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蛋白质组学是指对机体、组织或细胞的全部蛋白质的表达和功能模式的研究。目前用于蛋白质研究的支撑手段主要有双向凝胶电泳和质谱分析技术等。肺癌是当前全球癌症发病率最高的恶性肿瘤之一。通过对正常肺和肺癌的组织或血清或细胞的蛋白质组研究,可以直接比较两者之间蛋白质组表达的差异,为肺癌的早期诊断、疗效观察及预后评价等提供指导。 相似文献
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激光捕获显微切割联合SELDI蛋白质芯片筛选肺腺癌早期诊断标志蛋白 总被引:3,自引:0,他引:3
目的 探讨应用激光显微切割(LCM)联合表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱蛋白质芯片(SEL,DI-TOF-MS)及模式识别分类技术-支持向量机(SVM)筛选肺腺癌标志蛋白的可行性.方法 将6例新鲜肺腺癌组织标本及其配对的4例正常肺组织制备8μm厚度冰冻切片,改良HE染色;用LCM技术选择性获取同质腺癌细胞和配对正常肺组织细胞.应用PBSⅡ+型SELDI-TOF-MS分析仪(IMAC芯片)分析腺癌及其配对正常细胞的蛋白质表达谱,比对差异点;应用SVM筛选并验证候选标志蛋白的判别效能.结果 平均每个LCM帽子的激光点数约4000 shots,获得了同质性>95%的肿瘤细胞和正常细胞.比较腺癌和配对正常细胞之间的SELDI谱图,共筛选出84个蛋白峰.将差异最明显的10个蛋白峰作为候选标志蛋白.和正常组织相比,6种蛋白在腺癌中呈低表达,4种蛋白在腺癌中呈高表达.差异有统计学意义(P<0.05).初步筛选出3191 m/z蛋白峰作为腺癌诊断标志蛋白.结论 LCM联合SEIDI蛋白质芯片技术有可能筛选出敏感性高、特异性强的肺腺癌标志蛋白;该技术将为肺腺癌早期诊断研究提供新的强有力的工具. 相似文献
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目的 探讨应用三维鸟枪法( Shot-gun)串联质谱分析技术研究脊髓室管膜瘤和正常室管膜蛋白表达谱的可行性.方法 分别采集8例脊髓室管膜瘤标本和4例室管膜标本获取蛋向,进行十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),考马斯亮篮染色、切胶和酶解,串联质谱获取肽质量指纹图谱并鉴定和生物信息学分析. 结果 室管膜组鉴定组2758蛋白,室管膜瘤组鉴定2721个蛋白.其中1631个蛋白质在肿瘤组和对照组均有表达,1090个蛋白质仅在肿瘤组中表达,1127个蛋白质仅在对照组中表达.结论 SDS-PAGE 三维Shot-gun串联质谱技术为定量比较蛋白组学研究脊髓室管膜瘤奠定了技术平台. 相似文献
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目的研究不同组织裂解液对ELISA检测细胞因子浓度的影响。方法 RIPA、PBS及ELISA试剂盒自带的稀释液分别用于稀释IFNγ,IL-10,IL-6,TNFα细胞因子的标准品,并对标准品进行检测。结果 RIPA稀释液显著抑制IFNγ标准品检测结果。结论 ELISA检测细胞因子时需要根据检测的细胞因子的不同,选择相应的裂解液对样本进行处理。 相似文献
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An attempt had been made to isolate and identify the low polar volatile constituents from Isodon excisa. The dried plants were heat extracted with ethanol and then extracted with petroleum ether. The constituents were isolated and analyzed by GC-MS and then we retrieved them on NIST08 mass spectrometry database to determine their structures. Finally, successful results were achieved, 111 compounds were obtained and identified. 105 of them were reported for the first time in Isodon excisa and 22 of them were first found in natural products. Thus, the main constituents of it were found to be Sitosterol (33.28%), 3-Amino-4-pyrazolecarbonitrile (9.55%). 相似文献
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∶以溶剂萃取法从白柠檬果皮提取精油,并用硅胶柱将精油分成碳氢化合物和含氧化合物两大部分. 利用气相色谱和质谱联用系统测定了白柠檬果皮油的香气成分,并依据各成分的保留指数,鉴定出75种挥发性成分. 其中有23种碳氢化合物、12种醇类物质、17种醛类物质、11种酯类物质、2种酚类物质、2种醚类物质和8种酮类物质. 相似文献
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目的基于串联质谱标签(TMT)技术,从蛋白质组学层面研究肌萎缩侧索硬化(ALS)患者脑脊液(CSF)中的差异性表达
蛋白,探讨ALS发病的机制和相关作用途径。方法选取2017年11月~2018年4月于中国人民解放军联勤保障部队第928医院
和中南大学湘雅医院神经内科就诊5例延髓起病ALS患者和5例肢体起病ALS患者,以5例偏头痛及低颅压头痛的患者为健康
对照,分别获取CSF,利用串联质谱标签(TMT)技术鉴定CSF中差异性蛋白质,并进行生物信息学分析。结果共鉴定并定量
1530种蛋白。延髓起病ALS患者中48种蛋白表达上调,6种蛋白表达下调;肢体起病ALS患者中16种蛋白表达上调,19种蛋
白表达下调。GO分析显示这些蛋白均参与细胞生理过程、单器官过程和生物调节等过程,在细胞内和细胞外均有分布,且具有
结合功能、催化活性和受体活性等。KEGG通路分析显示,延髓起病ALS患者CSF中上调蛋白参与溶酶体和代谢等3条通路。
肢体起病ALS患者CSF中下调蛋白参与补体和凝血级联途径、金黄色葡萄球菌感染和单纯疱疹感染等7条通路,各通路均包含
补体成分。结论延髓起病和肢体起病的ALS患者CSF中均存在差异性表达蛋白。溶酶体通路参与延髓起病ALS的发生和发
展,免疫反应参与肢体起病ALS的发生和发展。 相似文献