A good ligand is hard to find: Automated docking methods

Summary Many approaches have been developed for solving the docking problem: Predict the structure and binding free energy of a ligand-receptor complex given only the structures of the free ligand and receptor. We review major approaches for docking small-molecule ligands to receptors and focus on the successes and limitations of their application to drug design.     

结肠癌免疫相关 lncRNA 风险预测模型的建立

目的 分析影响结肠癌预后的免疫相关 lncRNA, 并构建预测结肠癌患者预后的相关预测模型。 方法 下载 TCGA 数据库中的结肠癌 lncRNA 表达谱, 数据经 TPM 标准化后分析所有 lncRNA 的差异性表 达, 其中缺失值的补充采用 KNN 法, 通过共表达方法提取并鉴定免疫相关 lncRNA, 然后对差异性表达的 lncRNA 进行 LASSO 回归分析, 再进行单因素和多因素 COX 回归分析。 最后使用 R 4. 0. 2 统计学软件的 ggplot2 包基于 lncRNA 风险评分与基因表达关系, 构建风险因子关联图、 KM 曲线及评价模型预测价值的 ROC 曲线。 结果 经过表达差异性分析发现, 共有 2 258 个 lncRNA 在癌和癌旁组织中差异性表达, 其中上 调的有 1 648 个, 下调的有 610 个。 选取差异表达前 100 位的免疫相关 lncRNA 进行 LASSO 回归分析, 共筛 选出 12 个 lncRNA, 再进行单因素和多因素 COX 回归分析后显示 AC092723. 1、 AC007182. 1 和 AC004947. 1 与预后明显相关, 使用 R 4. 0. 2 统计学软件构建预后风险因子关联图, ROC 曲线显示其预测 1 年、 3 年和 5 年的预测价值均较高, 其 AUC 分别为 0. 79 (95 % CI: 0. 67 ~ 0. 91), 0. 78 (95 % CI: 0. 66 ~ 0. 9), 0. 7 (95 % CI: 0. 51 ~ 0. 9)。 结论 研究使用 TCGA 公共数据库进行生物信息学分析并构建的预后模型显示有 较高的预测价值, 除具有一定的临床意义外, 对未来 lncRNA 相关结肠癌的研究也提供了一定的方向。     

Drug effects on clinical laboratory tests

Drugs and xenobiotics can affect clinical laboratory test results either by interfering with the analytical systems themselves, or by influencing endogenous constituents. National and international bodies have brought widespread recognition to this problem and have proposed protocols for its thorough scientific study. In this survey the authors discuss studies in their laboratories concerning the effects of drugs on thousands of patients undergoing a routine clinical screen. A database is described for storing both patient information and a detailed analysis of the published literature on drug effects. Analytical interferences in clinical tests must be examined in validating the procedure. However, highly specific analytical techniques are increasingly helping to reduce such interferences. Biological effects can be classified as physiological, pharmacological or toxicological. In some cases, biological effects can be used to advantage in monitoring treatment by potentially hazardous drugs, such as the cardiac glycosides. The requirement for a well-defined reference population for each drug and for access to all clinical and medical data for each patient is discussed. The need for greater awareness of the influence of drugs on clinical laboratory results is considered, together with the suggestion that the health professions should try to exploit such effects in monitoring possible toxicity problems, in defining genetic constitution and in designing medication programmes.     

药物治疗方案咨询系统的研究

目的：建立药物治疗方案咨询系统。为医院药师开展药学服务提供一种新型工具。方法：对临床疾病药物治疗方案的相关资料进行收集整理，按国际疾病分类(ICD)系统分类。使用Access建立数据库，运用VB、ASP语言、Java Script脚本语言实现前台咨询与后台数据库之间的互动。结果：建立了3650种疾病的药物治疗方案咨询系统，将疾病药物治疗方案信息资源由传统媒体转变为以光盘、网络等为载体的数字化媒体，实现了信息资源的共享和充分利用。结论：药物治疗方案咨询系统在大、中、小型医院及门诊部等医疗单位的单机、局域网和互联网上应用，证实该系统是医院药师参与临床疾病药物治疗，为病人提供药学服务，提高医疗质量的有力工具。     

住院病人膳食服务管理系统的开发研制

本文阐述了应用掌上电脑核心技术和数据库技术开发的住院病人膳食服务管理系统的基本实现方案     

数据挖掘技术在医学影像中的应用

介绍数据挖掘技术的背景、定义及基本流程，医学影像学数据的特点及医学影像数据挖掘的关键技术，这门技术在医学影像学中的应用：提高影像质量和边缘提取；组织定征和概念描述；医学影像管理与检索。     

基于ODS构建医院即时联机分析处理系统的研究

面向医院管理者在日常管理全过程中对信息服务的需求,基于HIS数据资源,研究了应用ODS技术进行数据集成整合的技术方法,提出了在医院HIS数据库基础上建立ODS的策略。     

基于Internet的生物信息资源快速查找与利用

生物信息学是现代生命科学与信息科学、计算机科学、数学、统计学、物理学、化学等学科相互渗透而高度交叉形成的一门新兴前沿学科.生命科学的所有信息均可由计算机和因特网来进行储存、分析和传输.因特网为我们提供了大量的有关生物信息相关的数据、工具、文献、软件等资源.本文根据笔者的实践经验,对因特网上生物信息资源进行了整理和分类,总结了因特网上获取生物信息资源的途径及其利用,介绍了一些快速查找方法与技巧,以便读者更迅速更准确利用因特网上生物信息资源.     

用于存储传输和分析的12导联同步心电图标准化系统的设计

不同厂商生产的心电图机输出的数据格式不同,这给数据的传输、交换和分析造成了很大的障碍。作者旨在建立基于web的用于心电图数据存储、传输和分析的各医院门诊之间统一的心电图标准化系统。把心电图机输出的文件(标准心电图协议格式SCP)中记录头文件采集到设计的标准数据库,实现了对不同品牌心电图机心电图存储和分析功能。