如何用SAS软件正确分析生物医学科研资料 XX.R×C列联表资料的统计分析与SAS软件实现(三)

生物统计学是生物学领域科学研究和实际工作中必不可少的工具,在分子生物学迅速发展的今天,生物统计学更显示出了它的重要性。实验设计与数据统计分析是现代生物学的基石,是生物学研究者检验假说、寻找模式、建立生物学理论的有利工具,也是生物学研究者探索微观和宏观生物世界的必备基础知识。对于每天甚至是每时每刻涌现的大量的、以天文数字计量的分子遗传数据,必须借助统计学知识加以分析处理,才能从中获得有意义的信息。"生物多样性数据分析"是开展生物多样性研究的一个重要方面,数据分析能力的高低极大地影响着我们对各种生态学现象认识的深度和广度。现在,电子计算机的普及使得生物统计分析过程大大简化,生物统计分析软件包的普及将生物统计学从统计学家的书本里解放了出来,简化了生物统计分析过程,使之成为生物学研究者的常用工具。本刊特邀军事医学科学院生物医学统计学咨询中心主任胡良平教授,以"如何用SAS软件正确分析生物医学科研资料"为题,撰写系列统计学讲座,希望该系列讲座能对生物医学科研工作者有所帮助。     

如何用SAS软件正确分析生物医学科研资料 XVIII. R × C 列联表资料的统计分析与SAS软件实现（一）

生物统计学是生物学领域科学研究和实际工作中必不可少的工具,在分子生物学迅速发展的今天,生物统计学更显示出了它的重要性。实验设计与数据统计分析是现代生物学的基石,是生物学研究者检验假说、寻找模式、建立生物学理论的有利工具,也是生物学研究者探索微观和宏观生物世界的必备基础知识。对于每天甚至是每时每刻涌现的大量的、以天文数字计量的分子遗传数据,必须借助统计学知识加以分析处理,才能从中获得有意义的信息。“生物多样性数据分析”是开展生物多样性研究的一个重要方面,数据分析能力的高低极大地影响着我们对各种生态学现象认识的深度和广度。现在,电子计算机的普及使得生物统计分析过程大大简化,生物统计分析软件包的普及将生物统计学从统计学家的书本里解放了出来,简化了生物统计分析过程,使之成为生物学研究者的常用工具。本刊特邀军事医学科学院生物医学统计学咨询中心主任胡良平教授,以“如何用SAS软件正确分析生物医学科研资料”为题,撰写系列统计学讲座,希望该系列讲座能对生物医学科研工作者有所帮助。     

“三江并流”自然遗产地怒江流域居民区蚊类多样性的空间分布格局

山地居民区村镇及其周边农耕区是一类长期在人为开发利用和干扰下,常见但又与周围山区自然状况不同的人文生态系统或地理景观。为探索我国西南山地居民区蚊类多样性空间分布规律与区系特征,作者于2006年7～8月间应用灯诱法对滇西北＂三江并流＂自然遗产地中的怒江中上游流域北纬25°00′～28°30′和海拔800～2000m之间共20个山地居民区的蚊类多样性进行了调查取样,共捕获蚊类2亚科5属32种87126只,统计分析结果显示：1）总蚊密度沿纬度和海拔梯度基本呈现为两头高中间略低的分布格局,但总体上以低纬度和低海拔地带为高;2）优势种（主要是三带喙库蚊）密度与总蚊密度沿纬度和海拔梯度均呈现正相关分布格局,说明优势种不同程度地主导了当地蚊类密度的分布趋势;3）α-多样性（Shannon-Wiener指数H′、Pielou指数E）和物种丰富度S随着纬度的增加呈逐步升高然后又降低的单峰分布格局;沿海拔梯度的变化是：H′和E总体呈现为逐步上升的趋势,但物种丰富度S呈现为中间高,两头相对较低的分布格局;4）α-多样性（H′、E）与总蚊密度在沿纬度梯度和海拔梯度的变化中均呈现为多样性随着密度降低而升高,随密度的升高而降低的负相关分布格局;5）β-多样性（Cody指数）沿纬度梯度呈偏峰分布格局,其高峰位置在27°N与28°N之间,它反映出当地蚊类物种组成在此区间发生了较大的变化;Cody指数沿海拔梯度的变化呈单峰分布格局,其高峰出现在1200～1800m之间,反映出蚊类物种组成在海拔高度约1500m的区域发生了较大的变化;上述纬度和海拔梯度的Cody指数高峰的具体地理位置分别地处当地气候沿纬度（水平）梯度和海拔（垂直）梯度分布中的北亚热带向暖温带的过渡地带,它们反映了蚊类的β多样性空间分布格局及物种组成与当地地理环境和气候条件的变?     

抗人白细胞间素-2多克隆及单克隆抗体的生物学特征

利用人工合成的白细胞间素2(IL-2)多肽片段,用中和试验、竞争ELISA和染色IL-2分泌细胞的碱性磷酸酶抗碱性磷酸酶桥联酶标技术,对己制备的抗人IL-2多克隆抗体及单克隆抗体(McAb)的表位特异性、中和活性、亲和常数及杭天然IL-2的反应性进行了全面鉴定。结果表明:利用多种免疫方案、融合前强化加强免疫及多个脾脏混合融合制备策略所获得的McAb,在生物学特征上表现出多样化,即这些McAb的表位特异性、中和活性、亲和力及抗天然IL-2活性各不相同。其中抗IL-2 C末端的McAb为首次报道。这组McAb适用于对IL-2研究的不同目的。     

多样性人源天然噬菌体抗体库的构建及初步应用

目的:构建多样性良好的人源天然噬菌体抗体库。方法:从正常人外周血中分离淋巴细胞,以RT-PCR和半巢式PCR扩增重链可变区VH基因和轻链可变区VL基因,以重叠延伸PCR将VH、VL组装成scFv基因,并将其克隆入噬菌粒载体pCANTAB-5E中。以pCANTAB-5E电转化大肠杆菌TG1,构建人源天然噬菌体抗体库,测序分析抗体基因的家族信息和多样性,并用多种抗原对其进行筛选。结果:获得了库容为2×108的人源天然噬菌体抗体库。分别用5种抗原对其进行筛选,均可获得特异性噬菌体抗体的富集。结论:成功地构建了一个多样性良好的人源天然噬菌体抗体库,可用于制备具有应用前景的人源抗体。     

儿童EB病毒感染相关疾病临床分析

目的：了解儿童EB病毒(EBV)感染症状及相关疾病诊断情况，以提高临床诊断水平，并探讨EBV感染临床多样性机制。方法：对本院经酶联免疫吸附法(ELISA)测定EBV-VCA-IgM阳性的105例EBV感染患儿的症状、疾病诊断及预后进行回顾性分析。结果：EBV感染患儿起病症状不一，以发热多见(71．4％)．其它依次为咳嗽(24．8％)、皮疹(12．4％)、淋巴结肿大(17．1％)、眼睑水肿(8．6％)、咽炎(14．3％)、惊厥(1．9％)、肉眼血尿(0．9％)等，可累及全身各个系统，引起疾病多种多样，但以呼吸道感染最多见(46．3％)，其次为传染性单核细胞增多症(21．0％)、特发性血小板减少性紫癜(5．7％)、病毒性脑炎(5．7％)、川崎病(4．8％)、过敏性紫癜(1．9％)、类风湿性关节炎(1．9％)、系统性红斑狼疮(0．9％)、噬血细胞综合征(0．9％)、病毒性心肌炎(0．9％)、亚急性坏死性淋巴结炎(0．9％)等。结论：儿童EBV感染症状多样，累及系统多，临床医生应综合分析，及早作相应的检查才能减少误诊率，并进行合理治疗。     

多发性内分泌腺肿瘤1型临床表现的多样性

多发性内分泌肿瘤 (MEN)是指同一个患者同时或先后发现两个或两个以上的内分泌腺肿瘤 (增生 )。这是一种较为罕见的常染色体显性遗传疾病 ,具有家族聚集性。国外估计发病率 1/2 0～ 2 0 0万人群。分为MEN 1和MEN 2。例 1　男性 ,32岁 ,病历号 2 914 32 ,2年前因头晕发现高血压     

应用变性高效液相色谱法检测葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症的三种常见基因突变

葡萄糖-6-磷酸脱氢酶（G6PD）缺乏症呈X连锁不完全显性遗传。G6PD具有遗传多态性，其基因定位在染色体Xq28，现已鉴定的G6PD基因突变型有131种，在我国已报道的有20种，其中多为点突变，G6PD缺乏症呈全球性、多种族、多民族分布，其基因突变型具有民族和种族异质性，我国是一个多民族闰家，在G6PD基因上一定存在着多种类型的突变，研究这些突变型对我国群体遗传学、人类学、民族渊源和变迁至关重要，也可填补我国“人类基因组多样性计划”G6PD座位的空白。变性高效液相色谱法（DHPLC）是近年发展起来的检测突变的新技术，我们初步探索了DHPLC在中国人G6PD基因突变检测中的应用。     

人颊黏膜微生物群落年龄相关性演替研究

目的 初步探讨健康人群颊黏膜菌群组成在不同年龄及牙列阶段的动态演替过程。方法 25例健康受试者根据年龄及牙列情况分为5组：乳牙列组、混合牙列组、青少年组、青年组及老年组;分别提取各样本的细菌总DNA进行聚合酶链式反应,采用Quantity One软件对扩增产物的变性梯度凝胶电泳（DGGE）指纹图谱进行生物信息学分析。结果 1）颊黏膜菌群的组成具有个体差异性。2）乳牙列组、混合牙列组、青少年组、青年组及老年组DGGE指纹图谱的平均条带数分别为21.2±4.0、17.8±3.9、15.8±4.3、16.8±3.7、22.2±6.5,各组间的差异无统计学意义（P>0.05）,提示颊黏膜优势菌群的数量在各个年龄阶段保持相对稳定。3）5组的Shannon指数分别为1.73±0.2、1.43±0.1、1.05±0.2、1.45±0.2和1.63±0.3,各组间的差异有统计学意义（P=0.003）;提示颊黏膜微生物的多样性在儿童至青少年阶段呈下降趋势,在青年至老年阶段呈上升趋势。4）群落结构相似性聚类分析发现：同组内大部分样本聚类位置相近,群落结构表现出较高的相似性;不同组的大部分样本未聚类在一起,群落结构呈现出一定的差异性。结论 不同年龄组健康人群的颊黏膜微生物群落组成存在差异,青少年期可能是颊黏膜微生物多样性改变的重要转折点。     

贵州野生天麻遗传多样性的AFLP指纹分析

目的 研究野生天麻的遗传多样性,为合理利用野生天麻种质资源、为天麻的进一步系统选育研究提供一定的理论依据.方法 利用AFLP技术,采用8对M+3和P+3引物组合对23份贵州野生天麻品种进行了总基因组DNA水平上的多态性检测,用NTSYSpc-2.10s 软件的UPGMA 方法 对检测结果 进行聚类.结果 共获得552条可统计的条带,其中396条呈多态性,多态性带百分率约72%.UPGMA聚类可以将贵州不同产地的野生天麻很好地区分开来.结论 该实验揭示了贵州野生天麻种质丰富的遗传多样性,聚类分析结果 表明多数来源地相同的天麻种质表现出较为密切的亲缘关系.