Clinical application of metagenomic next‐generation sequencing technology in the diagnosis and treatment of pulmonary infection pathogens: A prospective single‐center study of 138 patients

IntroductionRapid and accurate pathogen identification is essential for the treatment of pneumonia. Metagenomic next‐generation sequencing (mNGS) is a newly developed technology to obtain microbial nucleic acid sequence information quickly, efficiently, and without bias.MethodsWe performed shotgun metagenomic next‐generation sequencing (mNGS) of bronchoalveolar lavage fluid (BALF) for pathogen identification in pneumonia in a prospective study with 138 patients from a single center. We compared the results of mNGS with standard methods including culture, staining, and targeted PCR and evaluated the clinical applicability of mNGS.ResultsMost of the patients (128/138, 92.75%) were cured or improved. One patient (1/138, 0.72%) died because of acute gastrointestinal bleeding, and 9 patients (9/138, 6.52%) showed no improvement. mNGS identified more bacteria (53 versus 27), fewer fungi (8 versus 31), and more viruses (16 versus 1) than standard methods. In total, treatment in 34 out of 138 cases (24.64%) was adjusted and optimized because of mNGS results. Positive mNGS results contributed to a definitive diagnosis in 23 cases (16.67%), which helped guide treatment decision by either adjusting the antibiotics without de‐escalation or continuing the empirical treatment. mNGS also confirmed no active infection in 11 cases (7.97%) allowed for antibiotic de‐escalation.ConclusionThis prospective clinical study evaluated the clinical utility of mNGS for the diagnosis of pneumonia and showed that mNGS of BALF provides valuable information for effective treatment.     

两种腹腔灌洗引流方法在急性重症胰腺炎中的应用比较

目的比较两种腹腔灌洗引流方法在急性重症胰腺炎的应用。方法对43例ICU重症胰腺炎患者分别行腹膜透析管置入灌洗引流或双套管引流管置入并负压吸引引流,统计分析比较两组效果及并发症发生率。结果腹透管灌洗引流组患者的手术时间、术中出血量少于双套管负压吸引组(P<0.05);双套管负压吸引组血淀粉酶恢复情况、腹胀发生率明显低于腹透管灌洗引流组(P<0.05)。住院时间、死亡率及腹腔脓肿、胰瘘/假性囊肿发生率两组无明显差别(P>0.05)。结论两种引流方法操作简单、方便、安全,双套管负压吸引组有更好的引流效果。     

支气管肺泡灌洗液肿瘤标志物检测对肺癌诊断的价值

目的：探讨支气管肺泡灌洗液（BALF）中3种肿瘤标志物的检测在肺癌诊断及病情评估中的价值。方法：采用电化学发光法、酶联免疫吸附法检测61例确诊的肺癌患者和42例肺良性病变患者BALF中癌胚抗原（CEA）、细胞角蛋白片断19（CYFRA21-1）及神经特异性烯醇化酶（NSE）的含量并进行分析比较。结果：肺癌患者BALF中3种肿瘤标志物的含量均明显高于肺良性病变患者（P〈0．01或P〈0．05）；不同病理类型肺癌中，各肿瘤标志物升高的程度均有所不同，CYFRA21-1在非小细胞肺癌中升高明显，且随着TNM临床分期的升高，其含量亦明显升高。NSE则在小细胞肺癌中升高明显。结论：BALF中3种肿瘤标志物的检测在肺癌的诊断，病理类型的判定及临床分期等方面均有较高的临床价值。     

改良双套管持续冲洗负压吸引在肠瘘治疗中的临床分析

目的 探讨改良双套管持续冲洗负压吸引方法治疗肠瘘的临床效果。方法 回顾性分析2003年2月~2013年9月在本科住院治疗肠瘘患者的临床资料,其中A组27例采用自制双套管连接低负压持续引流,B组24例采用传统单腔引流管,分析和比较两组的住院天数、最高体温、引流液量、吻合口狭窄发生率、再手术率及痊愈时间。结果 A组住院天数、痊愈时间短于B组,引流液量少于B组,吻合口狭窄发生率、再手术率低于B组,两组比较差异有统计学意义（P〈0.05）。结论 术后发生肠瘘应立即采用自制双套管及持续低负压冲洗,较传统治疗方式能取得更好的治疗效果。     

Multi-walled carbon nanotube-induced inhalation toxicity: Recognizing nano bis-demethoxy curcumin analog as an ameliorating candidate

Human beings and ecosystems are being possibly exposed to CNTs, as there is a rise in global production rate of carbon nanotubes (CNTs). This may affect the health of humans and increases the environmental risk. We have already reported the pulmonary toxicity due to the inhalation of MWCNTs. We claim that a compound with anti-inflammatory and antioxidant activity may ameliorate the CNT-induced toxic effect. With this view, we have investigated the ameliorative effect of intravenously-administered nano bis-demethoxy curcumin analog (NBDMCA) against MWCNTs-induced inhalation toxicity by examining the lung histopathology for inflammatory cell dynamics, pulmonary remodeling and estimating the inflammatory biomarkers in the broncho-alveolar lavage fluid. We observed that NBDMCA could ameliorate the injury as evidenced by the decline in the levels of markers of inflammation, cell damage, and the histopathological changes induced by MWCNTs. We conclude that NBDMCA may be used to reduce the risk of MWCNTs-induced inhalation toxicity.     

二甲基阿米洛利对大鼠油酸性急性肺损伤的保护作用

呼吸窘迫综合征（ｒｅｓｐｉｒａｔｏｒｙｄｉｓｔｒｅｓｓｓｙｎｄｒｏｍｅ,ＲＤＳ）是一种死亡率高达５０％以上的以肺泡毛细血管损伤为特征的疾病［１］．油酸（ｏｌｅｉｃａｃｉｄ,ＯＡ）性肺损伤动物模型产生与ＲＤＳ病人相似的表现,已被广泛用于ＲＤＳ发病机理和...     

高氧对新生大鼠肺泡Ⅱ型上皮细胞上皮钠通道转运功能的影响

目的 探讨高氧对新生大鼠肺泡Ⅱ型上皮(alveolar epithelial typeⅡ,ATⅡ)细胞钠转运功能的影响.方法 分离提取新生大鼠ATⅡ细胞,随机分成高氧组和对照组,分别在氧浓度为85％和21％的细胞培养箱中原代培养.应用Western blot方法和全细胞膜片钳技术检测高氧暴露后上皮钠通道(epithelial sodium channel,ENaC)蛋白表达变化及高氧对阿米洛利敏感性钠电流的影响.结果 高氧使新生大鼠ATⅡ细胞中β-ENaC和γ-ENaC表达增加[β-ENaC:(1 d:0.43±0.06 vs0.32 ±0.04,P=0.047;2 d:0.73 ±0.06 vs 0.50±0.08,P=0.019;3 d:0.72±0.08 vs 0.52±0.06,P=0.027);γ-ENaC:(1 d:0.64 ±0.05 vs 0.53 ±0.05,P =0.044;2 d:0.76 ±0.03 vs 0.52 ±0.04,P =0.001;3 d:0.77±0.06 vs 0.61 ±0.05,P=0.025)],同时使阿米洛利敏感性钠电流增强(1 d:13.71±2.77 vs 8.92±1.38,P＜0.001;2 d:29.12±11.03 vs 10.41±1.80,P＜0.001),面对α-ENaC表达表现出一定的抑制作用(1 d:0.31 ±0.05 vs 0.46 ±0.05,P =0.025;2 d:0.30 ±0.01 vs 0.38 ±0.02,P =0.002;3 d:0.37 ±0.06vs 0.37 ±0.08,P=0.983).结论 高氧促进了 ATⅡ细胞ENaC钠转运功能,ENaC功能障碍并非高氧暴露后肺水肿发生的主要原因.     

肺炎支原体肺炎患儿支气管肺泡灌洗液中肺炎支原体耐药基因和13种病原检测结果分析北大核心CSCD

目的:了解肺炎支原体肺炎(MPP)患儿支气管肺泡灌洗液(BALF)中肺炎支原体(MP)耐药基因和13种呼吸道病原的分布情况。方法:回顾性选择2018年1月至2019年1月北京大学第三医院和北京大学第一医院100例MPP患儿的BALF标本,采用荧光定量PCR法检测MP核酸及其耐药基因,采用多重PCR核酸检测技术测定甲型流感病毒、甲型流感病毒H_(1)N_(1)、甲型流感病毒H_(3)N_(2)、乙型流感病毒、人副流感病毒、腺病毒、人博卡病毒、人鼻病毒、肺炎衣原体、人偏肺病毒、MP、人冠状病毒和呼吸道合胞病毒核酸,采用 χ^(2)检验进行分析。 结果:100例BALF标本,荧光定量PCR法检测MP及耐药基因,83例(83.00%)MP阳性,其中78例(93.98%)耐药,均为23S rRNA结构域V区A2063G的点突变。多重PCR法检测13种呼吸道病原,89例(89.00%)阳性。79例(79.00%)检测到MP,其中74例(74.00%)仅检出MP,5例(5.00%)同时检出MP合并其他病原。10例(10.00%)检测出其他病原。0~4岁组病毒检出率高于>4~6岁组( P=0.042)和>6岁组( P=0.002),差异均有统计学意义。 结论:MPP患儿的BALF标本绝大部分可检测到MP,耐药现象严重,以A2063G的点突变为主。少数BALF标本中可检测到其他呼吸道病原和2种或3种病原。     

悬灸“大椎”穴不同灸量对哮喘大鼠神经源性炎性反应的影响

目的:通过观察悬灸"大椎"穴不同灸量对哮喘大鼠支气管肺泡灌洗液(BALF)中神经生长因子(NGF)、P物质(SP)、降钙素基因相关肽(CGRP)和神经激肽A(NKA)、神经激肽B(NKB)、磷酸化细胞外信号调节激酶(pERK)含量的影响,探讨艾灸治疗哮喘的神经源性炎性反应机制以及最佳灸量。方法:SD雄性大鼠60只,随机均分为空白组、模型组、悬灸15min组、悬灸30min组、悬灸60min组、悬灸90min组。于第1天、第8天腹腔注射致敏混悬剂1mL,第15天开始用1%卵白蛋白生理盐水雾化吸入激发哮喘,每日1次,每次20min,共14d。21d后,温和灸"大椎"穴,各组悬灸不同的时间,共治疗7d。运用ELISA双抗体夹心法测定各组大鼠BALF中的NGF、SP、CGRP、NKA、NKB、pERK等神经源性炎性反应相关因子的含量。结果:模型组BALF中NGF、SP、CGRP、NKA、NKB、pERK含量明显高于空白组(P0.01);4个治疗组BALF中NGF、SP、CGRP、NKA、NKB、pERK含量较模型组均有显著降低(P0.01);悬灸15、30、60min组之间各项指标比较差异有统计学意义(P0.01),随悬灸时间的延长,各指标变化更加明显;悬灸60min组与悬灸90min组之间各项指标比较差异无统计学意义(P0.05)。结论:悬灸"大椎"穴通过降低大鼠BALF中NGF、SP、CGRP、NKA、NKB的含量来减轻哮喘的神经源性炎性反应,其信号转导可能通过ERK细胞外信号转导途径;随着灸量的增加,对哮喘大鼠的神经源性炎性反应的改善作用也在增加,艾灸60min是饱和灸量,而90min的治疗时间并不能进一步提高疗效。     

INF-γ基因转染肺泡巨噬细胞抗肿瘤活性的研究

背景与目的活化的肺泡巨噬细胞(alveolar macrophage,AM)具有抗肿瘤功能,γ干扰素(interferon-γ,INF-γ)是巨噬细胞的活化因子之一,其与巨噬细胞体外共同培养可增强巨噬细胞的免疫功能。本研究旨在了解人INF-γ基因体外转染肺癌患者的AM后对其抗肿瘤功能的影响。方法经肺泡灌洗获AM,分离纯化,以INF-γ基因转染AM,以RT-PCR方法和ELISA方法检测人INF-γ基因的成功转染;分别检测AM产生TNF-α、NO、IL-1的水平及AM杀伤L1210细胞的活性。结果 RT-PCR方法和ELISA方法均显示人INF-γ基因已成功转染AM;经人INF-γ基因转染后,肺癌患者AM产生TNF-α、NO、IL-1的水平较对照组明显升高(P<0.05);AM杀伤L1210细胞的活性较对照组明显增强(P<0.05)。结论 INF-γ基因体外转染肺癌患者的AM,能使AM的抗肿瘤活性明显增强。