疾病相关基因单核苷酸多态性初筛的生物信息学策略及实验验证

目的 以筛选宫颈癌相关IL-18基因SNP位点为例,探讨筛选疾病相关SNP位点的生物信息学策略,并以实验验证.方法 使用SNPper软件从公共数据库dbSNP获得IL-18调控区和编码区的SNPs数据,使用PARSESNP软件进行筛选和分析编码区SNPs是否对基因表达产物产生影响;使用转录因子结合部位预测软件分析调控区SNPs是否对基因转录表达水平产生影响.然后通过病例-对照研究,使用直接测序法验证生物信息学方法结果的有效性.结果 生物信息学策略分析得到3个SNP位点(rs1946518、rs360719和rs187238),预测这些位点可能影响IL-18的转录表达水平,从而影响机体对肿瘤的抵抗作用.病例对照研究直接测序法分析,rs1946518和rs360719与宫颈癌相关;rs187238与宫颈癌无关联.结论 生物信息学策略分析疾病相关SNP位点,虽然存在假阳性等缺点,但仍然廉价可行,可以为疾病与基因关联性研究提供很有价值的信息.     

反复呼吸道感染患儿免疫功能变化及核酪注射治疗疗效观察

目的：探讨反复呼吸道感染（RRI）患儿免疫功能变化及核酪注射液对其的影响.方法：将45例RRI患儿设为RRI组,用核酪注射液治疗,对照组32例为非RRI的急性呼吸道感染患儿,观察疗效及治疗前后血免疫球蛋白、T细胞亚群变化及植物血凝素（PHA）皮试反应强度.结果：RRI患儿IgA、IgG明显低于对照组（P〈0.01、P〈0.05）,治疗后IgA较治疗前升高（P〈0.05）.RRI患儿CD4、CD4/CD8、NK细胞明显低于对照组（P〈0.05、P〈0.01）,治疗后CD4、NK细胞较治疗前升高（P〈0.05）.RRI患儿PHA红晕直径较对照组小（P〈0.05）,治疗后较治疗前增加（P〈0.05）.结论：RRI患儿细胞免疫、体液免疫功能均下降,核酪注射液具有提高和调节细胞免疫和体液免疫功能的作用.     

单液滴微萃取技术及其在色谱分析中的应用

综述单液滴微萃取技术的基本特点和发展以及在色谱分析中的应用。单液滴微萃取技术作为一种装置和操作简单、实用、运作成本低廉、污染小及灵敏度高的样品预处理方法，在环境、生物样本及食品和药物分析等多个领域有着广阔的应用前景。     

青年女性膳食钙的吸收与VDR基因FokI酶切多态性间关系的探讨

目的在我国城市居民代表性膳食条件下,探讨青年女性膳食钙吸收与VDR基因Fok I酶切多态性间的关系。方法从300名18~23岁女青年学生中筛选出40名受试对象,并通过特定引物对VDR基因扩增产物以限制性内切酶Fok I酶切电泳条带分布来分基因型。3 d代表性膳食适应后,开始为期12 d的代谢试验。研究对象所摄取的食品和饮品为我们设计的城市代表性膳食,称重(包括饮水)并采集备份样品分析测定;完整采集研究对象的粪便和尿液。测定并计算出每位研究对象膳食钙的吸收率。结果被研究者膳食钙含量与1992年全国营养调查中青年女性的摄入量接近或与成年女性膳食营养推荐摄入量接近;不同VDR基因Fok I酶切型别的青年女性膳食钙吸收率不同,呈现如下趋势:ff相似文献   

甲醛致大鼠脑细胞DNA损伤的初步研究

目的检测大鼠脑细胞经不同浓度液态甲醛体外染毒后所致的DNA损伤。方法Wistar大鼠脑细胞暴露于不同浓度液态甲醛(0.005,0.025,0.125和0.625mmol·L-1)中,染毒1h,利用单细胞凝胶电泳技术(又称彗星实验)检测脑细胞的DNA损伤。结果浓度为0.005和0.025mmol·L-1的甲醛,可造成脑细胞DNA的严重断裂,而0.125和0.625mmol·L-1的甲醛则引起显著的交联作用。结论液态甲醛可造成脑组织DNA的断裂和交联。     

我国汉族人群MxA基因-88位点的基因多态性研究

【目的】研究我国汉族人群MxA基因-88位点的基因多态性。【方法】采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术(PCR-RFLP)方法进行MxA基因-88位点的基因多态性(SNP)分型。【结果】我国汉族人群MxA基因-88位点的GG、GT、TT基因型构成分别为47.3%、43.5%和9.2%,与越南和日本的基因型构成无差别(χ2=1.56,P=0.816)。同时,该位点的G和T等位基因构成分别为69%和31%,与越南和日本的人群该位点的等位基因构成相近(χ2=0.49,P=0.783)。【结论】我国汉族人群MxA基因-88位点的基因多态性与其他民族可能相同。     

端粒酶11-聚体寡核苷酸对肺癌细胞的作用

目的探讨端粒酶11-聚体正义寡核苷酸(S0DN)、反义寡核苷酸(ASODN)对肺腺癌细胞株(SPC-A1)的作用。方法脂质体介导的11-聚体正、反义寡核苷酸与肺腺癌低分化SPC-A1细胞株共培养后，MTT法检测细胞生长抑制率；瑞氏染色后观察细胞形态学变化；流式细胞仪检测细胞周期分布及细胞凋亡。结果①ASODN抑制肺腺癌细胞SPC-A1生长，诱导细胞凋亡。②SODN抑制肺腺癌细胞SPC-A1生长，可能通过诱导细胞分化途径。③无义寡核苷酸(NODN)对肺腺癌细胞SPC-A1生长无抑制。结论ASODN和SODN分别通过诱导细胞凋亡和诱导细胞分化途径抑制肺腺癌细胞SPC-A，生长。     

肌萎缩侧索硬化症家系铜锌超氧化物歧化酶基因突变位点的检测

目的：检测一个具有特殊临床表型的肌萎缩侧索硬化症（ALS）家系的铜、锌超氧化物歧化酶（SOD1）基因突变位点,同时比较单链构象多态性（SSCP）和变性高效液相色谱法（DHPLC）的实用价值.方法：采用SOD1基因的5对引物对部分家系成员基因组DNA进行PCR扩增,分别采用SSCP和DHPLC分析各外显子的多态性,异常样本进行DNA直接测序.结果：①两种方法均发现家系成员Ⅱ5、Ⅲ1、Ⅲ3、Ⅲ13、Ⅲ20、Ⅳ1、Ⅳ20的第2外显子和家系成员Ⅲ1、Ⅲ11、Ⅲ20第5外显子存在突变,直接测序证实第2外显子编码区和第5外显子非编码区均插入了一个碱基A.②DHPLC还发现家系成员Ⅲ1的第4外显子有杂合子色谱,直接测序证实其第4外显子存在杂合子,发生了GAA→GGA错义突变.结论：①该家系SOD1基因第2、4、5外显子均存在突变,第2外显子的突变可能是引起该家系发病的原因.②DHPLC技术与PCR-SSCP相比有更高的敏感性,可作为大样本筛查突变位点的一种便捷、可靠的手段.     

肾素基因单核苷酸多态与心肌梗死的关系

目的 检测中国人群中肾素基因的单核苷酸多态（SNPs）及其分布，探讨其与中国华东地区汉族人群心肌梗死的关系。方法PCR一直接测序技术检测24份取自中国不同民族人群的DNA样本，筛查肾素基因启动子区、编码区和外显子-内含子连接区，明确SNPs及其分布；应用PCR-直接测序和SnaPshot法对所发现的SNPs进行基因分型。选择380份无血缘关系的中国华东地区汉族人群（195例心肌梗死和185例健康对照）DNA样本，进行肾素基因候选SNPs的病例一对照关联分析和单倍型分析。结果所检测的5247bp肾素基因序列中共发现8个SNPs，其基因型和等位基因频率分布，在对照组和心肌梗死组间无统计学差异（P〉0．05）；单倍型分析显示启动子区域单倍型频率分布，在两组人群间无显著性差异（P〉0．05）。结论肾素基因可能不是中国华东地区汉族人群心肌梗死发病的易感基因。     

核酸对淋巴细胞DNA损伤修复的影响

目的 研究核酸对大鼠淋巴细胞DNA损伤的保护作用。方法 纯种雄性健康Wistar大鼠，随机分为4组：空白组、模型组、核酸低剂量组、核酸高剂量组。空白组正常饮水，其余3组饮0．8％醋酸铅水溶液，核酸组灌胃核酸，空白组、模型组灌蒸馏水，5周后，采用单细胞凝胶电泳技术对外周血淋巴细胞DNA损伤进行分析。结果 模型组大鼠淋巴细胞DNA的迁移率和尾长显著高于空白组，核酸组大鼠淋巴细胞DNA的迁移率和尾长显著低于模型组，在统计学上差异有显著性（P〈0．05）。结论 慢性铅染毒可致大鼠淋巴细胞DNA损伤，饮食核酸对淋巴细胞DNA损伤具有一定的保护作用，可减轻铅中毒引起的氧化损伤。