应用HMM和加权距离判别法的真核基因识别程序研究

根据现代科学对基因的认识，应用了隐马尔科夫模型(HMM)的算法，以大量核酸序列为信息来源，通过计算机计算来寻找未知基因的大体位置；再通过基因的固有结构特征及密码子使用的偏向性，使用加权距离判别法来准确地定位基因，以图形及文本的形式输出，从而极大地方便了实验室的研究工作。考虑到基因的许多特征还不为人们所了解，而且不同物种之间基因结构又有一定的差异，所以还开发了程序自学习功能，不断地存储已知的基因，再据此改变一些已有固有数据，以便更好地适应和了解不同生物基因结构的特异性，更加准确地寻找未知基因的位置。     

原位杂交法检测BP1基因在乳腺癌组织中表达

目的探讨BP1同源盒基因在乳腺癌中的表达及其与临床病理指标的关系。方法收集165例乳腺癌临床和病理资料,采用原位杂交法检测BP1的表达,同时用二步法进行ER、p53、PCNA、bcl2、cerbB2免疫组化染色。结果BP1基因表达率为67.88%,免疫组化:ER70.30%、p5349.09%、PCNA74.55%、bcl253.33%、cerbB275.52%。BP1与bcl2具有相关性(P<0.01),且均与ER相关(P<0.05),与p53呈负相关(P<0.05)。BP1与PCNA、cerbB2、患者年龄、组织学类型、淋巴结转移等无相关性。结论BP1可能通过某种非依赖p53基因调控机制,与bcl2、ER协同抑制肿瘤细胞的凋亡而参与乳腺癌的发生。     

CD44v7/8基因表达与宫颈癌关系的探讨

目的探讨宫颈癌组织中CD44v7/8基因的异常表达及临床意义。方法1986～2000年沈阳医学院附属中心医院采用免疫组化的方法随机测定59例宫颈癌、18例尖锐湿疣和18例慢性宫颈炎组织中CD44v7/8基因的表达情况。结果宫颈癌、尖锐湿疣及慢性宫颈炎3种疾病中CD44v7/8表达阳性率分别为76.27%、11.11%和11.11%,宫颈癌组的CD44v7/8表达分别高于慢性宫颈炎组及尖锐湿疣组,且差异非常显著(P<0.01)。慢性宫颈炎组及尖锐湿疣组比较差异无显著性(P>0.05)。结论CD44v7/8蛋白的表达增强与宫颈癌的发生、发展及和局部浸润转移有关。     

The role of Self-Defined Race/Ethnicity in Population Structure Control

Population-based association studies are powerful tools for the genetic mapping of complex diseases. However, this method is sensitive to potential confounding by population structure. While statistical methods that use genetic markers to detect and control for population structure have been the focus of current literature, the utility of self-defined race/ethnicity in controlling for population structure has been controversial. In this study of 1334 individuals, who self-identified as either African American, European American or Hispanic, we demonstrated that when the true underlying genetic structure and the self-defined racial/ethnic groups were roughly in agreement with each other, the self-defined race/ethnicity information was useful in the control of population structure.     

CAD基因原核表达载体的构建及表达产物的活性鉴定

目的构建pCool—GST—ICAD／CAD的表达载体，并存大肠杆菌BL21（DE3）中表达具有生物学活性的CAD核酸酶？方法用PCR扩增CAD基因，将扩增产物克隆入pCool—GST—ICAD载体中构建出pCool—GST—ICAD／CAD表达载体。经酶切和电泳鉴定正确后，在大肠杆菌BL21（DE3）中诱导表达，表达产物经亲和层析、离子交换层析及凝胶过滤等方法分离纯化。最后用SDS—PAGE和DNA降解实验进行鉴定。结果构建了pCool—GST—ICAD／CAD原核表达载体，重组载体转化后表达出毫克级水平的GST—ICAD／CAD蛋白复合体。经分离纯化后得到纯度很好的CAD—ICAD篮白复合体，在SDS—PAGE电泳上旱现清晰的两条蛋白带。经DNA降解实验证明纯化所得的CAD蛋白具有非特异性降解DNA的核酸酶作用。结论成功制备了具有生物学活性的CAD核酸酶，为进一步研究细胞凋亡的作用机制提供了有效的制剂。     

上海地区汉族优秀游泳运动员ACE基因I/D多态性研究

目的:探讨上海地区汉族不同水平优秀游泳运动员ACE(血管紧张素转化酶)基因I/D多态性的分布特点。方法:采用PCR方法,对上海地区85名汉族优秀游泳运动员和90名汉族普通人的ACE基因I/D多态性进行检测。结果显示,上海地区汉族优秀游泳运动员的ACE基因的基因型和等位基因频率与上海和成都地区汉族普通人无明显差异(P>0.05);上海地区汉族游泳运动员和普通人以及成都地区汉族普通人的基因型和等位基因频率均与高加索人群存在高度显著性差异(P<0.0001),表现出明显的种族差异性。7名上海地区汉族国际健将ACE基因均为II型,运动水平越高的组别,II基因型和I等位基因频率越高,提示具有II基因型或I等位基因频率高的运动员经过多年运动训练,具有成为优秀运动员的可能,特别是II基因型的运动员可能性更大。     

高度近视的病因学研究进展

高度近视发生的内因、外因，包括遗传倾向，相关基因定位，巩膜胶原白体免疫学说，视网膜生物活性物质失调学说，环境因素等，本研究就这些因素对高度近视发病的影响做一综述。现统一的认识有：①高度近视具有明显的遗传倾向。②迄今为止，已找到4个高度近视相关基因，它们的遗传方式均为常染色体显性遗传。③高度近视的巩膜组织病理改变和胶原代谢障碍引发了人们对高度近视免疫相关基因的深入研究。已发现HLAⅡ类基因与部分高度近视具有相关性。④视网膜中存在的生物活性物质直接或间接参与了形觉剥夺性近视的形成。⑤环境因素并非高度近视发病的决定因素，它仅起一定程度的促进作用。将今后的工作重点放在高度近视基因定位的研究，基因表达的调控及巩膜胶原代谢、网膜生物活性物质之间的关系研究上，无疑会进一步揭示高度近视的病因，为防治高度近视开辟新途径。     

献血者HBsAg多位点变异1例

我国是HBV的高流行区，HBsAg流行率在10％左右。因此在采供血中HBV的筛查显得尤为重要。目前所用的ELISA方法检测HBsAg有着很高的灵敏度和特异性．有效防止了HBV的经血传播。然而HBV在复制过程中涉及逆转录，大大增高了碱基错配的频度，为HBV迅速变异提供了分子基础。随着HBV疫苗接种的不断推广和高效价免疫球蛋白以及抗病毒药物的应用，一方面有效切断和抑制了HBV的感染、传播和复制，另一方面也导致变异株的出现。我们从献血者中发现了1例HBsAg发生变异的个体，并分析其基因序列，研究其对检测的影响，现报告如下。