不明原因发热患者肺泡灌洗液病毒群落解析

目的: 分析不明原因发热患者肺泡灌洗液中的病毒谱。方法: 将58例肺泡灌洗液样本随机分为5组分别构建5个文库，利用病毒宏基因组学技术进行病毒群落分析，并对获得的细环病毒及鼻病毒进行阳性样本筛选。结果： 肺泡灌洗液病毒群落组成中，指环病毒科占主体地位（19.4%），其次为圆环病毒科（11.0%），藻去氧核糖核酸病毒科（11.0%），人类内源性递转录病毒科（10.2%），痘病毒科（4.9%），逆转录病毒科（3.2%），帚状病毒科（2.3%），小RNA病毒科（0.6%）；并发现了4株序列较长的细环病毒，根据细环病毒开放阅读框1进行系统进化分析，显示其与已知的细环病毒在核酸水平上有一定的差异。通过对细环病毒及鼻病毒阳性样本的筛选，发现细环病毒阳性率为11.3%，鼻病毒阳性率为10.0%。结论： 应用病毒宏基因组学技术成功解析出不明原因发热患者肺泡灌洗液中的病毒群落组成，病毒群落中指环病毒科占比最高，其中细环病毒因发热导致的炎性环境以及患者免疫力低下而大量增殖。     

舟山市3例发热伴血小板减少综合征的病原学与遗传特征

目的 对舟山市3例疑似发热伴血小板减少综合征(SFTS)病例进行病原学鉴定、确诊,并分析其遗传特征.方法 选用巢式RT-PCR测定新布尼亚病毒核酸及L、M、S3个特异性基因,并对基因扩增产物进行测序,测序结果与GenBank上公布的序列进行比对确认.用DNAStar软件构建进化树与序列距离表.用间接免疫荧光法测定患者恢复期和急性期血清新布尼亚病毒IgG抗体滴度.结果 3例SFTS患者急性期血清中均能检测到新布尼亚病毒的3个特异性基因片段,其中S基因核苷酸序列与舟山市同类基因核苷酸序列的同源性在94.4％～ 100.0％,患者恢复期血清病毒抗体滴度较急性期增高4倍以上.结论 经过病原学鉴定,3例临床疑似患者确诊为发热伴血小板减少综合征的新近感染病例.舟山市新布尼亚病毒的遗传特征比较稳定.     

2014－2017年广州市禽类市场外环境H7N9禽流感病毒监测与遗传进化分析

目的 对广州市禽类市场外环境H7N9禽流感病毒流行情况和基因进化特点进行监测分析,为人感染H7N9禽流感防控提供研究数据。 方法 采集2014 — 2017年广州市禽类市场外环境标本,采用实时荧光定量RT-PCR方法检测H7N9禽流感病毒并绘制血凝素（HA）基因遗传进化树,分析H7N9禽流感病毒流行特点和基因进化特点。 结果 2014 — 2017年累计检测外环境标本28 252份,检出H7N9阳性标本888份,阳性率为3.14%。 检出率2015年最低,2014年最高,分别为1.60%和3.89%。2 — 5月出现H7N9禽流感病毒流行高峰,4月检出率最高为13.00%。 测序分析结果显示,HA基因核苷酸同源性为88.6% ~ 100%,氨基酸同源性为92.0% ~ 100%。 裂解位点分析发现,2017年外环境开始出现高致病性H7N9病毒。 进化分析发现,HA基因呈现多进化分支特点。 结论 2014 — 2017年广州市禽类市场外环境H7N9禽流感病毒持续存在且病毒变异较快,呈现基因多样性。 2017年外环境已发现高致病性H7N9病毒,近年病毒HA基因归属于华南分支,呈现本土化,同时监测到来源于野鸟的另一独立分支的病毒存在,提示加强本地区野鸟H7N9禽流感病毒监测的必要性。      

应用人胚肺成纤维细胞MRC-5培养分离寨卡病毒研究

目的 应用人胚肺成纤维细胞MRC-5培养并分离鉴定寨卡病毒。 方法 收集寨卡病毒病确诊病例的精液样本并在MRC-5细胞中进行培养,观察致细胞病变效应（CPE）。 采用实时荧光PCR（real-time PCR）方法鉴定培养,同时对培养物进行序列测定和比对分析。 结果 病例精液样本经MRC-5细胞盲传3代,未观察到明显的特异性致CPE,MRC-5细胞3代培养物寨卡病毒经real-time PCR检测结果呈阳性。 毒株命名为Henan/001/2016,GenBank编号为MF593625,属于亚洲基因簇系。Henan/001/2016与Natal RGN株的亲缘关系最为接近,在E基因区段的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为99.7%和100%。 结论 MRC-5细胞适用于寨卡病毒的分离、培养和鉴定。      

纤恙螨属线粒体基因组研究进展

恙螨引起的恙虫病是世界上危害严重的一类人兽共患寄生虫病。本文综述现有纤恙螨属线粒体基因组信息,发现以下几个特点:纤恙螨属线粒体基因组与节肢动物以及前气门目其他物种的线粒体基因组排列发生了较大变化;红纤恙螨和地里纤恙螨有2个非编码区,苍白纤恙螨有4个非编码区;AT-偏斜为正值,但cox1第3位密码子的AT-偏斜和GC-偏斜与后生动物典型的链偏向相反;tRNA和rRNA基因的平均大小比部分寄螨总目物种要短,导致大部分tRNA基因具有非典型的二级结构。对纤恙螨属线粒体基因组的结构特征和变异情况进行比较,弥补了蜱螨亚纲线粒体基因组传统认识的不足和局限。     

一起聚集性发热伴血小板减少综合征病原S基因分子进化分析

目的 对2020年4月南京鼓楼医院送检的一起疑似聚集性发热伴血小板减少综合征(SFTS)开展病原检测,对其S基因进行测序,分析基因分型和系统发育特征。方法 采用荧光定量PCR法对6例疑似患者血清标本进行新型布尼亚病毒(SFTSV)核酸定性检测, RT-PCR扩增SFTSV S基因片段并测序。分析核苷酸同源性,构建系统进化树。结果 6例血清样本中,SFTSV核酸阳性5例。5例核苷酸高度同源,其中4例S片段基因核苷酸序列同源性100%,1例与其他4例间同源性为99.7%;最大相似株为江苏2014年分离株JS2014-06、2015年分离株JS2015-26,同源性100%。5例均聚集在C2亚型分支上。结论 聚集性疫情SFTSV基因型为C2型,与近年来国内分离株亲缘关系近。需加强监测和宣教,关注病毒的进化与变异。     

传统中餐的营养缺陷

<正>中国的饮食文化有着悠久的历史,我国是烹饪王国,在世界上享有崇高的声誉,中国餐饮业遍布全球,深受各国人民的欢迎。民主革命的先驱者孙中山先生曾说:"我中国近代文明进化,事事皆落人之后,唯饮食一道之进步,至今尚为文明各国所不及。"中国的饮食文化为我华夏民族的繁荣昌盛作出了不可磨灭的贡献。这一点,不仅我们引以自豪,也令各国友人羡慕不已。中国人饮食的目的,除了果腹充饥,同时还要满足对美味的渴望,带来身心的愉悦。中国人吃的是口味,"味"是中国饮食的魅力所在。中国人的饮食强调感性和艺术性,追求饮食的口味感觉,而不注意食物的营养成分,多从"色、香、味、形"等方面来评价饮食的好坏优劣,追求的是     

湖北省部分地区2010年蚊传虫媒病毒调查

目的继续调查湖北省蚊媒和病毒种类及其分布状况。方法 2010年夏季在湖北省恩施州、神农架林区、江陵县和随州市采集蚊虫标本,用组织培养法分离病毒,用血清学和分子生物学方法对阳性病毒分离物进行鉴定,利用生物信息学软件对新分离病毒进行序列同源性和系统进化分析。结果采集到3属4种12 845只蚊虫标本,共分离到38株阳性分离物,经血清学和分子生物学鉴定,32株阳性分离物为流行性乙型脑炎病毒(JEV),5株阳性分离物为盖塔病毒,1株为JEV和盖塔病毒感染混合株。JEV E基因序列进化分析显示新分离JEV均为基因Ⅰ型JEV。盖塔病毒NS2基因序列进化分析显示新分离病毒与中国河北省和韩国毒株同源性最高,与俄罗斯分离株进化关系较远。结论首次在湖北省分离到盖塔病毒,并再次在湖北省分离到基因Ⅰ型JEV。     

内蒙古小型兽类巴尔通体感染情况调查

目的 了解我国内蒙古部分地区小型兽类的巴尔通体(Bartonella)感染情况,为该地区人群巴尔通体感染的预防控制提供科学依据.方法 2012、2013年用夹夜法在内蒙古不同地区捕获小型兽类,无菌操作取鼠肝和脾,用聚合酶链反应(PCR)检测巴尔通体,对阳性产物测序,将所测核酸序列提交到GenBank,做相似性比较及序列分析.同时分别用肝和脾各30份样品分离培养巴尔通体,疑似菌株提取DNA,对gltA基因测序并根据序列进行系统发育分析,确定巴尔通体属种,并分析不同脏器、不同鼠种的阳性率.结果 2012年在内蒙古锡林郭勒盟二连浩特市共捕鼠8种117只,各鼠种均培养出巴尔通体菌,培养阳性率为56.41％(66/117),肝脏DNA直接PCR阳性率为57.26％(67/117),二者差异无统计学意义(P=0.945).30份肝样品培养阳性21份,30份脾样品培养阳性13份,二者差异亦无统计学意义(P=0.331).2013年捕获并培养分离小型兽类13种86只,有8种检出巴尔通体,培养阳性率为38.37％(33/86),其中达乌尔黄鼠最高(75.00％),其次为五趾跳鼠(71.43％)和布氏田鼠(64.29％).经分析达乌尔黄鼠、五趾跳鼠与布氏田鼠的巴尔通体阳性率差异无统计学意义(P=0.883).序列分析表明内蒙古部分地区小型兽类中共检出4个巴尔通体种群:B.jaculi、B.grahamii、B.washoensis和B.vinsonii,有明显的宿主特异性.结论 巴尔通体在内蒙古部分地区小型兽类中广泛存在,存在对人群致病的风险,序列分析显示出巴尔通体基因型别的多样性,为内蒙古及我国北方其他地区巴尔通体的研究奠定了基础.     

青海省多房棘球绦虫分子种系发生研究

目的　对青海省多房棘球绦虫分离株Cox1、Nad1基因进行扩增和测序，并构建系统进化树及分子钟，为推测其进化关系及起源提供参考依据。方法　收集2017年青海省人民医院收治的22份肝多房棘球蚴病患者术后标本，对多房棘球蚴线粒体DNA Cox1、Nad1基因进行PCR扩增和测序，并与GenBank数据库中的棘球属绦虫Cox1基因和Nad1基因序列进行比对，观察种内变异情况并构建进化树和分子钟。结果　所有多房棘球绦虫标本与GenBank数据库中检索的多房棘球绦虫亚洲株Cox1、Nad1基因序列同源性均达99%以上，共获得6种不同基因型，其中有2个分离株在GenBank数据库中未找到同源性100%的基因序列。系统进化树显示，收集的多房棘球绦虫标本与多房棘球绦虫亚洲株聚类效果明显；分子钟推测青海地区多房棘球绦虫起源于9.4万年前。结论　本研究发现青海省多房棘球绦虫存在6种不同基因型，其中首次发现2种基因型。青海地区多房棘球绦虫优势株为亚洲株，起源时间约在9.4万年前。