评测纵览:面向“基因-疾病”的关联语义挖掘任务

介绍活跃基因注释语料库的设计目的和标注过程、特点,阐述标注规则、标签设计、标注实例,分析语料库在医药领域的应用场景,包括抗癫痫药物重定位、阿尔茨海默症关键基因提取等领域。     

超临界流体萃取法在生物样品前处理中的应用

1　前言生物样品的前处理是体内药物分析的一个重要环节 ,也是整个分离分析过程中最繁琐的一个步骤。与原料药物和制剂相比 ,生物样品更为复杂 :微量药物分布在大量生物介质中 ,对分析仪器的灵敏度提出了更高的要求 ;样品中含有大量内源性物质 ,不仅能与药物及其代谢物结合 ,而     

3-芳基/芳氧甲基-6-芳基-1,2,4-三唑并［3,4-b］-1,3,4-噻二唑衍生物的合成及生物活性

噻二唑类杂环化合物有广泛的生物活性,如消炎、驱虫、除草、调节植物生长、防止水稻白叶枯病、柑桔溃疡病、蕃茄青枯病等［１～３］。而１,２,４三唑类杂环化合物也有相当广泛的生物活性,如抗菌、抗痉挛、消炎、抗血小板凝聚及调节植物生长等［４～６］。如果合成既...     

利用SELDI-TOF质谱技术分析喉癌患者血清蛋白质谱的变化

目的：筛选喉癌肿瘤标记物,探讨其在术前、术后患者血清中的表达变化。方法：利用固定金属亲和表面蛋白质芯片和表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术检测32例喉癌患者和38例正常人血清中的差异蛋白,进而检测32例喉癌术前和15例喉癌术后10d内血清中的差异蛋白。获得的蛋白质谱采用Ciphergen公司的Biomarker Wizard和Biomarker Pattern软件分析。结果：通过对喉癌患者术前血清与正常人血清蛋白质谱分析发现,共有15个蛋白质表达量有明显差异;对喉癌患者术前血清与术后血清蛋白质谱分析发现,共有17个蛋白质表达量有明显差异。并获得相对分子质量为2958.52、3796.89、5148.86、6115.57、4052.18和7770.76这6个蛋白质组成的模板,可将喉癌术前与术后正确分组,其正确分组率分别为84.38%（27/32）和73.33%（11/15）。结论：通过喉癌手术前后血清中蛋白质谱的比较,可以筛选得到用以诊断喉癌的特异性蛋白标志物并用以预后的判断。固定金属亲和表面蛋白质芯片和SELDI-TOF-MS技术对于发现和筛选血清中的喉癌标志物是一种有效、快速的方法。     

艾滋病阴虚内热证的生物学相关性研究

目的：探讨运用生物学理论研究艾滋病（AIDS）阴虚内热证的实质。方法：通过文献的整理、归纳、总结、分析,探讨AIDS阴虚内热证的生物学相关性。结果：AIDS阴虚内热证有明显的生物学相关性。结论：中医证侯的生物学相关性研究能够为中医药现代化、标准化研究提供科学依据     

Xenohormesis:从进化与生态角度理解中药的生物效应

Xenohormesis解释了为何植物受环境胁迫后产生的次生代谢产物能提高取食动物的胁迫耐受性与生存机会,认为在自然选择压力下动物保留着感知这些胁迫信号分子的能力,从而激活进化保守性的细胞应激响应机制,提高逆境适应力.该文在介绍Xenohormesis效应概念与机制,分析总结植物与昆虫及人类的Xenohormesis效应关系的基础上,以人参为例阐述了中药Xenohormesis效应,认为借鉴Xenohormesis理论能从进化与生态角度理解中药生物效应的本质,对中药现代化研究具重要价值.     

血清中微小RNA作为肿瘤标记物的研究进展

血清中的微小RNA(miRNA)相对容易逃脱核糖核酸酶的消化.并且不易受酸碱度、温度及放置时间长短的影响,具有非常好的稳定性.肿瘤患者血清中发现了许多miRNA,一些已经被证实与肿瘤发生发展相关的miRNA在血清中高表达,并且对某些肿瘤具有高度敏感性及特异性,因此血清中的miRNA有望作为肿瘤标记物进行测定.     

CA19-9、CA125和CP2在卵巢黏液性肿瘤诊断和监测中的价值

目的探讨血清肿瘤标志物CA19-9、CA125及CP2在卵巢黏液性肿瘤诊断和监测中的价值。方法对北京大学人民医院1999年1月至2007年6月间收治的273例卵巢肿瘤患者的临床资料进行回顾性分析,探讨血清肿瘤标志物CA19-9、CA125及CP2在50例卵巢黏液性肿瘤诊断和监测中的价值,并与223例卵巢非黏液性肿瘤进行比较。结果（1）卵巢黏液性肿瘤中,CA19-9的曲线下面积最大（为0．95）,其次是CA125（为0．90）;而卵巢非黏液肿瘤中,CA125和CP2的曲线下面积最大（均为0．90）。（2）卵巢黏液性肿瘤患者联合检测CA19-9和CA125时,其敏感度（93．8％）较单项检测（CA19-9和CA125分别为75．0％和66．7％）明显提高（P〈0．05）,而特异度（分别为86．1％、86．6％和90．2％）无明显变化（P〉0．05）。卵巢非黏液性肿瘤患者联合检测CA125和CP2时的敏感度（85．0％）,较CP2（70．6％）单项检测明显提高,差异有统计学意义（P〈0．05）;较CA125（80．7％）单项检测虽有提高,但差异无统计学意义（P〉0．05）;3者的特异度（分别为90．2％、88．5％和93．9％）比较,差异无统计学意义（P〉0．05）。（3）82例卵巢恶性肿瘤术前血清肿瘤标志物阳性患者中。可行满意的肿瘤细胞减灭术患者[70％（57／82）]的血清肿瘤标志物于术后2个月内降为正常的百分率高于未能行满意肿瘤细胞减灭术者（分别为75％和28％）,差异有统计学意义（P〈0．05）;且其术后血清肿瘤标志物再次上升的平均时间延长（分别为18．2和16．4个月）,但差异无统计学意义（P〉0．05）;复发率（分别为35％和56％）及死亡率（分别为14％和32％）降低,差异有统计学意义（P〈0．05）。20例术前血清肿瘤标志物阴性患者均可行满意的肿瘤细胞减灭术,其中复发患者仅2例（10％）。（4）卵巢黏液性肿瘤患者术后复发时多为血清CA19-9水平上升,而卵巢非黏液性肿瘤术后复发时主要为血清CA125水平上升,部分患者血清CP2水平也上升。（5）术前血清肿瘤标志物阳性患者较阴性患者生存率明显下降,其中CA125（＋）与CA125（-）、CP2（＋）与CP2（-）患者间生存率比较,差异有统计学意义（P〈0．05）;而CA19-9（＋）与CA19-9（-）患者间生存率比较,差异则无统计学意义（P〉0．05）。结论CA19-9是诊断卵巢黏液性肿瘤的敏感指标,与CA125联合检测可提高对卵巢黏液性肿瘤诊断的敏感度,并对术后监测有重要临床意义。CA125和CP2联合检测则对诊断卵巢非黏液肿瘤更敏感。     

推拿法引发人骨骼肌细胞生物学效应的机制探讨

目的：探索推拿法力学作用引发人骨骼肌细胞生物学效应的机制。方法：采用细胞培养技术,建立人骨骼肌细胞损伤模型后,将正常细胞和损伤细胞各自分为空白对照组、推拿法组、推拿法＋维拉帕米组、静态压力组和静态压力＋维拉帕米组。分别对各组细胞进行推拿法样刺激或静压刺激,持续时间10 min。其后对各组细胞的超氧化物歧化酶（SOD）活力、丙二醛（MDA）含量、肌酸激酶（CK）活力进行检测。结果：推拿法可以提高人骨骼肌细胞内SOD活力,降低细胞内MDA含量以及细胞上清中的CK活力;在加入钙离子拮抗剂———维拉帕米后,各项指标的变化均受到明显的影响。结论：推拿法的力学作用主要通过影响人骨骼肌细胞中钙离子的信号通路,从而激发损伤细胞修复的生物学效应。     

Biological Characteristics of Infectious Laryngotracheitis Viruses Isolated in China

Infectious laryngotracheitis virus (ILTV) causes severe respiratory disease in chickens and results in huge economic losses in the poultry industry worldwide. To correlate the genomic difference with the replication and pathogenicity, phenotypes of three ILTVs isolated from chickens in China from 2016 to 2018 were sequenced by high-throughput sequencing. Based on the entire genome, the isolates GD2018 and SH2017 shared 99.9% nucleotide homology, while the isolate SH2016 shared 99.7% nucleotide homology with GD2018 and SH2017, respectively. Each virus genome contained 82 ORFs encoding 77 kinds of protein, 31 of which share the same amino acid sequence in the three viruses. GD2018 and SH2017 shared 57 proteins with the same amino acid sequence, while SH2016 shared 42 and 41 proteins with the amino acid sequences of GD2018 and SH2017, respectively. SH2016 propagated efficiently in allantoic fluid and on chorioallantoic membranes (CAMs) of SPF chicken embryo eggs, while GD2018 and SH2017 proliferated well only on CAMs. GD2018 propagated most efficiently on CAMs and LMH cells among three isolates. SH2016 caused serious clinical symptoms, while GD2018 and SH2017 caused mild and moderate clinical symptoms in chickens, although the sero of the chickens infected with those three isolates were all positive for anti-ILTV antibody at 14 and 21 days after challenge. Three ILTVs with high genetic homology showed significant differences in the replication in different culture systems and the pathogenicity of chickens, providing basic materials for studying the key determinants of pathogenicity of ILTV.