA微阵列进行宫颈鳞癌的分子筛查 总被引:1,自引:0,他引:1
目的使用cDNA微阵列筛选浸润性宫颈鳞癌的淋巴结转移相关基因。方法应用包含18 432个基因的cDNA微阵列测定IB期宫颈鳞癌的全基因序列,包括已知功能的人类转录子和表达序列标签ESTs,分为正常组、淋巴转移组、无淋巴转移三组宫颈组织。为了证实不同的基因表达,选择3个基因进行了冰冻组织的RT-PCR检测和石蜡组织的免疫组化检测。结果经统计学分析,与无淋巴转移浸润性宫颈鳞癌组织比较,有淋巴转移的癌组织有677个基因大于2倍差异,其中上调494个(72.97%),下调183个(27.03%),表达序列标签EST为61个(9.01%),这些基因涉及代谢、发育、信号传导、分化、DNA结合转录和离子通道等。6倍差异基因14个,其中只有nel(chicken)like-2下调,其余为上调基因。RT-PCR和免疫组化的结果与cDNA微阵列结果一致。结论利用cDNA微阵列检测基因的表达状态可以预测宫颈鳞癌淋巴结转移和宫颈癌的预后情况。Cx43的低表达、ETV5和整合素alpha 2的高表达可能会成为评估浸润性宫颈鳞癌恶性程度的重要指标。这些分子有利于预测浸润性宫颈鳞癌的预后及其相应的分子治疗。 相似文献
72.
层粘连蛋白受体基因表达谱分析 总被引:1,自引:0,他引:1
目的 探讨层粘连蛋白受体(67LR1)基因相关的一组基因表达变化,为反式二羟环氧苯并芘致癌机制的研究提供依据。方法 构建67LR1转基因表达载体,转染人支气管上皮细胞(16HBE),获得转基因67LR1的瞬时表达的细胞株。用半定量RT-PCR方法分析转基因表达产物,应用含8064个基因点的微芯公司基因表达谱芯片CSC-GE-80与双荧光标记样品与芯片杂交和扫描、图像数据分析等一系列处理进行表达谱分析。结果 成功构建出瞬时表达67LR1的细胞株。基因表达谱分析,2组相比发生了显著性表达变化的基因有295个,其中表现为上调的基因有145个,下调表达的基因有150个。在发生了显著性表达改变的基因中,比较有明显功能分类特征的包括与信号转导相关的基因,与肿瘤相关的基因,与免疫反应相关的基因以及与蛋白质合成系统相关的基因等。结论 67LR1基因功能涉及到信号转导、肿瘤相关基因等方面,相关基因的表达变化具有复杂性。 相似文献
73.
目的 应用基因芯片技术,阐明低剂量三氧化二砷作用于肝HepG2细胞之后,无机砷对差异表达基因的调节作用。方法 应用基因表达谱芯片技术,对5μmol/L三氧化二砷诱导的HepG2细胞和以生理盐水处理的相同细胞的mRNA进行差异显示分析,研究三氧化二砷诱导人HepG2细胞后的差异表达基因。结果 HepG2细胞经5μool/L三氧化二砷诱导后。所检测的4096条目的基因中有123条产生差异表达,其中48条基因表达上调,75条基因表达下调。结论 应用基因表达谱芯片成功筛选了低剂量三氧化二砷诱导肝细胞后的差异表达基因,无机砷对肝细胞有双向调节作用。 相似文献
74.
目的:分析人卵巢癌SKOV3/TPT多药耐药的分子机制,寻找可能参与拓扑替康(TPT)耐药机制的新基因。方法:采用大剂量间歇诱导法,对SKOV3细胞株用TPT反复冲击诱导培养,获得稳定的SKOV3/TPT;利用Affymetrix U133A基因表达谱芯片,比较SKOV3及SKOV3/TPT细胞的基因表达;从中选择高表达的MRP3基因进行RT-PCR验证。再将MRP3反义及正义寡核苷酸片段分别用脂质体转染进耐药细胞,用MTT法、流式细胞仪及半定量RT-PCR检测体外转染后细胞内TPT的荧光强度、耐药指数及MRP3 mRNA表达的改变。结果:基因芯片检测发现,有7个差异表达基因可能参与了SKOV3/TPT细胞的耐药,其中4个基因被上调,3个基因被下调,MRP3为上调最明显的基因。MRP3反义寡核苷酸转染SKOV3/TPT细胞后,可明显降低细胞内TPT的浓度及耐药指数(P<0.05),细胞内MRP3 mRNA的表达较未转染细胞下降了60.16%(P<0.05)。结论:SKOV3/TPT细胞耐药表型的形成涉及多个基因表达的改变。MRP3的高表达导致细胞内药物浓度降低,可能是卵巢癌细胞对TPT耐药的主要原因。 相似文献
75.
Katrin Trummal Külli T?nism?gi Ene Siigur Anu Aasp?llu Annika Lopp Tarvo Sillat Riste Saat Lagle Kasak Indrek Tammiste Priit Kogerman Nisse Kalkkinen Jüri Siigur 《Toxicon》2005,46(1):46-61
A novel endothelial cell apoptosis inducing metalloprotease (VLAIP) was found in the snake venom of Vipera lebetina. This metalloprotease is a heterodimeric glycoprotein with molecular mass of about 106 kDa. The protease hydrolyzes azocasein, fibrinogen and oxidized insulin B-chain. The enzyme readily hydrolyzes the Aalpha-chain and more slowly Bbeta-chain of fibrinogen. VLAIP does not cleave fibrin. The complete amino acid sequences of the two different monomers of VLAIP are deduced from the nucleotide sequences of cDNAs encoding these proteins. The full-length cDNA sequences of the VLAIP-A and VLAIP-B encode open reading frames of 616 and 614 amino acids that include signal peptide, propeptide and mature metalloproteinase with disintegrin-like and cysteine-rich domains. VLAIP belongs to the metalloprotease/disintegrin family of reprolysins and has high identity with the proteins that induce apoptosis of endothelial cells. Treatment of HUVEC cells with VLAIP induces changes in the attachment of cells to the substrate and causes cell death. We demonstrated that VLAIP inhibits endothelial cell adhesion to extracellular matrix proteins: fibrinogen, fibronectin, vitronectin, collagen I, and collagen IV. The induction of apoptosis by VLAIP was shown by means of a typical DNA fragmentation pattern of apoptotic cells as well as by monitoring phosphatidylserine externalization using annexin V-FITC staining and flow cytometric analysis. 相似文献
76.
Objective: To diagnose prostatic cancer (CAP) with cDNA macroarray. Methods: Total RNA was isolated from patients with prostate cancer and from normal people, and poly(A) RNA was further purified. Then differentially expressed genes were analysed in CaP and normal prostate by cDNA macroarray system. Results: There were differential expressions of nine prostate-associated specific genes in CaP as compared with normal prostate, among which, 7 were significantly up-regulated and 2 were down-regulated. Conclusion: As a diagnostic approach at molecular level, the cDNA macroarray is supposed to elevate the detection rate of CaP. 相似文献
77.
黄芩苷对局灶性脑缺血大鼠脑组织基因表达谱的影响 总被引:6,自引:0,他引:6
目的 :研究黄芩苷对局灶性脑缺血大鼠脑组织基因表达谱的影响 ,探索黄芩苷治疗脑缺血的药理作用机制。方法 :分别从假手术组、局灶性脑缺血组、黄芩苷治疗组SD大鼠的脑组织中抽提总RNA ,Cy3 ,Cy5荧光标记 ,反转录分别合成cDNA探针后 ,与含有 4096条大鼠基因的BioStar基因表达谱芯片杂交 ,AxonGenepix 40 0 0B扫描仪扫描 ,GenePixPro 3 .0软件分析表达信号。结果 :大鼠局灶性脑缺血组差异表达的基因有 211条 ,其中 12条基因上调 ,199条基因下调。黄芩苷治疗后差异表达的基因有 177条 ,其中有 89条基因上调 ,而 88条基因下调。进一步分析发现 ,1个在模型组下调的基因经黄芩苷治疗后上调 ,3个在模型组上调的基因经黄芩苷治疗后下调 ,3个在模型组上调的基因经黄芩苷治疗后表达进一步增强。结论 :在基因组水平上黄芩苷可能通过多基因 ,多途径调节大鼠脑缺血基因表达谱而发挥药理作用。 相似文献
78.
We identified novel 10 multi-cysteine peptides, namely Magi 7-16, from the spider Macrothele gigas by simple random cDNA screening of the venom gland. Mass analysis of the crude venom detected the mass numbers of the cross-linked forms of all peptides, confirming their presence in the venom. Magi 11, a C-terminus amidated peptide, was chemically synthesized and was indistinguishable from the native peptide proving the feasibility of the method for peptide identification. Moreover, toxicological assays showed diverse lethal or paralytic activities of these peptide toxins on mice and/or insects. 相似文献
79.
目的:通过超高速细胞分选平台结合cDNA microarray技术,筛查宫颈癌细胞可能潜在的分子标志物。方法:采用MoFlo XDP型超高速细胞分选平台纯化细胞膜表面表达CD38和不表达CD38的宫颈癌细胞,利用RNAlater技术得到cDNA microarray实验所需RNA,然后进行基因芯片分析。结果:利用MoFlo XDP型超高速细胞分选平台可以获得纯度为99.0%以上的CD38阳性表达宫颈癌细胞。结论:cDNA microarray分析发现了RORA、PLIN4、AUTS2、IFITM1等宫颈癌细胞潜在分子标志物,为宫颈癌研究提供了新的技术方法。 相似文献
80.
目的通过RACE(rapid amplification of cDNA Ends)技术分析K-562细胞株中高表达的EDAG-1基因3'端。方法采用Marathon-Ready^TMcDNA方法扩增HLCMcENA(人白血病细胞株K-562,Marathon-Ready^TM cDNA)的EDAG-1基因3'端,将扩增的特异带回收纯化,构建到原核表达载体中,提取质粒并且测序分析。结果第1次扩增、第1次巢式PCR扩增未见明显特异带,2次巢式PCR结果可见200bp特异带,回收后连接到pMD18-T中,转化到大肠杆菌中并筛选阳性菌落,提取质粒测序,结果未发现该段序列存在点突变、插入或缺失。结论EDAG-1基因在白血病细胞株K-562中高表达的机制可能与3’端无关。 相似文献