基于影像组学的logistic回归模型预测胶质瘤分级

目的:胶质瘤是最常见的颅内原发中枢神经系统肿瘤,胶质瘤的分级对临床治疗及随访方案的选择、预后的评估有重要指导意义.本研究目的在于探讨基于影像组学的logistic回归模型预测胶质瘤病理分级的可行性.方法:回顾性收集2012年1月至2018年12月经手术病理切片证实为胶质瘤的146例患者.手动分割患者增强T1加权成像(c...     

血中小分子代谢物作为生物标志物对结肠癌诊断价值的评价

目的 分析结肠癌患者血液中小分子代谢产物的水平,并评价其作为结肠癌生物标志物的能力。方法 收集结肠癌患者清晨空腹血液标本299例及性别年龄无显著差异的体检健康人血液标本277例。采用液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)检测全血中11种氨基酸与31种酰基肉碱,分析结肠癌患者及健康对照血液中小分子代谢物水平的差异。利用ROC曲线分析小分子代谢物对结肠癌的诊断能力。结果 结肠癌患者血液小分子代谢物中1种酰基肉碱显著高于健康组,6种酰基肉碱、9种氨基酸显著低于健康组。经ROC曲线分析,9种氨基酸、7种酰基肉碱及16种指标对结肠癌具有一定的诊断价值,ROC曲线下面积分别为0.789、0.922和0.956。结论 结肠癌患者血液中小分子代谢物的水平与健康人有显著差异,9种氨基酸及7种酰基肉碱组合可作为区分结肠癌与健康人的生物标志物。     

代谢组学技术在变应性鼻炎研究中的应用

近年来,变应性鼻炎发病率越来越高,而其诊断及治疗效果仍缺乏客观的代谢物评价指标.代谢组学通过分析生物体内源性或外源性小分子代谢物,已经成为研究过敏性疾病病因和识别潜在生物标志物的有力工具.本文从临床人群和动物模型等方面介绍代谢组学技术在变应性鼻炎研究的应用进展,旨在推动变应性鼻炎代谢组学研究的发展.     

临床及CT影像组学特征预测胃癌微卫星高度不稳定状态

目的 观察临床和CT影像组学特征用于预测胃癌微卫星高度不稳定(MSI-H)状态的价值。方法 纳入150例胃癌患者,MSI-H阳性30例、阴性120例;按7∶3比例将其分为训练集(n=105)和验证集(n=45)。基于腹部静脉期增强CT图提取病灶影像组学特征并加以筛选,计算影像组学评分(Radscore);比较训练集和验证集MSI-H阳性与阴性患者临床资料及Radscore差异;分别基于其间差异有统计学意义的临床因素和Radscore构建临床模型、CT影像组学模型及临床-CT影像组学联合模型,评估其预测胃癌MSI-H状态的价值。结果 训练集和验证集中,MSI-H阳性与阴性肿瘤位置、Radscore差异均有统计学意义(P均<0.05)。临床模型、CT影像组学模型及联合模型评估训练集胃癌MSI-H状态的曲线下面积(AUC)分别0.760、0.799及0.864,在验证集分别为0.735、0.812及0.849;联合模型的AUC大于2种单一模型(P均<0.05)。结论 基于肿瘤位置和Radscore的临床-CT影像组学联合特征可有效预测胃癌MSI-H状态。     

基于疾病诊断相关组的医院内专科评价指标探讨

目的 通常疾病诊断相关组(DRGs)指标用于评价综合医院的能力,当用于医院内部评价时,因专科差异较大,现有指标不宜直接用于临床专科比较.本文拟探讨DRGs指标体系应用于医院内评价的问题,并提出专科能力指数及其计算方法.方法 以某院2018年DRGs分组结果及该院所在省份DRGs数据,论证现有DRGs指标体系应用于医院内...     

基于隐马尔可夫模型的全外显子测序拷贝数变异检测算法研究

拷贝数变异(CNV)是基因组变异的一种非平衡结构变异,与癌症等许多复杂疾病相关.目前,基于隐马尔可夫模型(HMM)的CNV检测算法已经成为基因检测研究中的一大热点,但是对于这些基于HMM的CNV检测工具并没有进行过系统的比较,导致在应用时选择困难.选取5种具有代表性的基于HMM的CNV检测工具:ExomeDepth、E...     

卵巢肿瘤结构域蛋白3敲除小鼠黑质区核因子κB相关炎症因子表达的变化及其机制

目的 探讨卵巢肿瘤结构域蛋白3敲除(OTUD3-/-)小鼠黑质核因子κB(NF-κB)相关炎症因子表达的变化及其机制.方法 分别选取3只24月龄OTUD3-/-雄性小鼠(OTUD3-/-组)及其同窝野生型(WT)雄性小鼠(WT组)的双侧黑质组织,采用转录组学测序(RNA-seq)技术筛选差异表达基因(DEGs),应用K...     

糖组学的基础科学问题

聚糖作为生物体的一部分,在细胞识别间占有重要地位.影响生物体的基本生命过程.对糖进行研究已成为生命科学领域研究的热点.糖组学是随之发展起来的研究聚糖结构和功能的一门新的学科,近年来倍受关注.作者从糖组学的研究背景、糖链功能、糖基化作用、糖链操作技术及糖药物等方面对糖组学的研究前沿进行了综述.     

复方角菜酸酯乳膏和复方角菜酸酯栓治疗混合痔的疗效及安全性对比研究

目的研究复方角菜酸酯乳膏治疗痔病的疗效及安全性,并与复方角菜酸酯栓剂比较。方法采用多中心、开放、对比的研究方法,将252例混合痔患者随机分为治疗组和对照组,分别应用复方角菜酸酯乳膏和复方角菜酸酯栓剂,在用药后30min至6d量化评价两组疼痛、出血、水肿、脱出等情况。结果用药后在疼痛以外的其他症状改善方面,两组疗效均显著,有效率分别为87.3%和94.8%,组间差异无统计学意义(P>0.05)。但在各时间点,治疗组患者疼痛平均得分均低于对照组(P<0.05)。在用药后30min和3h,止痛起效的患者比例明显高于对照组(P<0.01)。治疗组在30min和3h总起效患者的比例也高于对照组(P<0.01)。用药期间,两组均无不良反应。结论复方角菜酸酯乳膏用于混合痔的治疗,在缓解疼痛和起效时间上有优势;在改善疼痛以外的症状方面,与复方角菜酸酯栓相似。     

蛋白质组技术在胃癌相关标志物筛查中的应用

目的 建立胃癌组织和正常胃组织双向凝胶电泳图谱，鉴定差异表达蛋白，从中发现有意义的胃癌相关标志物。方法 采用双向凝胶电泳（2-DE）分离胃癌组织和正常胃组织总蛋白，银染显色，PDQuest软件分析，从中选取差异表达蛋白质点，通过基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）或MALDI-TOF-TOF-MS鉴定差异表达的蛋白质。结果 获得重复性和分辨率较好的胃组织双向凝胶电泳图谱；发现23个差异表达蛋白质，其中15个得到鉴定，在肿瘤组织中高表达的有10个，其余5个在肿瘤组织中低表达。结论 建立了胃癌组织和正常胃组织双向凝胶电泳图谱，并应用质谱技术鉴定了15个差异表达蛋白质。