肠道菌群对男性生殖与性健康的因果关系

目的:应用两样本MR方法挖掘211种肠道菌群对男性生殖与性健康的因果关系。方法:采用MiBioGen联盟发布的全基因组关联研究(GWAS)相关遗传变异数据作为肠道菌群的工具变量(IVs),芬兰生物样本库GWAS相关遗传变异数据分别作为男性不育症、畸形精子症、性功能障碍、勃起功能障碍、睾丸功能障碍的IVs。使用逆方差加权法作为MR分析方法,根据效应指标优势比和95%置信区间评估结果,并进行数据敏感性分析。结果:分别发现6种与男性不育症相关、12种与畸形精子症相关、5种与性功能障碍相关、4种与勃起功能障碍、4种与睾丸功能障碍有关的肠道菌群,且数据敏感性分析无异常,因果方向均正确。结论:肠道菌群与男性生殖与性健康密切相关。     

两种自动化全基因血液样本DNA提取效果的比较

血液中DNA的提取是遗传性疾病、胎儿产前无创伤诊断、肿瘤和传染性疾病等临床早期确诊的基础技术和重要手段。外周血因取材方便,是临床上最常见的DNA基因组提取样本。目前,对大量临床血液样本DNA的提取方法多局限于酚一氯仿有机抽提法、盐析法、滤膜离心柱法等,但此类方法只能用于人工提取,不适合高通量样本的DNA提取,且大多存在耗时长、费用高而且操作繁琐等问题。     

烧伤后大鼠骨骼肌组织泛素及泛素化蛋白表达的变化研究

为研究烧伤大鼠骼肌组织泛素（ubiquitin)及泛素化蛋白表达的变化规律，探讨烧伤后骨骼肌蛋白降解的分子机制，采用大鼠30％Ⅲ度烫伤模型，分为伤后2、6、12和24h组，每组设正常对照组，于伤后不同时间点分别测定大鼠骨骼肌孵育液中伸趾长肌蛋白降解率以及伸趾长肌组织中泛素及泛素化蛋白的表达变化。结果发现，大鼠烧伤后伸趾长肌蛋白降解率增强，尤其是肌纤维蛋白降解增强明显（P＜0．01），伤后12h增加185％，24h增加153％；伸趾长肌泛素及泛素化蛋白的表达在烧伤后各时相点均显著增加（P＜0.01)，尤以12h和24h为明显，表达增加的泛素化蛋白主要为高分子量蛋白。提示烧伤后大鼠骨骼肌蛋白高分解代谢与泛素及泛素化蛋白的高表达关系密切。     

X-盒结合蛋白1、血管内皮生长因子C在肝癌中的表达及意义

目的 检测X-盒结合蛋白1(XBP1),血管内皮生长因子C(VEGF-C)在肝癌组织中的表达,探讨在肝癌发生发展过程中存在未折叠蛋白反应(UPR)的激活.方法 采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法检测术中取的新鲜42例肝癌标本、15例同个体癌旁1.0cm肝组织和15例正常肝组织中XBP1 、VEGF-C的mRNA表达,应用Western blot法检测57例肝癌组织和正常肝组织标本中XBP1、VEGF-C在蛋白水平的表达.结果 肝癌组织、癌旁肝组织、正常肝组织中XBP1 mRNA相对表达量分别为0.4396±0.0241、0.4152±0.0252、0.4095±0.0149,XBP1 mRNA在3组之间的表达呈下降趋势(P＜0.05);肝癌组织、癌旁肝组织、正常肝组织中VEGF-C mRNA相对表达量分别为0.4447±0.0335、0.4195 ±0.0334、0.4019±0.0259,VEGF-C mRNA在3组之间的表达呈下降趋势(P＜0.05). 在肝癌组织和正常肝组织中均有两种蛋白的表达,但肝癌组织中的表达明显高于正常肝组织.结论 肝癌组织中XBP1、VEGF-C mRNA和蛋白的表达一致,均为高表达.     

NDRG1基因在前列腺癌中的表达及其与肿瘤分化和侵袭的关系

目的:分析NDRG1基因在人类前列腺癌组织中的表达情况。方法:收集65例患者的前列腺癌组织及12例正常前列腺组织,提取总RNA,应用实时定量PCR检测NDRG1mRNA的表达水平。结果:统计学分析显示,65例前列腺癌组织中的NDRG1mRNA表达量低于正常前列腺组织(P<0.05),随着前列腺癌分级的升高和分化程度的降低,NDRG1mRNA的表达量呈下降趋势(P<0.05)。结论:NDRG1在前列腺癌组织中呈低表达,而且其表达与前列腺癌的分级和分化密切相关,提示其可能对前列腺癌的发生或发展有重要的作用,这不仅为研究前列腺癌的发病机制提供进一步的线索,而且对前列腺癌的诊断治疗具有重要意义。     

过氧化物酶Ⅰ在骨关节炎软骨组织中的表达与分布及意义

目的观察过氧化物酶Ⅰ（PrxⅠ）在正常和骨关节炎（OA）膝关节软骨组织中的表达和分布特点,探讨PrxⅠ与活性氧歧化物和凋亡等在OA软骨表层聚集现象之间的关联。方法分别从正常膝关节提取正常软骨（NC,n=21）和接受膝关节表面置换术的OA患者提取OA软骨（OA,n=21）,应用Westernblot技术检测PrxⅠ在正常软骨细胞和OA软骨细胞中表达水平的总体差异,并用免疫组织化学技术观察PrxⅠ蛋白在正常与OA软骨表/中/深各层组织表达和分布的特点。结果 Western blot证实PrxⅠ在OA软骨组织中的表达水平较正常软骨组织显著提高2.89倍（t=18.34,P〈0.01）。免疫组织化学显示PrxⅠ在正常软骨组织的表层、中层和深层呈现较均一的表达,但是,在OA软骨组织中,PrxⅠ的表达水平存在显著层间差异。PrxⅠ在软骨组织深层表达水平显著升高,但在浅层细胞中,PrxI的表达水平反而显著减低甚至缺如。结论虽然总体表达水平升高,但PrxⅠ在OA软骨组织表层的表达缺如,可能与OA软骨组织表层活性氧歧化物蓄积和细胞凋亡聚集现象相关。     

酒精性肝炎自噬关键基因的筛选及生物信息学分析

目的 筛选酒精性肝炎（AH）的自噬关键基因,探讨AH潜在的生物标志物和治疗靶点。 方法  采用基因表达综合数据库（GEO）中的2个AH基因芯片和从MSigDB、GeneCards数据库中获得的自噬相关数据集,通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）获取关键基因。对筛选的关键基因进行基因本体（GO）、京都基因和基因组百科全书（KEGG）功能富集分析,蛋白质相互作用（PPI）分析,免疫浸润分析,构建信使RNA（mRNA）-微小RNA（miRNA）网络,进行酒精性肝病不同分期的自噬相关关键基因的表达差异分析,并进一步通过实时荧光定量逆转录聚合酶链反应（RT-qPCR）在AH患者和小鼠肝脏组织中验证。 结果  本研究筛选得到了11个与AH自噬相关的基因（EEF1A2、CFTR、SOX4、TREM2、CTHRC1、HSPB8、TUBB3、PRKAA2、RNASE1、MTCL1、HGF）,均为上调基因。在AH患者和小鼠肝脏组织中,SOX4、TREM2、HSPB8、PRKAA2在AH组中的相对表达量均高于对照组。 结论  SOX4、TREM2、HSPB8、PRKAA2可能是AH潜在的生物标志物和治疗靶点。     

可变剪切事件在胰腺癌中的发生及其临床意义

目的探索胰腺癌(PAAD)中存在的差异RNA剪接模式,分析可变剪切(AS)事件与胰腺癌临床预后的关系。方法自癌症基因组图谱(TCGA)中下载RNA-seq数据、临床数据资料,提取剪接因子(SF)表达量;采用TCGA SpliceSeq工具下载提取AS事件数据,评估7种可变剪切类型在胰腺癌病例中的发生情况;采用Kaplan-Meier分析及Cox回归分析评估AS事件风险值和生存时间之间的相关性,并探索PAAD的独立危险因素;采用Cytoscape构建基于生存相关的AS事件与SF的调控关系网络。结果PAAD中与生存相关的AS事件以外显子跳跃(ES)类型多见,外显子互斥(ME)类型较少;各亚型AS事件对生存影响不同,低风险组的预后较好,且风险值可作为PAAD独立预后因素(P<0.01,AUC=0.765)。剪接网络提示PAAD患者中剪接因子的表达与AS事件之间具有相关性。结论AS事件风险值可作为PAAD的独立预后因子,且SF对AS事件的调控呈多样性,SF可能会作为PAAD治疗的潜在靶点。     

CLEC12B在肝癌中的表达及其临床意义

目的:研究CLEC12B在肝癌组织中的表达,探索其在肝癌发生发展及预后中的作用。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)下载肝癌数据集,获得CLEC12B基因表达谱和临床资料。比较CLEC12B在肝癌和癌旁组织中的表达差异;分析CLEC12B在肝癌组织中的表达与临床病理学参数和疾病预后的相关性;利用基因富集化分析预测CLEC12B影响肝癌发生发展的机制。结果:与癌旁组织相比,CLEC12B在肝癌组织中呈低表达。CLEC12B表达状态是影响肝癌患者预后的独立因素,高表达患者总体生存期优于低表达患者。CLEC12B高表达富集到DNA修复,低表达则富集到炎症反应等基因集。结论:CLEC12B可能通过炎症及DNA修复等影响肝癌发生发展及预后。