日本血吸虫基因表达序列标签的获得和分析

为寻找日本血吸虫新基因并进行血吸虫基因功能研究,随机挑选日本血吸虫（中国大陆株）成虫cDNA库克隆,培养后提取噬菌体DNA作模板,进行PCR反应扩增,将扩增产物部分测序产生表达序列标签（EST）,并将EST输入GenBank和EMBL,运用分子生物学 软件比较其同源性, 推导其蛋白序列并进行分析,结果得到75个未曾登录的新基因,并对其中一些基因进行功能推测研究,认为表达序列材人是快速有效寻找基因的方法,生物信息学软件的应用提供了新的医学研究途径。     

安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达影响的初步研究

目的研究安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达的影响。方法分析抑郁症大鼠模型组和安佳欣胶囊组各8例样本的基因表达谱数据,筛选差异表达基因。利用基因功能分类体系Gene Ontology中的生物学过程子树和细胞组分子树,寻找和分析显著聚集差异表达基因的复合功能类,从分子水平和基因功能模块水平探索安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因表达谱的影响。结果筛选出330个差异表达基因,并进一步识别了8个差异表达基因功能模块,主要涉及糖代谢、蛋白转运、谷氨酰胺代谢、凋亡诱导和神经发生。通过文献证实进一步发现了差异功能模块中7个可能与抑郁症发病相关的基因(Pfkm、Gpx1、Stx1a、Ninj2、Plp、Evl、Nrn1)在两组动物中差异表达。结论安佳欣胶囊可能增加抑郁症模型大鼠的单胺递质合成和释放,改善神经保护和神经发生功能,这些改变可能与安佳欣胶囊的抗抑郁作用有关。     

Nogo-A与NgR研究的新进展

Nogo-A的活性部位可能有两个,位于两个疏水区域之间的Nogo-66和氨基末端到第一个疏水结构域这部分肽链,即amino-Nogo;NgR属糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白,具有多个富亮氨酸的重复结构。Nogn-A主要表达于中枢神经系统,位于在投射神经元和形成髓鞘的少突胶质细胞中,在胞膜,胞质和胞核中都存在。许多研究表明,Nogo-A和NgR在轴突生长的过程中就有表达;细胞核上免疫金标记的Nogo-A主要存在于染色体的核小体上,表明它可能与基因转录有关;Nogo-A的表达与一些髓鞘形成有关的因子如α-微管蛋白 髓鞘基础蛋白(MBP)的表达有密切联系,这也暗示Nogo-A可能与髓鞘形成有关。通过进一步研究阐明它的功能是有必要的。     

内毒素诱导急性肺损伤小鼠基因表达的综合分析

目的利用改良的基因表达综合分析(SAGE)技术监测内毒素诱发小鼠急性肺损伤的基因表达状况，探讨急性肺损伤的分子机制。方法气管内注射内毒素(25mg／kg)复制急性肺损伤模型。正常对照小鼠气管内注射等体积等渗盐水。内毒素注射24h后以氯胺酮深度麻醉后处死小鼠，整块取出肺脏用于SAGE研究。建立正常和急性肺损伤两个SAGE标记物文库。结果正常文库包括24670个SAGE标记物，代表12168个基因。急性肺损伤文库包括26378个SAGE标记物，代表13：397个基因。急性肺损伤组有11种基因升高10倍以上，107种基因升高5～10倍，2121种基因升高2—5倍。7种基因表达降低大于10倍，87种基因降低5～10倍，1571种基因降低2～5倍。结论证实了内毒素诱导的急性肺损伤发生机制中各种基因表达的变化，并发现了以往没有报道的基因。对这些基因功能的进一步研究有助于阐明急性肺损伤的发生机制，并为临床诊断提供有参考价值的血清标记物。     

DNA直接感染细胞核的新技术

德国生技公司Ａｍａｘａ发展出新的细胞感染套组 ,提供难以感染的细胞新的选择。这个新的技术之所以独特是因为它能直接将ＤＮＡ送入细胞核中 ,不需要藉助病毒 ,因此在感染后 2～ 4ｈ后就能对感染实验进行分析。例如 ,骨髓白血病细胞株Ｋ5 6 2在感染 4ｈ可以达到 70 %的效率。此技术让研究人员更容易比较身体的各个组织的基因功能 ,藉以完成许多研究工作。例如 ,功能基因组学 (分析未知基因的功能 )、确认先导药物的研发及最佳化、药物基因学———发展个人基因差异化的药物(可减少副作用 )、体外培养基因治疗和生物药物的制造。DNA直接感…     

非小细胞肺癌基于文献轮廓的疾病相关基因功能分析

目的:通过文献轮廓方法对非小细胞肺癌的基因功能及疾病联系进行有效性评估.方法:采用PubMed数据库腱索非小细胞肺癌的相关基因的文献集合,获取挖掘样本,对     

应用普通变异位点的主成分分析法探讨群体结构

背景:普通变异位点在群体分层和群体结构研究中有重要的作用。目的:应用普通变异位点数据采用主成分分析法探讨群体结构。方法:采用主成分分析法对普通变异位点单核苷酸多态数据提取第一和第二主成分,同时采用随机森林算法对7组不同人群进行分类。此外分别对与第一主成分和第二主成分相关联的基因,作KEGG pathway和Gene ontology上的富集分析,挖掘基因功能。结果与结论:结果发现结合主成分分析和随机森林分类算法使得群体分层的准确率高达99.6%。这说明群体间等位基因频率的差异可以用来识别群体结构。此外,还发现通过主成分提取的基因具有一定的功能聚集性。由此证实实验提供的方法可以用来指导分子生物学研究和探讨基因功能。