利用SELDI技术检测大鼠肝纤维化组织的实验研究

目的初步建立表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF/MS)技术检测大鼠肝纤维化组织样本的方法。方法采用SELDI技术及弱阳离子交换表面蛋白芯片(CM10)对组织样本进行分析,从组织样本制备、组织裂解液选择、上样浓度控制、重复性验证等方面进行实验条件的优化,并对大鼠肝纤维化组和对照组肝组织各4例进行差异蛋白分析。结果液氮研磨法结合含两性电解液和蛋白酶抑制剂的裂解液处理样本,以及组织蛋白样本浓度为5μg/μl时,芯片检测得到的蛋白峰强度和蛋白数量最优;对两组样本重复检测3次,蛋白丰度的平均变异系数(CV值)分别为0.105和0.155;两组样本共检测到292个蛋白峰,其中差异表达蛋白54个,在肝纤维化组中表达上调16个,表达下调38个。结论初步建立了SELDI技术检测组织样本的方法,并初步筛选出大鼠肝纤维化差异表达蛋白。     

血清蛋白质谱模型的建立及在乳腺癌诊断中的应用

目的建立健康女性人群、乳腺癌患者血清蛋白质谱模型，并探讨对乳腺癌诊断的临床意义。方法应用表面加强激光解析电离化飞行时间质谱（SELDI—TOF—MS）技术，以弱阳离子交换芯片（CM10）结合血清蛋白质，分析60例乳腺癌患者、60例健康对照女性的血清样本，得到其蛋白质谱，用BioMarker Pattern软件分析蛋白质谱图，建立分类树模型并进行盲筛验证。结果乳腺癌患者与健康对照女性比较，筛选出12个差异蛋白质峰（P〈0．001），其中6个标志蛋白呈高表达，6个标志蛋白呈低表达。BioMarker Pattern软件在设定条件下自动选取3个标志蛋白用于建立乳腺癌诊断的分类树模型，此模型灵敏度为91.90％，特异度为81．25％。结论利用SELDI—TOF—MS技术可筛选出乳腺癌患者和健康对照女性血清蛋白质谱存在的差异蛋白质峰，可作为乳腺癌检测、随访监测的指标。     

应用蛋白质芯片技术研究艾灸对大鼠胃黏膜损伤修复相关蛋白质的差异表达

目的：观察艾灸对大鼠胃黏膜损伤修复过程中相关血清蛋白质的差异表达。方法：40只大鼠随机分为正常组、模型组、经穴组和非经穴组。将模型组、经穴组和非经穴组大鼠制成胃黏膜损伤模型,造模成功后,经穴组取梁门、足三里艾灸,非经穴组取以上两穴外侧旁开0.5 cm艾灸。治疗10 d后应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质（SELDI-TOF-MS）技术筛选大鼠血清蛋白质的表达。结果：与正常组比较,模型组大鼠血清有5个蛋白质峰差升高。与模型组比较,经穴组大鼠有3个蛋白质峰增高;非经穴组8个蛋白质峰增高,4个降低。与非经穴组比较,经穴组大鼠血清蛋白质峰4个增高,3个降低（P〈0.05）。结论：艾灸可促进胃黏膜损伤修复特异相关的蛋白质差异表达,且存在一定的经脉脏腑相关性。     

应用SELDI-TOF-MS技术筛选肝癌血清蛋白标记物

目的 运用表面增强激光解吸附/离子化时间飞行质谱技术(SELDI-TOF-MS)检测肝癌患者血清蛋白质的特异性生物标志,建立筛选血清蛋白质图谱模型并初步验证.方法 选择肝癌患者30例,HBV阳性携带者20例及正常人20例,应用SELDI-TOF-MS技术及相应的计算机软件进行比较分析,检测肝癌血清蛋白质的特异性生物标志,建立肝癌的筛选模型,并对其进行了双盲法验证.结果 肝癌组与对照组共有25个蛋白质差异有显著性,以其中5个蛋白标志物(6 888、13 764、6 487、3 450和6 814 Da)建立的筛选模型检测灵敏度为96.7％( 29/30),特异性为90.0％(36/40),盲法验证,灵敏度为95.5％(21/22),特异性为90％(27/30).结论 SELDI-TOF-MS技术具有高灵敏度和特异性,在肝癌的诊断及肿瘤特异性生物标志的筛选等方面具有一定价值.     

Study on the plasma proteomic profiling by using surface enhanced laser desorption ionization time of flight mass spectrometry for setting up a diagnostic model of endometriosis

Objective To determine the plasma proteomic profiling by using surface enhanced laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (SELDI-TOF-MS) combined with bioinformatics for screening biomarkers of endometriosis and primarily setting up a diagnostic model of endometriosis.Method.Thirty-six patients with endometriosis diagnosed laparoscopically and thirty-five healthy controls were included in the study.Their serum were analyzed by SELDI and protein chip to generate protein profiling spectra.Student t test was used to compare the peak intensifies of the protein profiling results from the different groups.Biomarker Pattern Software was used to analyze the data between two groups and set up a diagnostic model for endometriosis.Protein profiling spectra from sixteen endometriosis patients and fifteen healthy controls were used double-blindedly to test the efficiency of the diagnostic model and generate the sensitivity and specificity of the model.Result Fourteen abnormally expressed protein peaks were detected in the plasma of patients with endometriosis (P＜0.01).The endometriosis diagnostic model was composed of three protein peaks.It correctly identified 33 of 36 patients with endometriosis and 29 of 35 controls in the training test.In the masked set 14 of 16 patients with endometriosis and 12 of 15 normal controls were correctly identified with sensitivity of 87.5% and specificity of 8o%.Conclusion Patients with endometriosis have a unique cluster of proteins in plasma detected by SELDI.SELDI provides a new approach for screening novel biomarkers of endometriosis.Its utility in clinical practice need further study.     

双向电泳筛选矽肺模型大鼠肺组织差异蛋白

目的应用双向电泳技术筛选矽肺相关蛋白。方法对Wistar雄性大鼠气管灌注法染尘,于1、2、4、8周处死大鼠,观察矽肺模型情况,提取总蛋白进行双向电泳(2-DE)筛选差异蛋白,后通过表面加强激光解吸电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)进行鉴定。结果至8周时肺组织中矽结节及纤维化明显,双向电泳共分离出45个差异点,质谱分析后得到Prx-1、alpha-enolase、macrophage-capping protein、GAPDH、S-100A8、actin 6个差异蛋白。结论双向电泳技术获得了矽肺模型大鼠的肺组织差异蛋白点,质谱分析得到差异蛋白。     

应用SELDI-TOF-MS技术筛选肺鳞癌和肺腺癌患者差异蛋白的研究

目的 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术筛选出不同病理类型肺癌患者血清、支气管肺泡灌洗液(BALF)和肺癌组织中的差异蛋白,并探讨其临床意义.方法 选用WCX-2芯片、SELDI-TOF-MS技术检测20例肺鳞癌、20例肺腺癌和20例肺良性病变患者血清、BALF和肺组织匀浆的蛋白质谱,用Biomarker Pattern软件分析肺鳞癌和肺腺癌的差异蛋白并初步建立诊断模型.结果 ①肺鳞癌组与肺良性病变组:在血清、BALF、肺组织匀浆中发现存在2、9、8个差异蛋白峰(P＜0.05),分别选用其中质荷比为5 124.24、7 967.29联合10 843.45、7914.59联合8709.66的差异蛋白波峰建立分类树模型,其诊断肺鳞癌的灵敏度分别为85％、80％、75％,特异度分别为65％、80％、90％,正确率分别为75％、80％、83％,阳性预测值分别为71％、80％、88％,阴性预测值分别为81％、80％、78％,其相对应ROC曲线下面积分别为0.750、0.916、0.930.②肺腺癌组与肺良性病变组:在血清、BALF、肺组织匀浆中发现存在8、9、7个差异蛋白峰(P＜0.05),分别选用其中质荷比为9295.79、7923.01、2452.49的差异蛋白波峰建立分类树模型,其诊断肺腺癌的灵敏度分别为75％、80％、70％,特异度分别为65％、90％、85％,正确率分别为70％、85％、78％,阳性预测值分别为68％、89％,82％,阴性预测值分别为72％、82％、71％,其相对应ROC曲线下面积分别为0.844、0.933、0.825.结论 肺鳞癌和肺腺癌BALF及肺组织匀浆中的差异蛋白较血清多,诊断效率比血清高,肺鳞癌BALF中质荷比为7967.29和10843.45的差异蛋白峰联合、肺组织匀浆中质荷比为7914.59和8709.66的差异蛋白峰联合建模及肺腺癌BALF中质荷比为7923.01的差异蛋白峰建立分类树诊断模型,其诊断的灵敏度、特异度和正确率可达到75％～90％,有可能作为诊断肺鳞癌和肺腺癌的标志蛋白.