The inflammasome: Learning from bacterial evasion strategies

The innate immune system plays a critical role in defense against microbial infection and employs germline-encoded pattern recognition receptors to detect broadly conserved microbial structures or activities. Pattern recognition receptors of the nucleotide binding domain/leucine rich repeat (NLR) family respond to particular microbial products or disruption of cellular physiology, and mediate the activation of an arm of the innate immune response termed the inflammasome. Inflammasomes are multiprotein complexes that are inducibly assembled in response to the contamination of the host cell cytosol by microbial products. Individual NLRs sense the presence of their cognate stimuli, and initiate assembly of inflammasomes via the adaptor protein apoptosis-associated speck-like protein containing a caspase recruitment domain (ASC) and the effector pro-enzyme caspase-1. Inflammasome activation leads to rapid release of pro-inflammatory mediators of the IL-1 family as well as the release of intracellular alarmins due to a lytic form of programmed cell death termed pyroptosis. Over the past 15 years, a great deal has been learned about the mechanisms that drive inflammasome activation in response to infection by diverse pathogens. However, pathogens have also evolved mechanisms to evade or suppress host defenses, and the mechanisms by which pathogens evade inflammasome activation are not well-understood. Here, we will discuss emerging evidence on how diverse pathogens evade inflammasome activation, and what these studies have revealed about inflammasome biology. Deeper understanding of pathogen evasion of inflammasome activation has the potential to lead to development of novel classes of immunomodulatory factors that could be used in the context of human inflammatory diseases.     

北京部分市售整鸡中沙门菌和弯曲菌协同定量污染研究

目的对2013年北京部分市售整鸡样品中沙门菌和弯曲菌的定量污染水平、沙门菌血清型和弯曲菌种水平分布进行研究。方法 2013年5—7月采集北京市售整鸡样品33份,进行样品中沙门菌和弯曲菌的定量检测,并分别对沙门菌和弯曲菌进行血清分型和种水平鉴定。结果 19个样品检出沙门菌,检出率为57.6%;5个样品检出弯曲菌,检出率为15.2%;阳性样品中沙门菌和弯曲菌平均污染水平分别为119.4 MPN/100g和58.6 CFU/g。分离出的166株沙门菌被鉴定为14种血清型,最常见的为肠炎沙门菌,其次为印第安纳沙门菌。从同一样品中分离到共11种2个以上不同血清型组合的沙门菌,最常见的血清型组合为肠炎-印第安纳沙门菌。结论 2013年5—7月北京部分市售整鸡中沙门菌污染率较高、污染水平严重、血清型复杂。     

2011—2013年北京某城区感染性腹泻患者致病菌检测分析

目的分析北京某城区2011—2013年感染性腹泻患者致病菌分布及脉冲场凝胶电泳(PFGE)图谱特征,为感染溯源提供依据。方法收集2011年1月—2013年12月该区域肠道门诊感染性腹泻患者粪便标本1 179份,对其培养分离的致病菌进行血清分型及PFGE分析。结果 1 179份标本,共培养肠道病原菌330株,其中检出居前4位的肠道致病菌依次为志贺菌属93株(28.18%)、沙门菌属69株(20.91%)、副溶血性弧菌44株(13.33%)及致泻性大肠埃希菌11株(3.33%)。18株宋内志贺菌PFGE分为8个型别,聚类相似度接近88%;69株沙门菌属细菌分为18个血清型,共41种PFGE型别,其中山夫登堡沙门菌和肠炎沙门菌具有明显的优势带型;23株副溶血性弧菌PFGE型别较为分散。结论 3年间感染性腹泻患者致病菌的血清型和PFGE带型分布较为广泛,应注意沙门菌属和志贺菌属细菌的PFGE优势菌型,警惕其引发的感染性腹泻暴发流行。     

成都市人源沙门菌基因组特征分析

目的 基于全基因组测序技术,探究成都市人源沙门菌的基因组特征, 为监测与预防沙门菌感染提供资料。方法 收集35株成都市人源沙门菌(分离自腹泻患者粪便)进行全基因组测序。根据测序数据,进行血清型预测、耐药基因及可移动遗传元件预测、毒力因子注释及分布分析。结果 35株沙门菌分离株经全基因组测序,共预测到5种血清型,包括15株I 4,[5],12:i:-沙门菌(13株为ST34、2株为新ST型)、12株鼠伤寒沙门菌(ST19)、5株肠炎沙门菌(ST11)、2株德比沙门菌(ST40)与1株火鸡沙门菌(ST463)。35株沙门菌分离株共预测到10类42种不同的耐药基因,其中氨基糖苷类aac(6')-Iaa携带率为100%(35/35)。I 4,[5],12:i:-沙门菌的耐药基因、质粒及插入序列数目及种类多于其他血清型菌株。I 4,[5],12:i:-、鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌的毒力因子数目大于其他血清型菌株。部分鼠伤寒沙门菌有更高的毒力质粒、质粒编码菌毛和血清抗性毒力因子分布。结论 成都市人源沙门菌不同血清型菌株之间耐药基因、可移动遗传元件、毒力因子分布差异明显,值得在转录组、蛋白组进一步探究其耐药与毒力机制。     

基于全基因组测序的甲型副伤寒沙门菌暴发疫情分离株分子特征研究

目的 分析一起甲型副伤寒暴发疫情菌株的分子分型特征,为病原菌的确定和暴发疫情的防控提供科学依据。方法 利用生化试验、血清学试验对病原菌进行鉴定,并将分离到的病原菌进行微量肉汤稀释法药物敏感性试验、PFGE分子分型分析、全基因组测序,利用全基因组数据与沙门菌MLST标准数据库比对获得序列型别(ST)、cgMLST序列号以及rMLST序列号并进行聚类分析,通过细菌基因组分析平台fIDBA分析病原菌的耐药、毒力相关基因。结果 11株沙门菌血清型均为甲型副伤寒沙门菌,具有100%相似性的PFGE带型,MLST、cgMLST、rMLST的型别均分别为ST129型、cgST-2191型、rST3678型,表明此次暴发疫情菌株从分子特征角度可诊断为同一传染源导致。对萘啶酸100%耐药,对链霉素100%中介。发现本次疫情菌株基因组均携带29种耐药基因。通过毒力因子数据库比对,均携带21类250种已知毒力基因,其中以Ⅲ型分泌系统、粘附、鞭毛等最为常见。结论 本次暴发疫情是由共同来源的、具有相同分子分型特征的甲型副伤寒沙门菌引起。在病原溯源研究中,应用全基因组数据可更精细分析菌株遗传进化特征、亲缘关系及毒力基因、耐药基因携带情况,可以作为替代PFGE、MLST的技术用于更精准的传染病分子流行病学调查分析研究。     

济南市腹泻患者沙门氏菌PFGE分子分型及耐药特征研究

目的 对2017-2020年济南市哨点医院腹泻患者中分离到的沙门氏菌进行病原学分析,了解济南市腹泻患者沙门氏菌的血清型分布特征、分子分型特征及耐药情况。方法 分别利用血清检测试剂盒和脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)对来自济南市各医院腹泻门诊病人的的90株沙门氏菌进行血清分型和分子分型分析,酶切电泳图谱导入BioNumerics软件进行聚类分析;利用微量肉汤稀释法对40株沙门氏菌进行耐药性检测。结果 90株沙门氏菌可分为27个血清型,鼠伤寒沙门氏菌和肠炎沙门氏菌为优势血清型,分别占总数的47.78%和17.78%。PFGE电泳后产生的带型具有多态性,以鼠伤寒沙门氏菌和肠炎沙门氏菌的带型最为集中;药敏结果显示,沙门氏菌对氨苄西林耐药率最高,为72.50%,多重耐药率达67.50%。结论 济南地区沙门氏菌具有血清型多样化和遗传多样性特征,对抗生素的高耐药和多重耐药现象严重,应加强济南地区耐药检测。     

2008—2013年北京市17株伤寒和副伤寒沙门菌耐药和分子分型研究

目的分析2008—2013年北京市17株伤寒、副伤寒沙门菌耐药及分子分型。方法对2008-2013年通过对北京市肠道门诊监测系统分离到的17株伤寒、副伤寒沙门菌进行生化鉴定、血清分型并运用纸片法进行药敏检测;利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型。结果 17株伤寒、副伤寒沙门菌对三代头孢菌素类药物头孢他啶敏感率达100%,头孢噻肟和头孢曲松敏感率均为93.75%,对氟喹诺酮类药物环丙沙星敏感率为93.75%,萘啶酸耐药率达31.25%。其中16株伤寒、副伤寒沙门菌可分为15种PFGE带型,带型分布较分散。结论北京市伤寒、副伤寒沙门菌分离株对3代头孢类抗生素及环丙沙星敏感;PFGE分子型别较多,无聚集性。     

鼠伤寒杆菌核糖体制剂用作血吸虫抗原佐剂的探讨

目的：探讨鼠伤寒杆菌核糖体制剂对血吸虫抗原的佐剂作用。方法：小鼠分别用鼠伤寒杆菌核糖体制剂（ＳＴＲＰ）加日本血吸虫成虫抗原（ＳＷＡ）和日本血吸虫成虫抗原免疫后，其体液免疫水平用ＥＬＩＳＡ检测，保护性免疫力用减虫率表示。结果：用ＳＴＲＰ＋ＳＷＡ免疫的小鼠的抗体水平显著高于单用ＳＷＡ免疫的小鼠。尾蚴攻击感染后，ＳＴＲＰ＋ＳＷＡ免疫组小鼠和ＳＷＡ免疫组小组的减虫率，分别为４７％和１７％，前者高于后者。结论：ＳＴＲＰ可以增强小鼠对血吸虫抗原的体液免疫应答反应，并且可诱导小鼠产生较强的抗尾蚴攻击感染能力。     

Carcinogenic activity in mice of diftalone,an anti-inflammatory agent

Summary The anti-inflammatory agent diftalone was administered in the diet to male and female BALB/c mice at 300-, 600-, and 1200-ppm dose levels for 80 weeks, starting at 8 weeks of age. The animals were kept under observation until 126–128 weeks of age, when the experiment was terminated. Diftalone treatment at the highest dose was hepatotoxic and induced hepatocellular tumors in females, angiomas of the liver in males, and angiosarcomas of the liver in male and female mice. The 300- and 600-ppm dose levels were not carcinogenic. The compound was not mutagenic for Salmonella typhimurium.     

Five cases of non-typhoidal Salmonella endovascular infection

The incidence of human non-typhoidal Salmonella (NTS) infection has increased in many countries. Endovascular infection is one of the most serious forms of extraintestinal infection. Five patients with NTS endovascular infection treated at Middlemore Hospital, Auckland, New Zealand, are presented here. All persons with NTS bacteraemia who are older than 50 years and have a risk of atherosclerosis should be evaluated for possible endovascular infection.