药理学线上线下混合式教学模式的探索与实践

药理学是医药院校重要的基础学科,在指导临床合理用药和新药研发中发挥重要作用.随着近年来线上教学的广泛应用与开展,优势和缺点逐渐显露.分析线上与线下教学的特点,设计药理学课程线上和线下混合式教学模式,发挥二者的优势,提高教学效果.     

蒙药槟榔十三味丸（高尤-13）止痛作用网络药理学机制研究

目的：应用网络药理学、体外实验技术,预测以及验证蒙药槟榔十三味丸的止痛作用机制。方法：TCMSP数据库及文献挖掘获取槟榔十三味丸的化学成分,SwissTargetPrediction及Uniprot数据库预测成分相关靶点信息,检索OMIM等疾病靶点数据库,收集疼痛、炎症疼痛、抑郁疼痛及神经疼痛的靶点,映射至槟榔十三味丸活性成分靶点基因,构建“活性成分-靶点”网络,STRING数据库获取蛋白相互作用关系网络信息,DAVID数据库进行GO生物过程富集分析和KEGG信号通路富集分析。HEK293细胞转染TRPV1、TRPA1质粒,制备hTRPV1/HEK293细胞和hTRPA1/HEK293细胞模型,采用全细胞膜片钳技术检测槟榔十三味丸水提取物干预转染细胞后对细胞跨膜电流的影响。结果：从槟榔十三味丸的13味药材中共得86个化学成分,筛选出805个复方治疗疼痛靶点、732个治疗炎症疼痛靶点、713个治疗抑郁疼痛靶点及793个治疗神经疼痛靶点,与热敏通道（TRPA1、TRPV1及TRPV2等）相关化合物21个,共涉及135条信号通路。体外实验结果表明,槟榔十三味丸水提取物能够激活TRPA1/HE...     

“乳病消片”抗乳腺癌作用机制研究：基于网络药理学和分子对接技术

目的：通过网络药理学和分子对接方法探讨“乳病消片”治疗乳腺癌的作用机制。方法：通过中药系统药理数据库（TCMSP）筛选乳病消片成分及其靶点,通过GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库筛选乳腺癌潜在靶点。通过Cyktoscape 3.8.0软件构建“化合物-疾病靶点”网络图。通过STRING数据库获取蛋白相互作用数据,再将数据导入Cytoscape 3.8.0软件构建PPI网络,并用得分高的基因建立关键子网络。使用R软件对交集靶点进行GO功能、KEGG通路富集分析。借助Chem3D、Pymol、AutoDock等软件进行分子对接。结果：共筛选出485个药物活性成分,相关靶点2 288个,乳腺癌潜在靶点共1 967个,交集靶点143个。通过PPI分析,发现MDM2、TP53、CDKN1A、RB1、ESR、JUN、FOS和CCND1为核心靶点。GO富集分析与氧化应激相关,核心靶点主要富集在内分泌抵抗通路、脂质和动脉粥样硬化等信号通路。分子对接结果表明药物有效成分与核心靶点MAPK3有较强结合力。结论：研究发现,“乳病消片”可通过调控基因表达、细胞凋亡、...     

阿魏酸调控心肌肥厚的作用机制

目的:运用网络药理学与分子对接技术研究阿魏酸调控心肌肥厚的作用机制。方法:通过Gene Card、TCM、Open Targets、Swiss Target Prediction、STRING和David等数据库,筛选并构建阿魏酸调控心肌肥厚的相关靶点及蛋白互作网络PPI。将得到的共同靶点上传到David平台,进行GO(基因本体)功能富集和KEGG(京都基因百科全书)通路富集。运用Swiss Dock软件对主要靶点进行分子模拟对接,得到的结果用UCSF Chimera1.15进行分析。结果:阿魏酸作用于心肌肥厚的核心基因是STAT3、CASP3、MTOR、AR、MAPK1和ERBB2,与MAPK1、ERBB2和CASP3的亲和力最高;参与的调控生物过程包括细胞增殖调控、信号传导、调控RNA聚合酶Ⅲ启动子转录、调控Stat3蛋白酪氨酸磷酸化和磷脂酰肌醇介导的信号传导等,涉及信号通路包括缺氧诱导因子-1信号通路、Rap1信号通路、鞘脂信号通路和叉头状转录因子信号通路等。结论:阿魏酸可通过多个靶点、通路调控心肌肥厚,实际运用效果尚不清楚,仍需要深入研究。     

基于网络药理学探讨大青叶治疗病毒性呼吸道感染作用机制及物质基础

目的：采用网络药理学方法探索大青叶治疗呼吸道感染RTI的作用机制及物质基础生物碱。方法：通过TCMSP检索获得的大青叶成分及其作用靶点,通过GeneCards、OMIM、Drugbank数据库预测作用靶点;应用Hiplot平台对交集靶点进行基因本体GO功能富集分析与基因组百科全书KEGG富集分析;运用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白相互作用PPI网络和“成分-靶点-通路”网络;采用单因素以及正交试验考察大青叶生物碱提取和含量测定方法。结果：大青叶中的6种生物碱成分,通过作用于PTGS2、ESR1、HSP90AA1、AR、PPARG等靶点,调控IL-17信号通路、钙信号通路、Th17分化细胞、PI3K-Akt等信号通路,发挥抗病毒、抗炎、免疫调节作用,对呼吸道感染产生治疗作用;采用二氯甲烷提取大青叶中总生物碱;酸性染料比色法测定大青叶总生物碱含量,最优条件为：缓冲液pH=3.6、用量为6mL、指示剂用量为4mL、有机溶剂用量为6mL。结论：大青叶中生物碱类成分对RTI相关靶点有潜在作用,能够通过抗病毒、抗炎等改善RTI症状,为后续研究大青叶对RTI的作用机制提供依据。     

基于网络药理学方法挖掘中药治疗多囊卵巢综合征的研究进展

多囊卵巢综合征(polycystic ovarian syndrome, PCOS)是育龄期妇女常见的内分泌疾病,发病率呈上升趋势,但治疗率与控制率相对较低。近年来,利用网络药理学的方法揭示PCOS治疗靶点成为研究热点,通过对46篇相关文献的分析,从药物活性、作用靶点、生物过程和通路分析等方面阐述中药单药、药对、复方治疗PCOS的作用机制,并提出网络药理学在中药研究领域中存在的问题与展望。     

基于生物信息大数据研究牡丹皮对自身免疫病“异病同治”作用机制及Q-marker预测

目的 基于中医病机理论与系统药理学的方法探讨牡丹皮防治系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus, SLE)与类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis, RA)的“异病同治”功效网络和作用机制并对其Q-marker进行预测。方法 通过检索TCMSP、BATMAN、TCMID、ETCM、SymMap、中科院化学数据库等多个中药资源数据库结合中国知网文献挖掘建立牡丹皮化学成分库,利用ADME参数OB、DL值筛选活性成分。搜集TCMSP、BATMAN、TCMID数据库的活性成分靶点,STITCH、SIB、SEA数据库预测的活性成分靶点加以补充。Comparative toxicogenomics database(CTD)数据库收集SLE与RA相关靶点。根据韦恩图找出牡丹皮-SLE-RA共有靶点,构建蛋白互作网络,依据拓扑参数找出核心靶点。利用DAVID平台对共同交集靶点进行GO和KEGG分析,采用Cytoscape的插件ClueGO对共同核心靶点的GO-BP和KEGG分析结果进行可视化展示。基于“中药-成分-靶点-通路-疾病”网络分析预测Q-m...     

基于网络药理学及分子对接探讨骨碎补-补骨脂药对治疗骨转移癌痛的作用机制

目的 采用网络药理学及分子对接技术探讨骨碎补-补骨脂治疗骨转移癌痛的作用机制.方法 通过文献查找、TCMSP数据库及BATMAN-TCM数据库获取骨碎补-补骨脂的活性成分及其对应的靶点,通过GeneCards数据库获得骨转移癌痛相关的靶点,利用Venn在线软件获取"化合物-疾病"共同靶点,运用Cytoscape 3.7...     

基于网络药理学的乌梅抗结直肠癌机制研究

目的:基于网络药理学方法分析乌梅治疗结直肠癌的关键靶点以及作用机制.方法:通过TCMSP数据库筛选乌梅的有效成分、潜在靶点,运用GeneCards、DisGeNET数据库搜集结直肠癌的疾病靶点,借助Cytoscape3.7.2软件构建"药物成分-靶点"网络,使用STRING数据库绘制PPI网络,利用DAVID数据库对关...