tRNA~(His/GUG)识别特性的分子力学模拟(英文)

本文选用经过实验验证的碱基序列 ,用简化的方式 ,构建了被水分子和镁离子修饰的核酸序列的分子模型 ,应用分子力学模拟方法对序列进行能量优化 ,对优化后序列的构象参数、成键状况和能量数据等进行了分析。对tRNAHHis GUG的识别特性作了初步的探索 ,得到了和实验结果相近的结论。此外 ,还从能力学的角度讨论了溶剂 -溶质 -溶剂相互作用形成的网状氢键网络对核酸结构稳定性的影响 ,探讨了非Crick_WatsonGU、UU配对的能力学特征并存在于被水分子和镁离子修饰的核酸序列中的GU、UU配对情况。     

氨基和亚氨基化合物量子化学参数与氢键酸度的相关性研究

应用 Gaussian98W程序分别在 B3 L YP/6-3 11G* *和 HF/6-3 11G* * ( I原子用 3 -2 1G* *基组 )水平优化了 67个氨基和亚氨基化合物的几何结构 ,计算了氨基或亚氨基氢和氮原子的净电荷 QH和 QN、前线分子轨道能级 EHOMO和 ELUMO、系统总能ET和偶极矩 D等量子化学参数。为阐明这些参数与实验氢键酸度∑ αH2 的关系 ,将所得 B3 LYP和 HF两个参数集对 ∑αH2 进行了主成分回归 ( PCR)和逐步回归 ( SWR)分析 ,结果表明 ,B3 L YP高精度参数集的回归模型其拟合优度和预测值均好于 HF的 ;PCR模型预测值与实验值吻合较好 ,而 SWR所建模型因存在多重共线性问题 ,预测值并不可靠。     

P(MAA-co-AM)纳米水凝胶的制备与表征

利用单体对之间的氢键特殊相互作用,采用一步反应在水相中共聚甲基丙烯酸（MAA）、丙烯酰胺（AM）和交联剂乙二醇二甲基丙烯酸酯（EGDMA）,制备了pH响应性共聚物P（MAA-co-AM）纳米水凝胶。采用纳米粒度与电位分析仪、傅里叶红外光谱仪、透射电子显微镜、场发射扫描电镜等对P（MAA-co-AM）纳米水凝胶的尺寸、形貌、组成和结构进行了表征。系统研究了反应参数对P（MAA-co-AM）纳米水凝胶的影响。结果表明：当两单体等物质的量投料时所制备的P（MAA-co-AM）纳米水凝胶粒径分布最窄（〈D_h〉=129 nm,PDI=0.095）,且其粒径随着两单体用量的增加而增大。随着单体加入时间的延长或EGDMA用量的增加,P（MAA-co-AM）纳米水凝胶的粒径逐渐变小。P（MAA-co-AM）纳米水凝胶表现出极好的pH响应性：当介质的pH从4增加到8时,溶胀比高达7,体积扩张了343倍。     

生物信息学方法推测脊椎动物血红蛋白相互作用机制

目的 通过分析脊椎动物血红蛋白(Hb)分子进化过程,解释Hb相互作用的现象并推测作用机制.方法 采用NCBI、PDB等在线生物信息学网站及SMS、ANTHEPROT 5.0、Clustalx 2.0、MEGA 4、Vector NTI 9等软件包对比脊椎动物门各纲羊膜和非羊膜动物Hb氨基酸多序列的同源相似性,查找保守位点,构建分子进化树,预测二级结构,对比三级结构模型,推测Hb相互作用现象的发生机制.结果 氨基酸多序列对比显示,非羊膜动物α链没有保守氨基酸(cAA),β链有3个cAA,羊膜动物α链、β链分别有27个和68个cAA;分子进化树显示非羊膜动物Hb氨基酸每位点替代值(SpS)远大于羊膜动物(P<0.01);预测二级结构分析Hb作用面发现非羊膜动物α链40位氨基酸主要参与无规则卷曲结构,羊膜动物α链40位和β链94位氨基酸均主要参与α螺旋结构;对比空间结构模型发现羊膜动物α链均有一个苏氨酸(41位)与β链的组氨酸(98位)形成氢键,而非羊膜动物不能形成此氢键.结论 脊椎动物Hb相互作用发生的关键可能在于是否存在α链苏氨酸(41位)与β链组氨酸(98位) 形成的氢键.     

难溶性药物与介孔二氧化硅纳米粒载体的相互作用对于释放速率的影响

目的 研究介孔二氧化硅纳米粒（MSN）载体与装载的难溶性药物间的相互作用,探索对释放速率具有重要影响的因素,归纳总结可预测难溶性药物-MSN给药系统释放行为的数学模型。方法 以溶胶凝胶法制备的MSN作为载体,通过溶剂挥干法进行药物装载,利用扫描电子显微镜（SEM）、透射电子显微镜（TEM）分析载体的外观形貌及孔道结构,通过比表面积分析仪研究载体的比表面积及孔径分布。选取载药量及药物的氢键受体数量作为因素进行释放行为分析,通过Design Expert软件进行2因素3水平析因设计,完成体外释放实验;2、24 h累积释放度作为因变量,拟合数学模型。结果溶胶凝胶法制备的MSN为均一的球形,粒径约为400 nm,孔道呈放射状,孔径均一为3.6 nm。拟合模型显示,载药量比氢键受体数量对2 h累计释放度影响更大,随着载药量的增加,2 h累计释放度逐渐下降;在研究范围内,氢键受体数为6,载药量为50%具有最小的2 h累计释放度,为50.31%。24 h累计释放度则根据载药量的不同随着氢键受体数的改变呈现相反趋势,当载药量较低时,与氢键受体数呈正相关;当载药量较高时,与氢键受体数呈负相关。氢键受体数为6,载药量小于10%时具有最大的24 h累计释放度,可达99.44%。结论 相对药物的氢键受体数量,载药量对于难溶性药物-MSN给药系统的速缓释放具有重要调控作用,低载药量可以实现药物的2 h快速释放及24 h完全释放,高载药量则反之。     

喝小分子水祛除冠心病

人们平常喝的天然水，水分子间有较强的氢键，许多水分子缔合成大的簇团，参与体内生物化学反应差，脂质代谢差。     

细胞亲和-UPLC-QTOF测定蟾蜍甾烯与宫颈癌HeLa细胞的亲和及与化合物计算分子属性的相关性分析

目的测定蟾蜍甾烯类化合物(Bu)与人宫颈癌HeLa细胞的亲和率,分析其与化合物计算分子属性的相关性。方法蟾酥氯仿提取物与HeLa细胞亲和,采用UPLC-QTOF测定亲和后HeLa细胞裂解物和上清液中蟾蜍甾烯的水平,计算Bu与细胞的总亲和率。Pubchem数据库采集蟾蜍甾烯化合物的10种计算分子属性。统计分析两者间相关性。结果Bu与细胞的总亲和率与化合物脂水分配参数(XLogP3)、氢键供体(H-Bond Donor)、拓扑极性表面积(topological polarsurface area,TPSA)呈相关性,其相关系数分别是r=0.865(P<0.01),r=-0.901(P<0.01),r=-0.657(P<0.05)。与其它计算分子属性间不具有相关性(P>0.05)。结论蟾蜍甾烯与HeLa细胞发生不同程度亲和。化合物的脂水性、氢键供体个数和渗透性是影响蟾蜍甾烯与HeLa细胞亲和的非特异性因素。     

羧基和羧基化合物氢键酸度的量子化学参数表示

目的研究羟基和羧基化合物的量子化学参数与其实验氢键酸度∑αH2的关系.方法用Gaussian 98W程序包分别在B3LYP/6-311G**和HF/6-311G**(I原子用3-21G**基组)水平对70个羟基和羧基化合物的几何结构进行优化,在此基础上计算羟基氢和羟基氧原子的净电荷QH和Qo、化合物前线分子轨道能级EHOMO和ELUMO、系统总能ET和偶极矩D等量子化学参数;将计算所得B3LYP和HF两个参数集对∑αH2进行主成分回归(PCR)和逐步回归(SWR)分析,建立预报模型.结果基于B3LYP高精度参数集的回归模型拟合优度和预测值均好于HF的;PCR模型预测值与实验值吻合较好;SWR模型存在多重共线性,预测值可信度较低.结论羟基和羧基化合物的∑αH2适宜用B3LYP的量子化学参数来表示.     

壳聚糖-丝心蛋白合金膜中的壳聚糖/铜(Ⅱ)络合物对尿素的吸附性能探索

壳聚糖－丝心蛋白合金膜中的壳聚糖／铜（Ⅱ）络合物对尿素的吸附性能探索＊陈新李文俊钟伟于同隐（复旦大学高分子科学系，国家教委聚合物工程开发实验室，上海２００４３３）ＩＮＶＥＳＴＩＧＡＴＩＯＮＯＦＡＤＳＯＲＰＴＩＯＮＰＲＯＰＥＲＴＩＥＳＯＦＣＨＩＴＯＳＡ...