Occurrence of Norovirus GII.4 Sydney Variant-related Outbreaks in Korea

Human noroviruses are major causative agents of food and waterborne outbreaks of nonbacterial acute gastroenteritis. In this study, we report the epidemiological features of three outbreak cases of norovirus in Korea, and we describe the clinical symptoms and distribution of the causative genotypes. The incidence rates of the three outbreaks were 16.24% (326/2,007), 4.1% (27/656), and 16.8% (36/214), respectively. The patients in these three outbreaks were affected by acute gastroenteritis. These schools were provided unheated food from the same manufacturing company. Two genotypes (GII.3 and GII.4) of the norovirus were detected in these cases. Among them, major causative strains of GII.4 (Hu-jeju-47-2007KR-like) were identified in patients, food handlers, and groundwater from the manufacturing company of the unheated food. In the GII.4 (Hu-jeju-47-2007KR-like) strain of the norovirus, the nucleotide sequences were identical and identified as the GII.4 Sydney variant. Our data suggests that the combined epidemiological and laboratory results were closely related, and the causative pathogen was the GII.4 Sydney variant strain from contaminated groundwater.     

Kyasanur Forest Disease Outbreak and Vaccination Strategy,Shimoga District,India, 2013–2014

We investigated a Kyasanur Forest disease outbreak in Karnataka, India during December 2013–April 2014. Surveillance and retrospective study indicated low vaccine coverage, low vaccine effectiveness, and spread of disease to areas beyond those selected for vaccination and to age groups not targeted for vaccination. To control disease, vaccination strategies need to be reviewed.     

Mortality Risk Factors for Middle East Respiratory Syndrome Outbreak,South Korea, 2015

As of July 15, 2015, the South Korean Ministry of Health and Welfare had reported 186 case-patients with Middle East respiratory syndrome in South Korea. For 159 case-patients with known outcomes and complete case histories, we found that older age and preexisting concurrent health conditions were risk factors for death.     

一起“挪威疥疮”医院内暴发与处置

目的调查某院一起疥疮医院感染暴发的原因和处置方法。方法 2013年5月该院因1例"挪威疥疮"患者误诊,引起医务人员疥疮医院感染暴发,该院医院感染控制科对暴发事件进行流行病学调查,并根据调查结果指导医疗及消毒隔离。结果医务人员及其家属,共计27人感染挪威疥疮。经积极药物治疗,患者病情逐渐好转;患者使用过的物品全部用塑料口袋包装密封1周后进行清洗消毒。经积极治疗加严格清洗消毒后,感染流行趋势得到控制,未再出现新发病例。结论挪威疥疮传染性高,可在局部地区造成流行,需提高医务人员对本病的诊断能力;一旦发生医院感染,应采取快速、有效措施,防止其蔓延、扩散。     

2009—2020年合肥市肺结核空间特征分析

目的: 分析2009—2020年合肥市肺结核疫情特征及空间聚集性。方法: 通过收集“中国疾病预防控制信息系统”的子系统“结核病管理信息系统”中合肥市2009—2020年肺结核数据,筛选出肺结核患者42681例,利用GeoDa和Arcgis 10.8空间分析软件进行分析,在街道/乡镇水平上绘制空间分布地图,探索空间分布规律及肺结核发病冷热点地区。结果: 2009—2020年合肥市肺结核共报告42681例,报告发病率从2009年57.96/10万(4195/7237966)下降到2020年31.04/10万(2908/9369881),整体呈现波动下降趋势($\chi _{趋势}^{2}$=12.531,P<0.001);全局空间自相关结果显示2009—2014年合肥市肺结核发病呈现空间自相关性(Moran’s I值均>0,P值均<0.05);2015—2020年空间分布偏向随机性。局部自相关分析显示高-高聚集发病街道/乡镇主要集中在长丰县、肥东县;低-低聚集区主要集中在老城区(庐阳区、包河区)。冷热点分析发现,热点区域有2个,分布在长丰县义井乡和肥西县严店乡。结论: 合肥市肺结核疫情存在一定的聚集性,后续应针对不同的县(区)街道/乡镇特点采取不同的防控措施,加大高-高聚集区的街道和热点区域的防控力度。     

自贡市2016-2021年布鲁氏菌病暴发疫情特征分析

目的 分析自贡市2016-2021年布鲁氏菌病暴发疫情特点,为非牧区布病聚集性疫情控制提供依据。方法 对2016-2021年自贡市布鲁氏菌病暴发进行现场调查,筛查重点及高危人群和涉及牲畜,分析疫情发生原因及特点,采取相应控制措施。结果 2016-2021年共报告4起布鲁氏菌病本地暴发疫情,涉及20例患者。病例共同暴露者筛查阳性率14.67%(11/76),畜间血清学筛查阳性率16.67%(19/114);MLVA分析显示分离到菌株与北京、宁夏分离菌株同源性为90.6%。结论 2016-2021年自贡布病疫情传染源均为病羊,食用未煮熟羊肉、私下引种(交易)山羊及无防护屠宰加工是引起布鲁氏菌病暴发的主要原因,应强化国内重点地区牲畜引种、畜产品交易的检疫力度,加强对职业人群的监测工作,开展重点人群的知识宣传。     

2017-2019年贵州省BV系流感病毒的分子特征分析北大核心CSCD

目的了解贵州省BV系流感暴发疫情和重症病例毒株的分子特征,探讨其特异性分子靶标,为流感的防控提供依据。方法选取贵州省2017-2019年BV系流感暴发疫情、重症病例和普通流行毒株,经基因组的提取、HA和NA基因的扩增与测序,与参考株一起进行分子特征分析。结果贵州省所有毒株HA和NA基因进化树拓扑结构类似,整体上毒株处于3个分支,2017年的毒株聚集为一簇,2018年的分散存在,2019年的处于两个分支且相对较远,绝大部分暴发疫情毒株和重症病例毒株均处于分支1。贵州省所有毒株同疫苗株B/Colorado/06/2017 HA和NA基因同源性最高,分别为98.6%~99.3%和98.9%~99.4%;2017年BV系毒株间HA和NA基因同源性分别为99.9%和99.9%~100%,2018年分别为98.4%~99.3%和98.7%~99.1%,2019年分别为97.7%~100%和98.4%~99.9%,其中2019年分支2中的毒株间同源性分别为99.4%~100%和99.6%~99.9%,分支1中的分别为99.5%~100%和99.3%~99.9%,所有暴发疫情、重症病例毒株同当年度普通流行毒株之间同源性均高于99.4%;与疫苗株B/Colorado/06/2017相比所有毒株HA基因均存在S14N、G144D、V195I、K513R的突变,NA基因均存在Q371K、D490N的突变;2019年分支1中的毒株HA基因存在G148R、K151E和T563A以及NA基因存在A395T的特异性位点突变;分支2中的毒株HA基因存在V394I和NA基因存在V71A、K343E、A395V和V401I的特异性位点突变。同时,分支1中的毒株HA基因与疫苗株B/Brisbane/60/2008相比存在179-181KND的特异性缺失突变,与B/Colorado/06/2017相比存在181D的特异性缺失突变和150环的抗原位点突变。结论贵州省BV系暴发疫情毒株之间存在一定的差距,但暴发疫情毒株与普通流行毒株之间亲缘关系和同源性较高,2019年存在两个分支群系毒株的流行,且暴发疫情、重症病例毒株主要以分支1中的毒株流行为主;贵州省暴发疫情、重症病例毒株存在多个位点的特异性突变和缺失突变,应进一步加强分子特征的实时监测和致病力相关的特异性分子靶标研究。     

结核分枝杆菌McSpoligotyping 基因分型在宜昌地区耐多药结核病中的应用研究 凝血筛查指标变化及其对临床分型的诊断价值

[摘要]　目的　运用熔解曲线间隔区寡核苷酸分型（melting curve spacer oligonucleotide typing, McSpoligotyping）方法对宜昌地区耐多药结核分枝杆菌进行基因分型,以评价其在结核病流行病学调查中的应用价值。方法　选择2019年1月—2020年12月耐多药菌株77株作为实验组,并以异烟肼和利福平敏感菌株110株作为对照组,运用McSpoligotyping方法进行基因分型,将分型结果与SpolDB4.0数据库进行比对分析。结果　187株菌株中北京基因型116株（62.03％）,非北京基因型71株（37.97％）。对照组110株中北京基因型60株（54.55％）,其中数量最多的1组国际型别编码（spoligotype inter-national type, SIT）为1的北京基因型共44株（40.00％）;非北京基因型50株（45.45％）,以T族、Manu族常见。实验组77株中北京基因型56株（72.73％）,其中数量最多的1组为 SIT为1的北京基因型共44株（57.14％）,非北京基因型21株（27.27％）,以T族、Manu2族常见。实验组北京基因型菌株所占比例与对照组差异有统计学意义。实验组成簇率（79.22％）与对照组成簇率（79.09％）差异无统计学意义。结论　北京基因型菌株是宜昌地区结核病的主要流行菌株,在耐多药结核病患者中北京基因型菌株更为流行。耐多药结核菌株有一定的遗传多态性。McSpoligotyping方法操作简单、快速、对于结核病分子流行病学研究具有重要意义。