COVID-19 associated mucormycosis (CAM) in India: a formidable challenge

Together with the ongoing serious COVID-19 second wave in India, a serious fungal infection, mucormycosis has been increasingly found in COVID-19-recovered patients. Colloquially known as ‘black fungus’, mucormycosis commonly causes necrosis in the head and neck including the nose, paranasal sinuses, orbits, and facial bones, with possible intracranial spread. The disease causes high morbidity and mortality given that it progresses rapidly and diagnosis is often delayed. Given the sheer magnitude of the outbreak, the Indian Health Ministry has advised all states to declare mucormycosis an epidemic. Typically, the disease has been found to be linked to COVID-19 infections caused by the B.1.617.2 (Delta) variant, which has spread rapidly throughout the country. This variant has already become a cause for global concern, having spread to at least 40 countries, including the USA and UK. We present the findings of a study conducted on COVID-19 associated mucormycosis (CAM) patients, and discuss the associated risk factors to raise awareness for OMFS colleagues.     

一株红树内生真菌Penicillium sp. JY246次级代谢产物及其活性研究

目的 研究一株红树角果木来源内生真菌Penicillium sp. JY246的次级代谢产物及其生物活性。方法 利用硅胶柱层析、Sephadex LH-20凝胶柱层析、半制备HPLC等方法,对该菌发酵产物的乙酸乙酯浸膏进行分离纯化;利用NMR、MS等波谱解析方法以及与文献数据对照,鉴定化合物的结构;通过抗菌和抗虫活性模型对化合物的生物活性进行评价。结果 从内生真菌Penicillium sp. JY246中分离得到12个化合物,分别为7-hydroxy-2-(2-hydroxypropyl)-5-methylchromone (1),(2′S)-2-(propan-2′-ol)-5-hydroxy-benzopyran-4-one (2),2, 3-dihydro-5-hydroxy-2(S)-methyl-4H-1-benzopyran-4-one (3),(11S)-diaprothin (4),questin (5),4-hydroxy-3-prenylbenzoic acid (6),4-methoxy-6-styryl-pyran-2-one (7),(R) 4-hydroxy-2-oxo-1-pyrrolidineacetamide (8),p-hydroxy-benzaldehyde (9),4-hydroxyacetophenone (10),apocynin (11)和1-(2,6-dihydroxyphenyl) ethan-1-one (12)。结论 从内生真菌Penicillium sp. JY246的次级代谢产物中分离得到12个单体化合物,并对所有化合物进行抗菌和抗虫活性测试。结果表明,化合物1, 2, 4和5显示抗细菌活性;化合物4, 5和8对棉铃虫幼虫显示了生长抑制活性。     

1176例血培养检出真菌及细菌的耐药性分析

目的：调查2010～2013年医院常见真菌、细菌的耐药性,为临床用药提供依据。方法用 BacT／Alert 3D 全自动血培养仪进行培养,用 VITEK 鉴定系统进行细菌鉴定和药敏试验,用 WHONET5．4统计结果。结果1176例送检标本中阳性标本108例,阳性率为9．18％。分离病原菌123株,革兰阳性菌60株（48．78％）,革兰阴性菌为47株（38．21％）,真菌为16株（13．01％）。前5位病原菌依次为凝固酶阴性葡萄球菌（44株）、大肠埃希菌（18株）、肺炎克雷伯菌（15株）、白色念珠菌（10株）、金黄色葡萄球菌（7株）。耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌（MRCNS）、金黄色葡萄球菌（MRSA）检出率分别为72．73％（32／44）、57．14％（4／7）,MRSA 和 MRCNS 较 MSSA 和 MSCNS 对抗菌药物耐药率高,未发现对万古霉素及利奈唑胺耐药的葡萄球菌。酮康唑、氟康唑、咪康唑对白色念珠菌敏感率高。大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌产超广谱β-内酰胺酶（ESBLs）率分别为50．00％、40．00％,亚胺培南和美罗培南敏感率为100．00％。头孢哌酮／舒巴坦、哌拉西林／三唑巴坦对肠杆菌科细菌、铜绿假单胞菌敏感率较高。结论血培养以凝固酶阴性葡萄球菌为主,分离菌的耐药性较强,应加强血培养,指导临床合理用药。     

荧光染色技术在艾滋病患者活检标本病原学诊断中的应用

目的探讨快速真菌与抗酸分枝杆菌荧光技术在艾滋病患者活检标本病原体诊断中的应用价值及意义。方法选取艾滋病患者500例活检标本,采用快速真菌荧光染色及六胺银、PAS染色对300例可疑真菌感染的活检标本进行检测,采用抗酸分枝杆菌荧光染色及萋尼抗酸染色对200例可疑结核的活检标本进行检测,并对检测结果进行对比。结果（1）快速真菌荧光镜检法检出阳性205例（阳性率68.3%）,六胺银染色法检出阳性209例（阳性率69.7%）,PAS染色法检出阳性97例（阳性率39.5%）,快速真菌荧光染色与六胺银染色检出阳性率差异无统计学意义（P>0.05),但高于PAS染色法;（2）抗酸分枝杆菌荧光染色检出阳性179例（阳性率89.5%）,萋尼抗酸染色法检出阳性117例（阳性率58.5%）,抗酸分枝杆菌荧光染色阳性率高于萋尼抗酸染色法,两者差异有统计学意义（P<0.01）;（3）荧光染色比常规特殊染色操作更快速、简便、显示更清晰。结论艾滋病患者并发机会性感染病原体种类多样,普通的特殊染色阳性率不高并且费时费力,而快速真菌及抗酸荧光染色特别是抗酸荧光染色的阳性率明显增高,为活检组织诊断真菌及结核分枝杆菌感染提供一种快速、准确、经济、对比更清晰的染色方法,能够为真菌感染及结核病患者诊断提供可靠的指导依据,值得在病原体诊断工作中广泛使用。     

深海真菌Phomopsis tersa的次级代谢产物及其细胞毒活性研究

目的 研究深海真菌Phomopsis tersa FS441的次级代谢产物及其细胞毒活性。方法 采用正、反相硅胶柱、凝胶柱和高效液相等多种色谱技术对菌株FS441的固体发酵产物进行分离纯化,并通过NMR、MS等波谱方法鉴定化合物结构,采用SRB法对得到的单体化合物进行细胞毒活性测试。结果 从发酵物中分离纯化得到11个化合物,分别鉴定为：5α, 8α-表二氧麦角甾-6,22-二烯-3β-醇（1）、麦角甾醇（2）、12-hydroxydehydrobotrydienol（3）、5,6-二羟基-2,3,6-三甲基环己-2-烯酮（4）、1,2-二羟基-3,4-脱氢蒽酮（5）、（1S,2S,3S,4R） -3-氯-4-（2-羟基丙吡啶-2-基）-1-甲基环己烷-1,2-二醇（6）、（-）-5-methylmellein（7）、酪醇（8）、胸腺嘧啶核苷（9）、（R）-（+）-甘油1-9 （Z）,12 （Z）-十八碳二烯酸酯（10）、亚油酸（11）。结论 化合物3～6为首次从Phomopsis属分离得到,化合物1和2对SF-268、MCF-7、HepG-2和A549 4种肿瘤细胞株具有弱的细胞毒活性。     

南海深海沉积环境来源真菌Aspergillus flavus SCSIO F025的次生代谢产物及活性研究

目的 对采集自南海中部1781 m沉积环境的1株曲霉属真菌Aspergillus flavus SCSIO F025进行次生代谢产物及活性研究。方法 通过优化培养条件对菌株进行规模发酵,发酵产物采用硅胶柱层析、Sephadex LH-20、HPLC等色谱学方法进行化学分离,利用NMR、MS等波谱学技术并结合文献进行化合物的结构鉴定,应用纸片扩散法及DPPH自由基清除法对化合物进行初步抗氧化和抗菌活性测试。结果 从菌株SCSIO F025中分离鉴定5个单体化合物：penicillivinacine(1),arthrographol(2),dehydroxypaxilline(3),ditryptophenaline(4),kojic acid(5)。其中化合物1和2为首次从黄曲霉中分离得到。化合物1对溶藻弧菌和藤黄微球菌有弱的抑制活性,化合物2表现出显著抗氧化及溶藻弧菌和藤黄微球菌抑制活性,化合物3对溶藻弧菌和肺炎克雷伯杆菌有抑制活性。     

Use of <Emphasis Type="Italic">MET3</Emphasis> promoters for regulated gene expression in <Emphasis Type="Italic">Ashbya gossypii</Emphasis>

A central tool for gene function analysis is the construction mutant strains. This can be done conveniently in A. gossypii using PCR-based tools. The deletion of essential genes can be performed since initial transformants are sheltered in a heterokaryotic mycelium, which contains nuclei with both wild type and mutant alleles. The analysis of mutant phenotypes in A. gossypii is regularly started by germinating spores, which contain only one nucleus. Thus, selection can be used to identify mutant germ cells and germlings. However, such an analysis yields only mutant mycelia if the deleted gene is not essential. We describe the use of the regulatable Saccharomyces cerevisiae and A. gossypii MET3 promoters as novel tools to regulate gene expression in A. gossypii. Conditional expression was tested using GFP and lacZ-reporter genes. Regulation of MET3 promoters was found to be dependent on methionine but not on cysteine and down-regulation to about 1/10 of the initial expression levels was achieved. We used the A. gossypii WAL1 and CYK1 genes as models to demonstrate that MET3 promoters could regulate the expression of these genes and reveal their mutant phenotypes depending on the presence or absence of methionine. Finally, we show that the AgMET3 promoter contains two Cpf1-binding sites and that AgCPF1 can complement the S. cerevisiae cpf1 methionine auxotrophy.     

海洋来源真菌Penicillium sp. wqh-572的次级代谢产物研究?

目的 研究浙江普陀岛海泥来源真菌Penicillium sp. wqh-572的次级代谢产物及其抑菌活性。方法 将菌株进行大规模发酵,乙酸乙酯萃取,采用小孔树脂MCI柱和半制备型高效液相色谱等分离纯化方法,通过核磁(₁H NMR和₁₃C NMR)和质谱(MS)等波谱分析方法,并与相关文献比较,鉴定化合物结构。结果 从该真菌发酵液的乙酸乙酯萃取相中分离得到6个化合物,鉴定结果分别为physcion (1)、emodin (2)、7-hydroxy-2-(2-hydroxypropyl)-5-methylchromone (3)、isorhodoptilometrin (4)、2-(2’, 4’, 6’-trihydroxyphenyc)-(7-hydroxy-5-methyc) chromone (5)及(Z)-N-(4-hydroxy styryl) formamide (6)。其中,其中化合物5为首次从青霉属真菌中分离得到。化合物1对3种植物病原菌均具有抑制作用。