遗传性非息肉性结直肠癌患者腺瘤和癌组织微卫星基因型分析

背景：遗传性非息肉性结直肠癌（HNPCC）是一种由错配修复基因种系突变引起的常染色体显性遗传病，高度微卫星不稳定（MSI—H）为其分子生物学特征之一。目的：利用5个微卫星位点建立正常结直肠黏膜、结直肠腺瘤和癌组织的微卫星基因型，探讨HNPCC的MSI发生情况和MSI检测的临床意义。方法：纳入源自33个HNPCC家系的腺瘤28例和腺癌14例，其中4例为同步腺瘤-癌；以32例散发性结直肠腺瘤和24例散发性结直肠癌作为对照。选用BAT25、BAT26、D2S123、D5S346、D17S250五个微卫星位点行荧光标记聚合酶链反应（PCR），以GeneMapper软件分析PCR产物。通过与正常黏膜微卫星序列PCR片段长度进行比较，判定腺瘤和癌组织的MSI情况。结果：HNPCC腺瘤和癌组织MSI-H发生率分别显著高于散发性结直肠腺瘤和结直肠癌（64-3％对3．1％，71.4％对12．5％，P〈0．05）。4例同步腺瘤-癌均表现为MSI—H．其腺瘤和癌组织的MSI类型不同。结论：HNPCC腺瘤和癌组织MSI—H发生率高。同步腺瘤一癌来源于不同克隆。MSI检测可作为HNPCC的临床初筛方法。     

Functional Study of Polymorphism 1888 C>T in the Promoter Region of Human PLUNC Gene

BackgroundOur previous study showed that a single nucleotide polymorphisms (SNP) of 1888 C>T located at promoter region of human PLUNC gene might affect the susceptibility of nasopharyngeal carcinoma (NPC) in a Chinese population. This study aims to analyze the effect of the genetic variant on PLUNC promoter activity.Materials and methodsThe DNA fragments of the PLUNC promoter region including the SNP 1888 C>T were obtained by polymerase chain reaction (PCR). The recombinant plasmid of the fragment and the pGL3-Enhancer firefly luciferase reporter vector were cloned and identified. Relative luciferase activity (RLA) was measured and electrophoretic mobility shift assay (EMSA) was analyzed.ResultsLuciferase reporter assays demonstrated that luciferase activity of the 1888 T-allele was significantly higher, compared with the C-allele. EMSA experiment proved that the PLUNC gene promoter region SNP 1888 TT genotype had the ability to bind the nucleus protein with the human NPC CEN2 cell, whereas the CC genotype had not.ConclusionsSNP 1888 C>T in the promoter region of PLUNC gene might be a functional mutant locus, indicating that individuals carrying SNP 1888 C-C genotype might be more likely to develop NCP due to the reduced expression of the PLUNC gene. Further functional studies on PLUNC genetic variants are warranted to verify our findings.     

四川地区隐球菌临床分离株基因型和耐药性分析

目的 了解四川地区隐球菌临床分离株基因分型及体外临床常用抗真菌药物敏感性情况.方法 采用针对URA5基因PCR产物的限制性片段长度多态性(RFLP)方法对收集自我校华西医院的92株隐球菌临床分离株进行基因分型;采用E-test法检测临床常用抗真菌药物两性霉素B(AMB)、氟胞嘧啶(FC)、氟康唑(FCA)、伊曲康唑(ITR)和伏立康唑(VRC)对隐球菌分离株的最低抑菌浓度(MIC)范围,并计算其MIC50、MIC90.结果 92株隐球菌中,91株为新生隐球菌VN Ⅰ型,1株为格特隐球菌VGⅡ型.5种抗真菌药物对92株隐球菌临床株的MIC值范围、MIC50、MIC90值分别如下:两性霉素B为＜0.002～2 μg/mL0.19 μg/mL和0.75 μg/mL;氟胞嘧啶为0.5～＞32 μg/mL、4μtg/mL和8 μg/mL;氟康唑为0.5～32 μg/mL、3 μg/mL和8 μg/mL;伊曲康唑为0.064～2 μg/mL、0.5 μg/mL和1.5 μg/mL;伏立康唑为0.004～0.19 μg/mL、0.047 μg/mL和0.094 μg/mL.其中3株(3.3％)对两性霉素B耐药,4株(4.3％)对氟胞嘧啶耐药,25株(27.2％)对伊曲康唑耐药,未发现对氟康唑耐药的菌株,所有菌株对伏立康唑敏感.格特隐球菌(1株)对氟胞嘧啶耐药,对氟康唑剂量依赖敏感.不同时间段隐球菌对5种抗真菌药物的MIC值比较,差异均具有统计学意义.随时间推移,两性霉素B及氟胞嘧啶的MIC值有所升高,唑类药物MIC值变化无规律.结论 四川地区隐球菌以新生隐球菌VN Ⅰ型为主,存在格特隐球菌VGⅡ型.除伊曲康唑外,隐球菌对其他抗真菌药物敏感性高,仅少数菌株对两性霉素B及氟胞嘧啶耐药.     

安徽东部地区结核分枝杆菌基因分型及耐药情况的初步分析

目的 了解安徽东部地区结核分枝杆菌基因分型及耐药情况,为本地区肺结核的防治提供依据.方法 对从临床收集的80例结核菌株进行培养,分别通过可变数目串联重复序列分型技术、药敏实验对菌株进行分型、耐药情况分析.结果 单耐药菌株占25.00％,多耐药菌株占23.75％.单耐药菌株以利福平和对氨基水杨酸占多数,分别为28.75％和22.50％;多耐药菌株以对异烟肼和利福平耐药最多,占52.63％.初治病人和复治病人对吡嗪酰胺耐药差异有统计学意义(P =0.032),对其他药物的耐药差异均无统计学意义(均有P＞0.05).15个基因位点均呈现等位基因多态性,QUB11a位点多态性最高为0.85,Mtub31位点仅为0.11.80株菌株可分为33个基因型,仅有16例患者的分离株为单一基因型,其余菌株可归入14个簇.结论 本地区结核分支杆菌的耐药率较高,基因分型复杂.     

中国异烟肼耐药结核分枝杆菌基因突变特征分析

目的: 明确中国异烟肼(INH)耐药结核分枝杆菌基因突变的分子特征。方法: 在PubMed、中国知网、万方、维普数据库中检索有关中国结核分枝杆菌耐INH基因突变的研究文献,对纳入文献的突变基因的突变位点、突变类型,以及氨基酸改变数量等信息进行整合分析。结果: 共纳入69篇中英文文献,共6393株INH耐药结核分枝杆菌。95.71%(6119/6393)检测到基因突变或缺失,其中katG、inhA、aphC突变数量最多,分别占77.57%(4959/6393)、15.20%(972/6393)、3.69%(236/6393)。单基因单位点突变占87.80%(5613/6393),联合突变占12.20%(780/6393)。katG315突变占INH耐药菌株总数的56.22%(3594/6393),katG463突变占10.03%(641/6393),inhA15突变占10.10%(646/6393)。突变形式最常见的是C→T,占10.03%(641/6393)。结论:中国INH耐药结核分枝杆菌突变基因最多的是katG、inhA、ahpC,突变密码子最多的是katG315、katG463、inhA15。     

感染两种HBV C基因亚型患者病毒变异特点比较

目的调查乙型肝炎病毒C1和C2亚型感染者的临床、病理和前C基因区的变异特点。方法运用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法，并结合HBV前C／C区序列测定，对广东地区63例慢性乙型肝炎患者C基因亚型和前C区变异特点进行分析，并对两种基因亚型感染者的多项临床和病理检测指标进行比较。结果所选C1和C2亚型感染者的年龄和性别构成无差异，其肝功能指标、HBV DNA水平以及肝组织炎症活动度和纤维化分期评分也无显著性差异。在前C基因区变异方面，C1亚型毒株发生C基因核心启动子变异机率高于C2亚型，C2亚型毒株发生前C终止密码变异的机率显著高于C1亚型，但两种变异的总发生率在两种亚型间并无显著性差别。结论两种C基因亚型的临床致病性并无明显差异，但在形成HBeAg阴性HBV感染方面两种毒株会采取不同的变异模式。     

天津地区家族聚集性慢性乙型肝炎病毒感染者病毒载量及组织病变与基因型的关系

目的探讨天津地区家族聚集性HBV感染患者基因型特征与病毒载量及肝组织病理的关系。方法随机采集临床确诊家族聚集性的慢性HBV表面抗原携带者(ASC)35例和轻型CHB患者65例。分别进行HBV基因分型、HBV DNA载量、肝组织病理学检测。结果HBV基因型显示:B型7例,HBV DNA主要为低载量(57.14%),病理损害程度较轻。BC混合型11例,HBV DNA以低、中载量为主(45.45%、36.36%),病理损害多为轻至中度≤G2 10例(90.91%),≤S2 9例(81.82%)。C型82例,其中ASC 29例,HBV DNA以高载量为主(72.41%),均有不同程度的病理损伤(100%);CHB 53例,HBV DNA主要为中、高载量(39.62%,49.06%),病理损害≥G2者38例(71.70%),≥S2者25例(47.17%)。结论天津地区家族聚集性ASC和CHB以基因C型为主、病毒载量高、肝组织病理损伤较严重,为乙型肝炎预后不良的主要因素;家族聚集性ASC不仅存在HBV病毒高载量,而且均有不同程度的肝脏病理损伤,临床可视肝组织病理结果酌情抗病毒治疗;肝组织病理学检查作为ASC和CHB患者治疗前的常规检测手段,为规范CHB的抗病毒治疗提供可靠依据。     

随机引物PCR法分型大肠艾希菌及其在判断医院感染中的应用

目的对大肠艾希菌(艾希菌)进行随机引物PCR(AP—PCR)法基因分型并应用于医院感染的判断。方法以优化的随机引物、反应体系和扩增条件对临床分离的161株艾希菌进行AP—PCR法基因分型并按指纹图上DNA条带数及片段大小绘制基因分型图谱，同时对艾希菌的医院内感染进行了观察与分析。结果161株艾希菌共得AP—PCR型120种；艾希菌的医院内感染确实存在。结论AP—PCR法可对艾希菌有效分型并可用于艾希菌医院内感染的判断。     

乙型肝炎病毒基因型与干扰素α1b疗效关系的研究

目的　探讨乙型肝炎病毒 (HBV)基因型与干扰素α1b治疗慢性乙型肝炎疗效的关系。方法　采用PCR、核酸杂交和酶联显色技术对慢性乙型肝炎患者进行HBV基因分型 ,随机观察 10 5例 (B型 5 3例和C型 5 2例 )慢性乙型肝炎患者干扰素α1b治疗 6个月和随访半年后肝功能和病毒学指标的变化。结果　干扰素α1b治疗 6个月和随访半年后 ,B基因型患者的HBeAg阴转率、HBVDNA阴转率和HBeAg/抗 HBe的血清转换率均显著高于C基因型 (P <0 . 0 1) ,B基因型患者的有效应答率为 5 2 . 83 %,显著高于C基因型的 2 5 . 0 0 %(P <0 . 0 1)。B基因型的持续应答率高于C型 ,复发率低于C型 ,但两组差异无显著性 (P >0 . 0 5 )。结论　B基因型对干扰素α1b的抗病毒疗效显著高于C型 ,HBV基因型是影响干扰素α1b疗效的重要因素之一。     

肥胖对APOE基因型与血浆胰岛素和血糖关系的影响

目的 本文旨在探讨超重／肥胖和载脂蛋白E（APOE）基因型间的交互作用对血浆胰岛素水平和血糖水平的影响。方法 利用北京自然人群横断面研究，应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术（PCR—RFLP）进行APOE基因分型，将研究对象以性别、体重指数和基因型分层，比较不同基因型人群血浆胰岛素和血糖水平；分析不同APOE不同基因型和肥胖对血浆胰岛素和血糖水平的影响。结果 （1）随着体重指数的增加，血浆胰岛素和血糖水平明显升高，具有统计学意义；（2）APOE基因型与超重和肥胖的交互作用对血浆胰岛素和血糖水平的影响在女性中具有统计学意义（P=0．003）；（3）与APOE3基因型携带者相比，肥胖的男性APOE2携带者和女性APOFA携带者具有较高的血糖和胰岛素水平。结论 APOE基因多态性对血浆胰岛素和血糖水平的影响受超重／肥胖的调控。