Stepped‐wedge cluster randomised controlled trials: a generic framework including parallel and multiple‐level designs

Stepped‐wedge cluster randomised trials (SW‐CRTs) are being used with increasing frequency in health service evaluation. Conventionally, these studies are cross‐sectional in design with equally spaced steps, with an equal number of clusters randomised at each step and data collected at each and every step. Here we introduce several variations on this design and consider implications for power. One modification we consider is the incomplete cross‐sectional SW‐CRT, where the number of clusters varies at each step or where at some steps, for example, implementation or transition periods, data are not collected. We show that the parallel CRT with staggered but balanced randomisation can be considered a special case of the incomplete SW‐CRT. As too can the parallel CRT with baseline measures. And we extend these designs to allow for multiple layers of clustering, for example, wards within a hospital. Building on results for complete designs, power and detectable difference are derived using a Wald test and obtaining the variance–covariance matrix of the treatment effect assuming a generalised linear mixed model. These variations are illustrated by several real examples. We recommend that whilst the impact of transition periods on power is likely to be small, where they are a feature of the design they should be incorporated. We also show examples in which the power of a SW‐CRT increases as the intra‐cluster correlation (ICC) increases and demonstrate that the impact of the ICC is likely to be smaller in a SW‐CRT compared with a parallel CRT, especially where there are multiple levels of clustering. Finally, through this unified framework, the efficiency of the SW‐CRT and the parallel CRT can be compared. © 2014 The Authors. Statistics in Medicine Published by John Wiley & Sons Ltd.     

基于特征聚集度的FCM-RSVM算法及其在人工焊点缺陷识别中的应用

针对人工焊点缺陷识别方法进行研究,提出了一种基于特征聚集度的模糊C均值聚类(FCM)与松弛约束支持向量机(RSVM)联用的分类识别算法。在提取人工焊点特征向量的基础上,算法首先对样本特征数据进行模糊C均值聚类,依据样本隶属度函数计算不同特征的特征聚集度,并由特征聚集度指标改进RSVM算法中的松弛量参数,建立最终的分类器模型。实验结果表明:本文提出的算法建立了泛化能力更强的分类模型,能有效抑制噪声及模糊边界点对分类模型的影响,在人工焊点缺陷识别的应用中获得了满意的识别结果。     

Congruence Between Latent Class and K-Modes Analyses in the Identification of Oncology Patients With Distinct Symptom Experiences

Context

Risk profiling of oncology patients based on their symptom experience assists clinicians to provide more personalized symptom management interventions. Recent findings suggest that oncology patients with distinct symptom profiles can be identified using a variety of analytic methods.

2009—2020年合肥市肺结核空间特征分析

目的: 分析2009—2020年合肥市肺结核疫情特征及空间聚集性。方法: 通过收集“中国疾病预防控制信息系统”的子系统“结核病管理信息系统”中合肥市2009—2020年肺结核数据,筛选出肺结核患者42681例,利用GeoDa和Arcgis 10.8空间分析软件进行分析,在街道/乡镇水平上绘制空间分布地图,探索空间分布规律及肺结核发病冷热点地区。结果: 2009—2020年合肥市肺结核共报告42681例,报告发病率从2009年57.96/10万(4195/7237966)下降到2020年31.04/10万(2908/9369881),整体呈现波动下降趋势($\chi _{趋势}^{2}$=12.531,P<0.001);全局空间自相关结果显示2009—2014年合肥市肺结核发病呈现空间自相关性(Moran’s I值均>0,P值均<0.05);2015—2020年空间分布偏向随机性。局部自相关分析显示高-高聚集发病街道/乡镇主要集中在长丰县、肥东县;低-低聚集区主要集中在老城区(庐阳区、包河区)。冷热点分析发现,热点区域有2个,分布在长丰县义井乡和肥西县严店乡。结论: 合肥市肺结核疫情存在一定的聚集性,后续应针对不同的县(区)街道/乡镇特点采取不同的防控措施,加大高-高聚集区的街道和热点区域的防控力度。     

结核分枝杆菌McSpoligotyping 基因分型在宜昌地区耐多药结核病中的应用研究 凝血筛查指标变化及其对临床分型的诊断价值

[摘要]　目的　运用熔解曲线间隔区寡核苷酸分型（melting curve spacer oligonucleotide typing, McSpoligotyping）方法对宜昌地区耐多药结核分枝杆菌进行基因分型,以评价其在结核病流行病学调查中的应用价值。方法　选择2019年1月—2020年12月耐多药菌株77株作为实验组,并以异烟肼和利福平敏感菌株110株作为对照组,运用McSpoligotyping方法进行基因分型,将分型结果与SpolDB4.0数据库进行比对分析。结果　187株菌株中北京基因型116株（62.03％）,非北京基因型71株（37.97％）。对照组110株中北京基因型60株（54.55％）,其中数量最多的1组国际型别编码（spoligotype inter-national type, SIT）为1的北京基因型共44株（40.00％）;非北京基因型50株（45.45％）,以T族、Manu族常见。实验组77株中北京基因型56株（72.73％）,其中数量最多的1组为 SIT为1的北京基因型共44株（57.14％）,非北京基因型21株（27.27％）,以T族、Manu2族常见。实验组北京基因型菌株所占比例与对照组差异有统计学意义。实验组成簇率（79.22％）与对照组成簇率（79.09％）差异无统计学意义。结论　北京基因型菌株是宜昌地区结核病的主要流行菌株,在耐多药结核病患者中北京基因型菌株更为流行。耐多药结核菌株有一定的遗传多态性。McSpoligotyping方法操作简单、快速、对于结核病分子流行病学研究具有重要意义。     

2010—2019年宝鸡市 手足口病流行特征及时空聚集分析

[摘要]　目的?分析陕西省宝鸡市2010—2019年手足口病流行特征及时空聚集性,为本市的手足口病防控提供理论依据。方法? 收集宝鸡市2010—2019年手足口病发病数据和病原学监测结果,建立数据库,分析手足口病流行特征及优势病原谱的变化,再应用ArcGIS 10.1系统对手足口病发病进行空间自相关及热点分析。结果?2010—2019年宝鸡市累计报告手足口病35 546例,平均发病率为94.62/10万,男性发病率高于女性（χ2=1031.484,P=0.000）;各年龄组发病率不同（χ2趋势=61 405.833,P=0.000）,其中1～2岁组年平均发病率最高（2572.65/10万）。宝鸡市手足口病病原谱的构成：2010年优势病原为Cox A16（65.14%）,2011年、2012年和2014年优势病原为EV-A71（82.67%、48.97%和54.87%）,2013年、2015—2018年均以其他肠道病毒为主（62.11%、49.34%、53.02%、42.29%、80.50%）,2019年Cox A16和其他肠道病毒比例相当（55.42% vs. 43.07%）,各年间优势病原分布不同（χ2=874.879,P=0.000）。全局自相关分析发现2014年、2017年、2018年、2019年具有空间聚集性,高值聚集区为本市南部地区及主城区。结论?陕西省宝鸡市手足口病发病存在时空聚集性,应加强重点地区疫情防控,制定针对性防控措施。　
     

2013—2017年上海市金山区新登记肺结核患者时空聚集性分析

目的 分析2013—2017年上海市金山区活动性肺结核疫情的时空分布特征,探寻肺结核疫情防治重点区域。方法 通过国家《结核病管理信息系统》收集金山区肺结核患者基本信息,以街镇为单位(共计11个),用SaTScan 9.6软件对上海市金山区2013—2017年新登记肺结核患者登记率进行时空分析,通过ArcGIS 10.4软件对结果进行可视化呈现。结果 金山区2013—2017年新登记活动性肺结核患者1021例,年均登记率为25.64/10万(1021/3981892),其中户籍人口和非户籍人口肺结核患者年均登记率分别为28.68/10万(757/2639117)和19.66/10万(264/1342775)。空间分布上总体肺结核患者登记率最高的街镇在张堰镇,户籍人口登记的肺结核患者主要分布在张堰镇、漕泾镇、金山工业区;非户籍人口主要分布在廊下镇和石化街道。单纯时间扫描结果显示,总体与户籍人口登记肺结核患者的聚集时间均为2014—2015年;单纯空间扫描结果显示,总体登记肺结核患者的聚集区为张堰镇,而户籍人口聚集区为金山区东北部四街镇(亭林镇、漕泾镇、张堰镇和工业区);时空扫描显示,金山区总体人口[相对风险值(RR)=1.50,对数似然比(LLR)=10.35,P<0.01]和户籍人口(RR=1.72,LLR=13.29,P<0.01)肺结核一级聚集区均在2014—2015年出现,聚集区域均为亭林镇、漕泾镇、张堰镇、工业区。结论 金山区肺结核发病具有一定的时空聚集性,聚集性主要受户籍人口影响,东北部四街镇为金山区肺结核高发区域。