常染色体显性遗传性听神经病家系全外显子组测序分析

目的：在多年围绕1个常染色体显性遗传性非综合征型听神经病家系开展系统分子遗传学研究的基础上,进一步探讨该家系耳聋的致病机制,以期发现新的听神经病致病基因和突变位点。方法：对3例耳聋患者和1例配偶进行全外显子组测序,初步筛选出与家系耳聋相关的候选致病基因。采用PCR-Sanger测序法,检测上述候选基因变异是否与家系表型共分离。最后,以50例与研究家系无关的听力正常人为对照,检测候选致病突变在正常群体中的突变频率和SNPs遗传多态性。结果：全外显子测序分析得到41个候选致病基因突变;用PCR-Sanger测序法对核心家系的9名成员和2名家系外听力正常人进行验证,仅发现1个基因突变（ALOX15B 7942797 C>T）与家系耳聋表型共分离。选取50例家系外正常对照的DNA样本对ALOX15B基因进行PCR扩增和序列分析,结果显示有2例听力正常人也检测到该基因的同一变异,提示该变异为SNPs遗传多态性。结论：对核心家系成员的全外显子组测序分析和Sanger测序法验证未发现有意义的突变位点,排除了该家系耳聋由基因编码区突变及Indels致病的可能性。     

智力障碍小家系中致病基因的研究

目的 研究一个智力发育障碍家系中的致病基因突变.方法 染色体核型G显带方法分析先证者染色体核型,用全基因组外显子测序的方法探究致病基因,并在先证者家系中用Sanger测序法进行验证.结果 G显带核型分析未显示先证者染色体核型的数目和结构异常.全基因组外显子测序的方法共从先证者外显子基因中鉴别出1 455个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)和187个indels,结合家系信息筛选出X染色体上ARHGAP4基因突变与智力障碍表型相关,Sanger测序法验证结果一致,符合孟德尔家系遗传.结论 X染色体上ARHGAP4的C2822T突变位点可能与家系中的智力障碍疾病表型相关.     

SIX3基因变异导致前脑无裂畸形患儿的遗传学分析

目的:对1例前脑无裂畸形患儿的 SIX3基因进行变异分析,明确其可能的致病原因,为临床诊断提供依据。 方法:提取DNA样本,应用高通量测序技术对患儿进行基因变异分析,并用Sanger测序进行家系验证。结果:MRI提示叶状前脑无裂畸形伴胼胝体部分缺如。基因检测结果显示患儿 SIX3存在c...     

急性髓系白血病全外显子组测序基因突变特点及其与疗效的关系

目的探讨急性髓系白血病(AML)患者全外显子组测序(WES)基因突变特点及其与疗效的关系。方法回顾性分析2014年12月至2019年9月安徽医科大学第二附属医院收治的30例AML患者资料, 总结WES结果及疾病类型、疾病分型、遗传学预后分层、疗效等情况, 比较不同临床特征和遗传学预后分层患者突变类型及突变频率。结果 30例AML患者中26例(86.7%)至少发生1个基因突变, 其中突变频率>10.0%的基因依次为NRAS、RUNX1、TET2、CEBPA、IDH2、ASXL1, 这些突变基因的功能涉及信号通路、转录因子、表观遗传、RNA剪接及其他生物学功能, 19例(63.3%)在突变方式上呈现为多种组合的联合突变。在年龄、性别、疾病类型、疾病分型及遗传学预后分层各组中突变率差异均无统计学意义(均P>0.05)。融合基因阳性8例中突变7例, 平均突变频率175.0%(14/8);融合基因阴性22例中突变19例, 平均突变频率213.6%(47/22);两组间突变频率差异有统计学意义(P=0.001)。持续缓解14例中突变11例, 平均突变频率157.1%(22/14);复发...     

Rett综合征1例

<正>1临床资料患儿,女,21个月,主因诊断孤独症3个月,运动发育停滞伴倒退1个月于2021年1月14日就诊邯郸市儿童医院。3个月前患儿因唤名无反应伴清醒期频繁双眼上翻就诊于河北省儿童医院,初步诊断为孤独症,自行回当地县医院进行康复训练治疗,双眼上翻症状明显减少。1个月前患儿双手功能退化,不能定向抓握伴震颤,精细运动不能,伴拍手、掐指、绞手等重复刻板动作出现,易激惹,尖叫样抗拒,步态逐渐不稳,未予特殊治疗。     

应用全外显子组测序发现1例肺型BHD综合征家系FLCN基因c.1579＿1580insA位点变异

目的 应用全外显子组测序对1例遗传性肺囊肿家系进行遗传基因研究。方法 遴选出2018年8月—2021年8月我科临床上发现的具有家族聚集现象的肺囊肿家系,对家系成员进行全外显子组测序确定候选基因,并通过生物信息分析、遗传变异解读及Sanger测序验证分析该基因的致病性。结果 共纳入1例肺囊肿家系,在家系先证者检出FLCN基因c.1579＿1580insA位点变异,对其阳性家系成员采用Sanger测序验证,同样检出相同基因变异,经生物信息学分析及ACMG指南致病性评级显示检出变异可分类为致病性的基因变异。结论 该家系肺囊肿的病因为FLCN基因c.1579＿1580insA位点变异;应用全外显子组测序能够快速发现罕见遗传疾病的致病基因,建议临床上若出现不明原因肺囊肿,应进行全外显子组测序检测以明确是否存在遗传因素,从而进一步辅助临床诊断,研究为后期肺囊肿的临床诊疗指南的制定提供了借鉴内容。     

瘢痕疙瘩Fas基因(外显子6～9)突变的检测

瘢痕疙瘩是损伤愈合过程的结果 ,它们以超过原损伤范围的大量瘢痕组织形成为特征 ,而导致这种过度增殖的原因至今未明。近年来其它领域的研究证明 :Ｆａｓ系统对控制细胞增生与凋亡起重要作用 ,Ｆａｓ基因的体细胞突变与白血病、多发性骨髓瘤等疾病的发生、发展有着密切的关系。瘢痕疙瘩属良性肿瘤 ,是否也存在Ｆａｓ基因突变国内外尚未见报道。我们先前的实验研究提示了这种突变存在的可能性。本研究目的是检测瘢痕疙瘩成纤维细胞Ｆａｓ基因外显子 69是否存在突变及其突变位点。方法 :取 1 5例瘢痕疙瘩成纤维细胞进行ＰＣＲ ＳＳＣＰ检测 ,…     

上皮性卵巢肿瘤中抑癌基因P53的表达及第8外显子突变的检测

目的：探索抑癌基因Ｐ５３基因的表达水平与卵巢肿瘤的临床和生物不行为之间是否存在一定的关系。方法：应用免疫组化ＳＰ法检测Ｐ５３在７１例乳巢上皮性肿瘤中的表达情况,并应用显微切割获得ＤＮＡ和聚全酶链式反应（ＰＣＲ）－单链构象多态性分析（ＳＳＣＰ）检测Ｐ５３第８外显子（ｅｘｏｎ８）突变的情况。结果：卵巢癌中Ｐ５３蛋白阳性率为５１．６％,正常及交界性肿瘤均为阴性,差异有极显著性意义（Ｐ〈０．００１）。Ｐ５     

全外显子组测序技术检出Kallmann syndrome患者KAL1基因新突变

目的 分析Kallmann syndrome家系患者的分子遗传机制.方法 利用全外显子组测序技术对先证者进行测序分析,按照ACMG解读规则筛选致病性突变,Sanger测序对所有家系成员验证突变结果.结果 捕获且比对到目标区的碱基量为3418.98Mb,平均测序深度为77.66X,覆盖度为99.23％,共检出5056个变异,3174为罕见变异（RSV）,KAL1基因c.1735_1736insT突变为疑似致病性突变,且满足家系共分离.结论 KAL1基因c.1735 1736insT框移突变为新的疑似致病性突变.     

GNB1基因突变致神经发育障碍患儿的临床及基因突变分析

目的：应用全外显子测序技术（whole exome sequencing,WES）对患有语言运动发育迟缓及严重智力障碍的患儿及其父母进行分析,探讨基因水平的遗传学病因并明确临床诊断,进一步指导妊娠。方法：提取患儿及其父母外周血DNA,采用外显子捕获结合高通量测序技术进行检测。根据美国医学遗传学与基因组学学会标准对患儿及父母检测出的变异进行致病性判定,结合患儿表型寻找致病基因及位点。利用Sanger测序法对致病位点进行验证。结果：患儿GNB1基因第7号外显子c.346 G>A（p.G116S）位点杂合错义突变为致病位点,患儿父母该位点均为野生型,此变异为患儿的新发突变。Sanger测序验证结果与外显子捕获测序结果一致。患儿为常染色体显性智力低下42型（autosomal dominant mental retardation?42,MRD42）患者。结论：应用全外显子测序技术对语言运动发育迟缓伴严重智力低下的患儿进行诊断,可明确患儿的致病原因,有助于家系的遗传咨询并为再生育提供指导。