The expression profile of the <Emphasis Type="Italic">Tuber borchii</Emphasis> nitrite reductase suggests its positive contribution to host plant nitrogen nutrition

Ectomycorrhizal symbiosis is a ubiquitous association between plant roots and numerous fungal species. One of the main aspects of the ectomycorrhizal association are the regulation mechanisms of fungal genes involved in nitrogen acquisition. We report on the genomic organisation of the nitrate gene cluster and functional regulation of tbnir1, the nitrite reductase gene of the ectomycorrhizal ascomycete Tuber borchii. The sequence data demonstrate that clustering also occurs in this ectomycorrhizal fungus. Within the TBNIR1 protein sequence, we identified three functional domains at conserved positions: the FAD box, the NADPH box and the two (Fe/S)-siroheme binding site signatures. We demonstrated that tbnir1 presents an expression pattern comparable to that of nitrate transporter. In fact, we found a strong down-regulation in the presence of primary nitrogen sources and a marked tbnir1 mRNA accumulation following transfer to either nitrate or nitrogen limited conditions. The real-time PCR assays of tbnir1 and nitrate transporter revealed that both nitrate transporter and nitrite reductase expression levels are about 15-fold and 10-fold higher in ectomycorrhizal tissues than in control mycelia, respectively. The results reported herein suggest that the symbiotic fungus Tuber borchii contributes to improving the host plant’s ability to make use of nitrate/nitrite in its nitrogen nutrition.     

儿童肾上腺皮质癌表达谱时序分析用于筛选相关靶点的研究

目的 探讨肾上腺皮质癌（ACT）潜在致病机制,并筛选出可能作为相关生物靶标的基因。方法 从基因表达数据库Gene Expression Omnibus（GEO）中选取儿童ACT相关RNA芯片数据集（GSE75415）,利用R语言的相关函数包对其中的18个ACT组织样本（实验组）以及7个正常肾上腺皮质组织样本（对照组）中的mRNA表达数据进行预处理差异表达分析,对ACT各分级（stage1~4）的差异表达基因（DEGs）和重合差异基因（OLDEGs）,采用功能富集分析（GO功能富集和KEGG通路）,并筛选出中心基因。同时对TCGA数据库包括79个ACT样本的二代测序数据进 行分析,筛选出对ACT患者生存时间有影响的基因。结果 Stage1～4分别有248、334、315和561个基因发生了差异表达,各分级样本组间存在73个重合基因（OLDEGs）,中心基因HSPA13、GARS、STXBP1、AKIRIN1、TUBB3在各分级中均表达上调,中心基因ADH1B、DCN、RASSF2、PDGFRA、PLAT、C3、FOS在各分级中均表达下调,它们通过影响免疫反应、细胞周期、磷酸化、凝血及相应的信号通路,对ACT的发生与发展发挥作用。另外,OLDEGs在79个TCGA数据库ACT样本生存期分析发现,基因XPO1、RACGAP1、PDGFD、NR4A2、MXRA5、VPS51、TMED3、NDFIP1和CDKN1C与ACT的生存期密切相关。结论 在各级中均差异表达的基因和生存期相关基因可以作为ACT治疗的新靶点,这将有助于进一步理解肾上腺皮质癌的病因和预后治疗。     

MMP-2蛋白及E-cad蛋白在胰腺癌组织中的表达及临床意义探索和研究

目的探讨MMP-2蛋白及E-cad蛋白在胰腺癌组织中的表达及临床意义。方法收集2011年12月至2013年1月本院确诊的胰腺癌组织标本30例设为观察组,收集同期正常胰腺组织10例设为对照组,采取免疫组织化学法对两组胰腺组织中MMP-2、E-cad的表达情况进行观察。结果观察组MMP-2蛋白阳性率为93.33%,E-cad蛋白阳性率为96.67%;对照组MMP-2蛋白阳性率为60%,E-cad蛋白阳性率为20%,观察组的MMP-2蛋白阳性率及E-cad蛋白阳性率均显著高于对照组,P<0.05,有统计学意义;MMP-2蛋白、E-cad蛋白阳性表达和胰腺癌的分化程度有一定关联;MMP-2蛋白、E-cad蛋白阳性表达和胰腺癌是否存在淋巴结转移有一定关联。结论 MMP-2蛋白在胰腺癌组织中呈高表达,E-cad蛋白在胰腺癌组织中呈低表达,且二者表达情况和胰腺癌组织的分化程度以及是否存在淋巴结转移均有密切关联。     

PRKACB 表达在非小细胞肺癌的临床病理意义及预后分析

目的：测定PRKACB蛋白在非小细胞肺癌中的表达情况,研究其临床病理意义,分析其表达与预后的相关性。方法应用免疫组织化学法测定109例非小细胞肺癌及其中对应的20例癌旁组织内PRKACB蛋白水平,结合临床资料及预后随访情况进行多因素分析。结果与癌旁组织相比, PRKACB在109例非小细胞肺癌组织内蛋白水平下调,低表达率（69．7％）显著高于20例癌旁肺组织（10．0％）（χ2＝25.217,P＜0.05）;PRKACB蛋白在非小细胞肺癌组织中的表达与分化程度（χ2＝9．664,P＜0．05）、淋巴结转移情况（χ2＝4．430,P＜0．05）、肿瘤分期（χ2＝4．430,P＜0．05）相关;PRKACB蛋白的低表达与肿瘤患者预后（总生存期及无瘤生存期）不良相关。结论 PRKACB在非小细胞肺癌内呈现低表达,并与临床相关,可能成为非小细胞肺癌临床诊断的一个重要指标。     

VEGF、TGF-β1、NF-κBp65在颅内海绵状血管瘤的表达及意义

目的探讨脑海绵状血管瘤（CCH）组织血管内皮细胞生长因子（VEGF）、转化生长因子β1（TGF-β1）、核转录因子κBp65（NF-κBp65）的表达及意义。方法收集我院2009年6月到2011年12月CCH标本27例,脑动静脉畸形（AVM）标本9例和正常脑组织标本（颅脑损伤或癫痫术中切取的脑组织）6例,用免疫组化方法检测VEGF、TGF-β1、NF-κBp65的表达。结果CCH组织VEGF、NF-κBp65阳性表达率（分别是96．3％和70．4％）显著高于正常脑组织（分别为33．3％和0;P〈0．05）,而与脑AVM组织（分别是77．8％和44．4％）无显著差异（P〉0．05）;脑AVM组织TGF-β1表达阳性率（100％）显著高于CCH组织（33.3％,P〈0．05）和正常脑组织（16．7％,P〈0．05）。结论VEGF、TGF-β1、NF-κBp65在不同组织表达水平不一样,提示VEGF、NF-κBp65与CCH形成有关,而TGF-β1可能在其形成过程中意义不大。