siRNA设计研究进展及在线设计

研究基因功能的方法之一是减少或消除其在细胞中的表达.RNA干扰 (RNA interference, RNAi) 技术可以研究一个单独基因的作用, 其效应因子为小干扰RNA(small interfering RNAs, siRNA)分子[1].     

利用GeneHub软件多角度分析基因功能相关与表达相关的联系

我们研制的GeneHub软件可以用来评价基因功能分类体系中各个功能单元的表达相关性的显著性，从而筛选与实验条件相关的功能单元。采用不同的相似性测度与不同的数据集，使用GeneHub研究了分别按染色体定位、蛋白质细胞位置与互作、代谢通路、信号传导通路等五个方面分类的基因的表达相关性，结果显示按照这些不同的方面分类的基因显著共表达，并且这种共表达现象往往受相关实验条件影响。为基因表达谱分析中广泛采用的假设“功能相关的基因表达相关”提供了进一步的实验证据。     

CRISPR/Cas9技术在药用植物功能基因组研究中的应用和展望＊

基因编辑是对基因组实现定点修饰的一项技术，其中CRISPR/Cas9系统以其操作难度低、编辑效率高、编辑范围广、投入成本少等优势成为新一代基因编辑技术，并在植物基因组学的研究中得到了广泛的应用。本文介绍了CRISPR/Cas9系统及其相关技术的工作原理，论述了编辑效率的影响因素、编辑系统的转化方式以及编辑结果的分析方法；从药用植物基因功能鉴定和转录调控两个方向，着重综述了该技术在药用植物功能基因组研究中的应用情况，并对其面临的问题和应用前景进行了总结与展望。     

RNAi在神经退行性疾病发病机制及防治研究中的应用

RNA干扰（RNA interference，RNAi）技术能特异性降解mRNA，沉默靶基因，在转录后水平抑制基因的表达，从而可用来进行基因功能的分析和药物靶标的研究。RNAi技术日趋成熟，已被广泛应用于生命科学的各个领域。在神经科学上，尤其是在神经退行性疾病，如阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病、脊髓小脑性共济失调、肌萎缩性侧索硬化症、朊病毒病等的研究中取得了显著进展，RNAi的应用为神经退行性疾病发病机制的揭示和治疗另辟了蹊径。     

基因芯片在内耳基因功能与突变检测中的应用

基因芯片又称DNA芯片，寡核苷酸微阵列等，是在人类基因组计划实施过程中出现并发展起来的。它融合了多领域的各项技术，具有高通量、高集成、微型化和自动化的特点，能够高效平行地处理和应用日益庞大的基因组信息，被称为继单克隆抗体技术和PCR技术之后生命科学中的又一重大技术创新，在序列分析、新基因的发现、基因表达谱分析、[第一段]     

RNA干扰技术及其在妇科肿瘤领域的应用进展

RNA干扰技术（RNAi）现象最早在1998年由Fire。首次发现并命名,是通过导入特异序列的dsRNA引起基因沉默的方法。由于RNAi抑制基因表达具有特异性和高效性,同时伴随近年来合成dsRNA技术上的改进,RNAi已成为研究基因功能,肿瘤基因治疗,病毒感染基因治疗的新方法。     

反义DNA和RNA：治疗病毒感染的新策略（上）

基于核酸的基因沉默分子是长度在20个碱基左右的人工合成的单链或双链DNA或RNA。这些分子包括反义寡脱氧核苷酸（AODN）、核酶、脱氧核糖核酸酶和最近比较热门的小干扰RNA（siRNA）。这些基因沉默分子以序列特异性方式靶向细胞或病毒tuRNA，将其断裂和／或阻断其转录和翻译起始，因此成为基因功能分析和药物开发的强有力工具。截至目前为止已经有二十多项基因沉默技术在肿瘤、艾滋病、肝炎、心血管疾病、血液系统疾病的Ⅰ至Ⅲ期临床试验中得到验证。[第一段]     

基于脾虚证相关基因功能鉴定的小肠上皮细胞RNA干扰转染条件研究

[目的]探索影响大鼠小肠上皮细胞(IEC-6)RNA干扰效率的转染条件,为进一步以RNA干扰(RNAi)技术构建不同程度表达靶蛋白的细胞模型打下基础.[方法]以24孔培养板培养IEC-6细胞,利用阳离子脂质体转染FAM-siRNA片段进入IEC-6细胞,采用荧光显微镜和流式细胞仪检测FAM-siRNA和转染试剂Lipofectamine 2000不同剂量比例对转染效率的影响.[结果](1)采用荧光显微镜检测转染效率,以评分进行秩和检验,结果仅有转染试剂或仅有FAM-siRNA或两者均无的组别评分均为0,转染试剂加FAM-siRNA组别均有或强或弱的荧光表达.(2)采用流式细胞仪检测转染效率,以Lipofectamine 2000 1.0μL+FAM-siRNA 160 nmol/L组转染效率最高(平均76.3%),而空白对照组约为1%. [结论]FAM-siRNA 160 nmoL/L(20 μmoL/L、4.8μL,终体积为0.6 mL)+Lipofectamine 2000 1.0μL组合为IEC-6细胞RNA干扰时转染效率最高的转染条件.     

人脑胶质瘤基因表达谱芯片的构建和初步验证

目的：构建人脑胶质瘤特异的基因表达谱芯片,促进大规模胶质瘤表达谱的研究。方法：采用389条基因探针,优化基因芯片制作的各个条件：片基、点样液、点样大小、紫外交联、采集信号强度等。使用自制芯片检测20例胶质瘤标本的基因表达谱,并与以前报道的实验结果对比,验证芯片的特异性和灵敏度。结果：构建了针对人脑胶质瘤的基因表达谱芯片,并用于脑胶质瘤的基因表达谱分析,证实本产品可以有效地高通量检测相关基因的表达水平。结论：构建的胶质瘤芯片有望用于胶质瘤基因表达谱分析。     

外显子测序揭示小脑共济失调的致病基因TGM6

据Brain 2010年11月23日[2010,133(Pt12):3510-3518]报道,由深圳华大基因研究院、中南大学湘雅医院等单位合作研究发现,利用全外显子组测序技术发现小脑共济失调新的致病基因TGM6这是中国科学家应用外显子组测序技术进行单基因病研