150例先心病胎儿的染色体及基因测序结果分析

目的 探讨遗传因素在胎儿先心病中的作用,为临床遗传咨询提供参考。方法 150例超声诊断为先心病的胎儿,将其分为3组：A组单纯性先心病、B组复杂性先心病、C组先心病合并其他超声异常。135例穿刺行染色体核型、染色体微阵列分析,部分病例行全外显子测序;15例超声诊断后孕妇要求引产,取引产胎儿组织行全外显子测序。回顾性分析以上检测结果,通过Pearson卡方检验比较各组间阳性检出率。结果 150例先心病胎儿中,检出8例染色体非整倍体,11例致病性变异,4例临床意义不明的变异,阳性检出率为15.3%(23/150)。其中A和B组间、A和C组间阳性检出率差异有统计学意义,而B和C组差异无统计学意义。结论 先心病胎儿染色体异常风险增加,建议行介入性产前诊断,若为复杂性先心病或合并其他超声异常,提示与遗传相关性更大,除胎儿染色体外,可提供全外显子测序。     

1例POLA1基因半合变异致X-连锁网状色素异常症的基因诊断

目的 对临床症状疑似1例X-连锁网状色素异常症（XLRPD）的患儿进行基因诊断。方法 利用高通量测序技术对患者及其父母进行全外显子组测序,筛选候选致病位点,对其家系进行Sanger测序验证。结果 全外显子测序和Sanger测序验证发现家系中患儿X染色体携带POLA1基因半合变异c.1375-354A>G,患儿母亲携带该变异,但无任何临床症状。患儿出现全身皮肤弥漫性黝黑,反复呼吸道感染,前额和双鬓毛发向后上倾斜,生长发育阻滞。结论 结合患儿的临床症状和体征,POLA1基因半合变异c.1375-354 A>G很可能该病的致病基因,符合X连锁遗传规律。为该病的遗传发病机制研究提供了临床资料。     

用芯片电泳快速检测人p53基因外显子8上的突变点

目的：建立简单快速的分析方法检测基因突变。方法：利用修饰引物进行特异性单碱基延伸,采用Cy5荧光染色标记的ddNTP,并通过芯片电泳来检测。结果：实测了合成人p53基因外显子8上突变点的3种可能形态(野生型,突变型和杂合型),并测定了一系列不同比例突变率的混合样本,最低至5％突变率。所有样本分别于芯片电泳中在100s之内被检测出来。结论：该方法操作简单易行,可用于快速检测已知的基因突变。     

远端型遗传性运动神经元病家系全基因组外显子测序研究

【目的】报告1例远端型遗传性运动神经元病(d HMN)家系,对家系进行分子遗传学研究,探寻致病基因,并探讨全基因组外显子测序在临床诊断和研究中的应用价值。【方法】对该家系进行临床及电生理检查,在排除与临床诊断相关已知基因的突变后,先对该家系的先证者和另一旁支的患者进行全基因组外显子测序、生物信息学分析,然后对采集到血样的22名家系成员,包括10例患者进行突变筛查及突变与疾病共分离分析。【结果】全基因组外显子测序、突变筛查及突变与疾病共分离分析结果显示该家系先证者和患者BSCL2基因3号外显子糖基化位点发生p.Ser90Leu突变,为国内首次报导。【结论】d HMN是一类临床和遗传异质性都很强的遗传病,外显子测序是诊断d HMN的有效方法。在研究具有高度遗传异质性的遗传病时,运用外显子组测序技术发现致病性突变比常规的PCR加产物测序更为简便、快速。     

全外显子测序产前诊断Walker-Warburg综合征

目的利用全外显子测序技术对患有脑积水和先天性心脏病的胎儿进行产前诊断,并指导再次妊娠。方法提取胎儿羊水细胞DNA以及父母外周血DNA,采用外显子测序技术进行检测,经过建库、杂交捕获、测序等过程,将得到的数据经过比对、软件分析、查找数据库及文献等,根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG,2015)原则寻找胎儿的致病基因,并利用Sanger测序对致病位点进行验证。结果全外显子测序技术检测结果发现患儿POMT1基因发生复合杂合突变,分别遗传自母亲的经典剪切位点突变c.605+1GA(IVS7)和遗传自父亲的移码突变c.1367_c.1368(exon 15)ins GA,p.L456Lfs*80;Sanger测序验证结果与外显子捕获测序结果一致。胎儿为Walker-Warburg综合征患者。胎儿父母最终决定终止妊娠。结论利用全外显子测序技术可快速可靠地诊断Walker-Warburg综合征患者,在临床决策及产前咨询中发挥重要作用。     

综合测序法检测到复发性孤立性纤维性肿瘤中NAB2-STAT6基因的融合

作者对1例44岁复发性孤立性纤维性肿瘤(SFTs)/血管外皮细胞瘤的女性患者进行包括全部外显子组和转录组在内的基因测序,检测到转录抑制因子NAB2和转录激活因子STAT6的融合。另外在对其它27个SFTs的转录组测序中发现所有肿瘤均出现NAB2-STAT6基因融合现象。通过RT-PCR和测序技术检测发现51个SFTs中均检测到NAB2-STAT6基因的融合,提示NAB2-STAT6基因融合在SFTs中有较高的发生频率。同时证实了SFTs中存在NAB2-STAT6     

胃肠间质瘤c-kit基因表达和外显子11突变与临床病理关系的研究

[摘要]　目的　探讨胃肠间质瘤c-kit基因表达和外显子11突变与临床病理的关系。　方法　选取病理资料完整、诊断明确的胃肠间质瘤（gastrointestinal stromal tumor, GIST）标本60例（其中15例标本同时收集新鲜标本组织）,用免疫组织化学（EnVision二步法）及Western-blot检测KIT蛋白表达;半定量RT-PCR方法检测c-kit基因的表达;通过聚合酶链式反应-单链构象多态（PCR-SSCP）方法筛选c-kit基因外显子11突变病例。　结果　免疫组织化学检测结果：与高分化GIST相比,KIT蛋白在低分化GIST中表达强度较高（P<0.05）。Western-blot结果发现,与低侵袭危险度GIST比,KIT成熟蛋白在中高侵袭危险程度GIST中表达量较高（P<0.05）。c-kit基因外显子11突变率为52%（31/60）,发生在女性、肿瘤最大径>5 cm、核分裂数>5/50 HPF及中高度侵袭危险性的GIST外显子11突变率较高（P<0.05）。在外显子11突变的GIST中成熟型KIT蛋白表达量较高（P<0.05）。　结论　KIT成熟蛋白可能在GIST发生、发展中起重要作用,并且与GIST高度侵袭危险性的生物学行为相关;c-kit基因外显子11突变可能是GIST恶性生物学行为的指标。     

Whole exome sequencing analysis of 6 children with dilated cardiomyopathy北大核心CSCD

Objective To explore the mutational loci associated with the occurrence of dilated cardiomyopathy (DCM). Methods Six children with DCM and 3 healthy children were recruited through the " Children DCM Susceptibility Gene Research Project" for a prospective study from December 2019 to June 2021. Six patients were aged from 4 months to 14 years, including 5 girls and 1 boy. Three healthy children were aged between 3-13 years, including 2 girls and 1 boy. Whole exome sequencing was performed on the research subjects, and the pathogenic genes were identified by bioinformatics methods. At the same time, the venous blood of the first - degree relatives of the corresponding children was collected, and the region with gene mutations was subjected to next - generation sequencing. Results A total of 4 mutational loci that might be related to DCM were identified. Case 1 was found to have a c. 2011-3C > G mutation in the jounctophiilin - 2 (JPH2) gene. The c. 2011-3 C > G mutation was homozygous (GG) in the child, but heterozygous (CG) in the parents. This child also had a c. G49415A mutation in the titin (TTN) gene. This c. G49415A mutation was homozygous (AA) in the child, but heterozygous (GA) in the parents. Case 4 was found to have a c. G23033A mutation in the TTN gene. The c. G23033A mutation was heterozygous (GA) in both the subject and the father, but a wild type (GG) in the mother. Case 5 was found to have a c. 16975_16978del mutation in the TTN gene. The c. 16975_16978del mutation was heterozygous (TCTTC/T) in the child and the father, but a wild type (TCTTC/TCTTC) in the mother. Conclusions A total of 4 pathogenic gene loci related to the pathogenesis of DCM are identified in this study. The finding enriches the DCM disease gene spectrum and provides targets for the implementation of precision medicine. © 2022 ＣｈｉｎＪＡｐｐｌＣｌｉｎＰｅｄｉａｔ. All rights reserved.     

16p11.2微缺失相关儿童癫痫的临床表型与遗传学特征分析北大核心CSCD

目的探究16p11.2微缺失相关儿童癫痫的临床表型与遗传学特征。方法回顾性收集200例应用全外显子测序技术进行癫痫遗传学分析的癫痫患儿,其中9例癫痫患儿为16p11.2微缺失,分析9例16p11.2微缺失患儿的临床表型及遗传学特征。结果16p11.2微缺失检出率为4.5%(9/200)。9例患儿为3~10月龄的婴儿;癫痫发作形式为局灶运动性发作伴意识障碍,部分进展为全身强直-阵挛发作;发作间期脑电图为局灶或多灶性痫样放电,对抗癫痫药物反应良好。9例患儿16p11.2缺失片段大小在398~906 kb之间,缺失基因数为23~33个,且均为致病性变异,其中2例为母源性来源,1例为父源性来源,余均为新发变异。结论16p11.2微缺失在癫痫患儿中有一定的检出率,16p11.2微缺失多为新发变异,且为基因大片段缺失;16p11.2微缺失相关儿童癫痫多在出生1年内起病且为药物反应性癫痫。     

低密度脂蛋白受体基因AvaⅡ多态性与心肌梗死的关系研究

血脂代谢异常是造成动脉粥样硬化的一个主要原因 ,因此冠状动脉粥样硬化所致心肌梗死 (AMI)与血脂代谢异常的关系密切。低密度脂蛋白受体 (LDL R)在血浆脂蛋白代谢平衡中发挥重要作用 ,编码LDL R的基因定位于19p13 1 p13 3,基因组长约 4 5kb ,由 18个外显子和 17个内显子组成。有报道LDL R基因AvaⅡ与血浆胆固醇含量有关。本研究应用PCR技术 ,旨在探讨LDL R基因AvaⅡ多态性与AMI的关系。一、对象与方法1.对象 :AMI组 :辽宁籍汉族AMI患者 81例 ,男 5 7例 ,女 2 4例 ,平均年龄 (6 1 37± 8 4 9)岁。所有患者均符合 1979年WHO…