正确使用数的修约规则

在生物医学领域的各种研究中,对实验检测和计算所得的数据往往都要进行修约。过去习惯使用“四舍五入法”进行数的修约,该方法是不正确的,我们应将其废除。根据国家标准《出版物上数字用法的规定》,数的修约应遵照“四舍六人”的法则进行,下面作一介绍,请广大作者遵照执行。     

曹志群辨治溃疡性结肠炎用药规律分析

目的：运用数据挖掘方法总结曹志群教授治疗溃疡性结肠炎（UC）的用药规律。方法：收集167例曹志群治疗UC的门诊病案,使用Microsoft Excel 2016建立规范化数据库,进行频数分析,运用IBM SPSS 23.0、IBM SPSS Modeler 14.1对出现频率>20%的中药进行因子分析、关联规则分析。结果：167首临床处方共涉及中药107味,高频药物有黄芪、薏苡仁、败酱草、乌梅、仙鹤草、当归、木香、黄连等,功效以补虚、清热、止血为主,药性以温、寒为主,药味以苦、辛、甘为要,归经以肝、脾、胃为最;关联规则主要为薏苡仁、黄芪、败酱草、当归、乌梅与其他药物的配伍,因子分析共得到8个公因子。结论：曹志群根据UC脾虚湿蕴-湿热瘀阻-奇经虚损的病机演变过程,以健脾祛湿作为基本治则,辅以清热利湿、凉血止血、益气养血、祛瘀导滞等治法,疗效良好。     

肠道菌群对男性生殖与性健康的因果关系

目的:应用两样本MR方法挖掘211种肠道菌群对男性生殖与性健康的因果关系。方法:采用MiBioGen联盟发布的全基因组关联研究(GWAS)相关遗传变异数据作为肠道菌群的工具变量(IVs),芬兰生物样本库GWAS相关遗传变异数据分别作为男性不育症、畸形精子症、性功能障碍、勃起功能障碍、睾丸功能障碍的IVs。使用逆方差加权法作为MR分析方法,根据效应指标优势比和95%置信区间评估结果,并进行数据敏感性分析。结果:分别发现6种与男性不育症相关、12种与畸形精子症相关、5种与性功能障碍相关、4种与勃起功能障碍、4种与睾丸功能障碍有关的肠道菌群,且数据敏感性分析无异常,因果方向均正确。结论:肠道菌群与男性生殖与性健康密切相关。     

大口黑鲈POU1F1启动子区域SNPs对生长的影响

采用基因组步移技术克隆了大口黑妒垂体特异性转录因子POUlFl启动子序列,该序列全长1629by,预测存在4个八聚体转录因子1(Oct-1)结合位点和TATA框等基本转录元件,1个Homeobox转录因子结合位点和2个cAMP反应元件结合蛋白(CREB)结合位点.采用直接测序法研究发现,大口黑鲈POUlFl启动子序列的-18和-183两个位点存在SNPs,该两个突变位点只检测到A、B两种单倍型.对养殖群体进行不同单倍型的基因频率和生长关联分析,结果表明,单倍型A的等位基因频率为0.246,单倍型B的等位基因频率为0.754;群体关联分析表明,基因型为AA型和AB型的个体在体质量、体长、全长、体高和体宽等方面明显高于BB型个体,但基因型为AB型和AA型的个体之间在体质量方面没有明显差异.该研究结果为下一步进行分子标记辅助选择提供了基础.     

基于聚类分析的肺癌与基因相关关系研究

目的：研究与不同类型肺癌存在关联的基因及其与肺癌的关联,为肺癌相关基因领域的研究学者提供参考。方法：通过对肺癌、基因进行命名实体识别、实体数据的标准化处理、肺癌-基因矩阵构建、肺癌-基因矩阵的聚类分析、文献回溯等,基于聚类的方法发现不同类型肺癌存在关联的基因及其在肺癌不同阶段的具体关联。结果：利用聚类分析的方法将肺癌大致分为A549 lung cancer,Advanced non-small-cell lung cancer,small cell lung carcinoma四大类。高频基因主要是EGFR（在晚期非小细胞肺癌患者体内突变率较高）、P53（主要在NSCLC晩期患者中高水平突变表达）、KRAS（主要与NSCLC有关）。结论：基因、蛋白质、化学物质等实体对肺癌的产生与治疗至关重要。深入探究肺癌与基因的关系对肺癌的预防、诊断、治疗均有重要意义。     

基于关联规则的川乌配伍规律分析

目的:基于关联规则和因子分析探讨川乌用药配伍规律。方法:以川乌为主题,在中国知网数据库进行搜索,纳入符合标准的文献107篇,使用Excel 2013、SPSS Modeler 14.1、SPSS Statistics 21.0统计软件为工具,对符合纳入标准的中药进行频数分析、关联规则分析和因子分析。结果:频数分析发现,内服方共62首,外用方45首。在性味统计中,以辛、苦、甘,温、热、平最为常见,归经以肝经、心经、脾经最为常见;主治疾病中以风湿类、骨科类、神经类居多;关联规则分析中得到关联强度最高的药对组合各10组;因子分析内服方得到公因子10个,外用方得到公因子9个。结论:通过现代信息技术统计分析,明确川乌常用药对,发现其减毒增效的配伍规律,为有毒中药的临床应用提供依据,为新处方研发提供新思路。     

基于深度学习的用户健康词表构建方法研究

对基于深度学习的用户健康词表构建方法进行系统探索,阐述实验工具、过程及结果,对利用深度学习方法构建用户健康词表的适用性、结果影响因素进行探讨,指出该方法具有较高适用性但尚待提高应用成熟度。     

利用二代测序数据探索SPRY基因家族与中国人群非综合征型唇腭裂的关联

目的 探索SPRY基因家族中的单核苷酸多态性及亲源效应与中国人群非综合征型唇腭裂发病风险的关联。方法 研究基于病例-双亲设计,以2016—2018年于北京大学口腔医院募集的 183个中国人群非综合征型唇裂合并或不合并腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)核心家系(549人)为研究对象。利用其二代测序数据中的SPRY基因家族相关信息,展开单核苷酸多态性和亲源效应分析。该测序研究采用二阶段设计,第一阶段对24个家系进行全外显子组测序探索潜在阳性信号,第二阶段在159个家系的独立样本中对第一阶段结果进行验证。采用问卷调查收集NSCL/P患者及其父母的基本情况、患病情况、临床特征及孕期环境暴露等信息。收集患儿及其父母的血液并提取DNA进行基因检测以获取遗传信息。单核苷酸多态性分析采用传递不平衡检验,亲源效应分析采用Z检验,统计分析使用PLINK(v1.07)软件完成。第一阶段的多位点分析采用以家系为基础的序列核心关联检验方法,由R软件(v3.5.1)famSKAT-RC包完成。采用Bonferroni法对验证结果进行多重检验校正。结果 经过质量控制,第一阶段共有22个SPRY基因家族的位点纳入分析,结合位点的注释、功能预测结果及统计检验结果,纳入rs1298215244 (SPRY1)和rs504122 (SPRY2)两个位点进入二阶段验证。二阶段传递不平衡检验发现,rs1298215244: T>C、rs504122: G>C两种常见变异以及rs504122: G>T罕见变异与NSCL/P的关联达到Bonferroni多重检验校正后的显著性水平,位于SPRY1的rs1298215244: T>C其亲源效应矫正前具有统计学意义,但未能通过多重检验校正。结论 发现SPRY基因家族中的单核苷酸多态性与中国人群NSCL/P的发病风险存在关联,但未发现SPRY基因家族具有亲源效应。