学龄儿童肥胖与肠道菌群多样性及菌属丰度的关联研究

目的分析学龄肥胖儿童和正常体重儿童肠道菌群多样性差异, 识别肥胖儿童肠道特征菌属, 为后续相关机制研究和学龄儿童肥胖的防治提供依据。方法基于2016年在上海市嘉定区某小学建立的研究队列人群, 将2016-2018年3年均处肥胖状态的儿童共63名纳入肥胖组, 其中男生43名, 女生20名。在3年均为正常体重的儿童中, 根据年龄、性别和所在班级, 将其与肥胖组儿童进行1∶1匹配, 共选择63名纳入对照组。采用问卷收集儿童基本信息、饮食状况、母乳喂养等情况, 收集两组儿童的粪便样本并进行16S rDNA测序。对质量优化后的测序序列按照97%相似性进行可操作分类单元聚类及物种注释。分析肥胖组和对照组儿童肠道菌群多样性及菌属丰度差异。计算肠道菌群的Ace、Chao1、Shannon、Simpson 4种α多样性指数, 并利用主坐标分析, 在非加权Unifrac距离和加权Unifrac距离的基础上表示β多样性。使用相似性分析(ANOSIM)比较两组β多样性的差异。利用STAMP软件挑选出两组儿童共有菌属中的差异细菌, 并利用广义线性模型(GLM)分析肥胖与α多样性以及显著差异菌属的关联。结果肥胖组...     

藏汉不同骨密度人群肠道菌群及粪便短链脂肪酸差异研究

目的 比对研究四川红原藏族与成都汉族不同骨密度人群肠道菌群及粪便短链脂肪酸差异,为通过调节肠道菌群预防不同人群骨质疏松积累资料。方法 选取红原藏族与成都汉族居民,测定其足跟骨骨密度,收集粪便与人口学信息,以藏族低骨密度个体为基础,依据年龄、性别、民族、是否服用抗生素四个维度进行倾向性评分获得研究人群,并按骨密度水平分组,测定粪便16S rRNA序列及短链脂肪酸的浓度与构成比,对比分析各组的差异。结果 红原藏族肠道菌群的物种丰度高于成都汉族。与汉族人群相比,藏族人群拟杆菌门相对丰度较高,变形菌门相对丰度较低（拟杆菌门:z = - 4.156,P＜0.001;z = - 3.226,P = 0.001;z = - 2.990,P = 0.002;变形菌门:z = - 4.409,P＜0.001;z = - 3.287,P = 0.001;z = - 2.392,P = 0.016）。柯林斯菌属是藏族中骨密度组优势菌属,瘤胃球菌属2和乳球菌属分别是汉族中、高骨密度组优势菌属。两组人群粪便短链脂肪酸比较,藏族三组骨密度人群乙酸、异戊酸浓度均低于汉族人群（乙酸:t = - 3.119,P = 0.003;t = - 3.056,P = 0.003;t = - 5.104,P＜0.001;异戊酸:z = - 3.822,P＜0.001;z = - 3.497,P＜0.001;z = - 2.158,P = 0.031）,但高、中骨密度组异丁酸、异戊酸、戊酸和己酸构成比高于汉族人群（异丁酸:z = - 3.693,P＜0.001;z = - 3.388,P = 0.001;异戊酸:z = - 3.748,P＜0.001;z = - 3.844,P＜0.001;戊酸:z = - 3.778,P＜0.001;z = - 3.966,P＜0.001;己酸:z = - 2.535,P = 0.011;z = - 3.570,P＜0.001） 结论 红原藏族和成都汉族不同骨密度组的肠道菌群及粪便短链脂肪酸含量和构成比不同,其与骨密度的关系值得进一步探讨。     

长航人员肠道微生态平衡与疾病相关性研究进展

随着高通量测序技术的发展,越来越多的研究证实,肠道菌群与宿主共同进化,在维持机体免疫稳态中发挥重要作用。肠道菌群可以直接或通过代谢产物间接参与多种疾病的发生发展。研究人员根据肠道微生态与其他脏器间的相互关联,提出了“肠-脑轴”、“肠-肺轴”等学说,并在基础和临床研究领域得到广泛验证。长航人员容易发生肠道菌群紊乱,也经常出现其他健康问题。现阶段需积极开展相关研究,明确长航人员肠道菌群紊乱与健康状态的关系,探索合理的干预措施。维护肠道微生态平衡,对提高长航人员生活质量、预防疾病发生具有重要意义。     

肠道菌群介导生脉方对脓毒症小鼠的治疗作用

探究生脉方（Shengmai formula,SMF）对脓毒症小鼠组织损伤、血清炎症因子和外周血固有免疫细胞比例的作用;考察肠道菌群在SMF治疗脓毒症中的作用。灌胃0.3,0.6,1.2 g/kg或腹腔注射0.6 g/kg SMF 4 d后腹腔注射20 mg/kg脂多糖（LPS）建立脓毒症模型,考察小鼠生存率,通过H&E染色观察小鼠肝、肺、肾组织病理改变,检测血清IL-6、TNF-α、谷丙转氨酶（ALT）、谷草转氨酶（AST）、尿素氮（BUN）和肌酐（Cr）水平;建立LPS和盲肠结扎穿刺（CLP）脓毒症模型,通过流式细胞术检测SMF灌胃或腹腔注射对外周血单核细胞、巨噬细胞和中性粒细胞比例的影响;考察抗生素（ABX）处理对SMF灌胃治疗脓毒症的影响;考察SMF灌胃小鼠的粪菌对脓毒症的治疗作用。结果表明,SMF灌胃显著提高LPS模型小鼠生存率,减轻肝、肺、肾损伤和炎性浸润,降低血清IL-6、ALT、AST、BUN、Cr水平;显著降低LPS模型24 h外周血巨噬细胞比例,下调CLP模型24 h外周血单核、巨噬细胞和中性粒细胞比例。SMF腹腔注射对脓毒症模型上述指标均无显著作用。ABX...     

Acute cytomegalovirus infection modulates the intestinal microbiota and targets intestinal epithelial cells

Primary and recurrent cytomegalovirus (CMV) infections frequently cause CMV colitis in immunocompromised as well as inflammatory bowel disease (IBD) patients. Additionally, colitis occasionally occurs upon primary CMV infection in patients who are apparently immunocompetent. In both cases, the underlying pathophysiologic mechanisms are largely elusive - in part due to the lack of adequate access to specimens. We employed the mouse cytomegalovirus (MCMV) model to assess the association between CMV and colitis. During acute primary MCMV infection of immunocompetent mice, the gut microbial composition was affected as manifested by an altered ratio of the Firmicutes to Bacteroidetes phyla. Interestingly, these microbial changes coincided with high-titer MCMV replication in the colon, crypt hyperplasia, increased colonic pro-inflammatory cytokine levels, and a transient increase in the expression of the antimicrobial protein Regenerating islet-derived protein 3 gamma (Reg3γ). Further analyses revealed that murine and human intestinal epithelial cell lines, as well as primary intestinal crypt cells and organoids represent direct targets of CMV infection causing increased cell death. Accordingly, in vivo MCMV infection disrupted the intestinal epithelial barrier and increased apoptosis of intestinal epithelial cells. In summary, our data show that CMV transiently induces colitis in immunocompetent hosts by altering the intestinal homeostasis.     

亚麻醉剂量氯胺酮对抑郁小鼠肠道菌群的影响

目的：　探究亚麻醉剂量氯胺酮对雄性和雌性抑郁样小鼠肠道菌群的影响。方法：　SPF级健康雄性和雌性C57BL/6小鼠各20只,随机分为8组（n=5）：雌性对照组（FC组）,雌性氯胺酮组（FCK组）,雌性抑郁组（FD组）和雌性抑郁+氯胺酮组（FDK组）;雄性对照组（MC组）,雄性氯胺酮组（MCK组）,雄性抑郁组（MD组）和雄性抑郁+氯胺酮组（MDK组）。FCK组和MCK组经尾静脉注射质量分数为10 mg/kg的氯胺酮,FC组和MC组经尾静脉注射等量生理盐水;FD组、FDK组、MD组和MDK组采用慢性不可预知温和应激（chronic unpredictable mild stress,CUMS）造模,造模后FDK组和MDK组分别经尾静脉注射10 mg/kg氯胺酮,FD组和MD组注射等量生理盐水。采用强迫游泳实验、糖水偏好实验和旷场试验评价小鼠抑郁行为变化,接着采集不同组别小鼠粪便进行粪便微生物16S rDNA序列定性分析及功能预测分析。采用单因素方差分析（one-way ANOVA）不考虑性别时各组肠道菌群的变化,采用双因素方差分析（two-way ANOVA）性别因素和氯胺酮处理对肠道菌群的影响,必要时进一步采用Tukey校正的多重比较对实验结果进行后检验。P<0.05为差异有统计学意义。结果：　分别与不同性别的对照组比较,使用CUMS方法处理小鼠后,强迫游泳不动时间明显延长（P<0.05）,糖水偏好度明显下降（P<0.05）,旷场试验水平运动得分和垂直运动得分明显减少（P<0.05）。经亚麻醉剂量氯胺酮处理后,行为学检测结果表明小鼠均有不同程度的改善（P<0.05）。物种组成分析结果显示,在经过CUMS造模处理后,各组小鼠肠道菌群多样性和丰度未发生明显改变。物种差异分析发现,亚麻醉剂量氯胺酮可以改善抑郁小鼠放线菌的降低程度,使肠道菌群的组成发生变化,并使雌性抑郁小鼠Bacteroidaceae相对丰度降低程度得到缓解,而雄性抑郁小鼠Alistipes相对丰度增加。结论：　不同性别小鼠对CUMS刺激和亚麻醉剂量氯胺酮处理表现出不同的肠道菌群变化。亚麻醉剂量氯胺酮可以改善抑郁小鼠放线菌的降低程度,并缓解雌性抑郁小鼠Bacteroidaceae相对丰度降低程度,增加雄性抑郁小鼠Alistipes相对丰度,进而改善小鼠的抑郁样行为。     

低体温对极低出生体重儿肠道菌群的影响

目的 了解入院低体温的极低出生体重儿肠道菌群失调的特征。方法 以前瞻性队列研究的方式选取出生胎龄<32周且出生身体质量<1.5 kg的早产儿。收集早产儿在出生后24 h内的胎粪样本。根据入院时体温将患儿分为两组：低体温组（体温<36℃）和正常体温组（体温≥36.5℃）。使用16S rRNA基因测序比较纳入对象的粪便样本菌群多样性、群落组成以及生物标志物分析。结果 从2022年4-12月共纳入34例受试者（低温组19例,正常体温组15例）。与正常体温组相比,低体温组中p＿Bacteroidota、c＿Clostridia和c＿Bacteroidia丰度显著增加（P值分别为0.031、0.042、0.031）,低体温组Faecalibaculum、Dubosiella、Blautia、Faecalibaculum＿rodentium的相对丰度也明显增加（P值分别为0.008、0.008、0.005、0.008）。低体温组与正常体温组的总体微生物多样性存在显著差异。CCA结果显示剖宫产的r2值最大（r2=0.4484,P=0.001）,剖宫产对肠道菌群结构的影响最大。结论 低体温组患儿在肠道菌群多样性及组成等方面存在菌群失调可能,优势属Faecalibaculum可能作为低温组的生物标志物。     

Disturbances of the Gut Microbiota and Microbiota-Derived Metabolites in Inflammatory Bowel Disease

Inflammatory bowel disease (IBD), comprising Crohn’s disease (CD) and ulcerative colitis (UC), is characterized as a chronic and recurrent inflammatory disease whose pathogenesis is still elusive. The gut microbiota exerts important and diverse effects on host physiology through maintaining immune balance and generating health-benefiting metabolites. Many studies have demonstrated that IBD is associated with disturbances in the composition and function of the gut microbiota. Both the abundance and diversity of gut microbiota are dramatically decreased in IBD patients. Furthermore, some particular classes of microbiota-derived metabolites, principally short-chain fatty acids, tryptophan, and its metabolites, and bile acids have also been implicated in the pathogenesis of IBD. In this review, we aim to define the disturbance of gut microbiota and the key classes of microbiota-derived metabolites in IBD pathogenesis. In addition, we also focus on scientific evidence on probiotics, not only on the molecular mechanisms underlying the beneficial effects of probiotics on IBD but also the challenges it faces in safe and appropriate application.