蛋白质组学技术在大肠癌肿瘤标志物研究中的应用

大肠癌是人类常见的肿瘤之一,往往被诊断出时已是中晚期,预后较差.因此,早期诊断是治疗的关键,能明显改善预后.虽然当前血清CEA和CA-199等的检测已被广泛应用于大肠癌的筛选,但其缺乏特异性和敏感性,这就需要进一步寻找新的标志物.近年来,蛋白质组学的发展已深入到生命科学的各个领域,尤其应用于肿瘤研究方面,这就为我们发现新的大肠癌标志物提供了崭新的途径.本文对蛋白质组学技术在大肠癌肿瘤标志物研究中的应用进展作简要综述.     

Alteration of protein profile in cerebral cortex of rats exposed to bisphenol a: a proteomics study

Bisphenol A (BPA) is one of the most widely used chemicals in plastic industry, which enters the human body through occupational and food contact. We studied the protein changes in rat cerebral cortex to evaluate the neurotoxicity of BPA. Twenty-four adult male rats were randomly selected and divided into four groups and each group respectively received 0, 0.5, 5 and 50 mg/kg of BPA for 4 weeks orally. To determine the oxidative status, reduced glutathione content and the level of malondialdehyde were measured in brain cortical tissue. The proteins of each sample extracted and separated on a two-dimensional acrylamide gel electrophoresis. From the obtained protein map, the 10 most altered protein spots were used for mass spectroscopy analysis. The lipid peroxidation in both doses of 0.5 and 5 mg/kg was significantly higher than the control group, but the glutathione content had no significant difference between the groups. Based on the results of the MS data analysis by the MASCOT database search engine, 10 proteins with altered intensity were identified as pyruvate kinase, alpha-enolase, aconitate hydratase, creatine kinase B-type, phosphatidylethanolamine-binding protein 1, 14-3-3 protein eta, guanine nucleotide-binding protein subunit beta-1, dihydropyrimidinase-related protein 2, glutamine synthetase and the neurofilament light polypeptide. There are several reports suggesting that the increase or decrease in the level and activity of these 10 proteins, similar to those observed in this study, is related to some neurological and psychosocial disorders including neurodegenerative diseases, schizophrenia, depression, epilepsy and some brain tumors.     

结直肠癌蛋白质组学的研究进展

人类基因组计划(HGP)的完成,宣告了后基因组时代的到来,其中蛋白质组学已成为研究的重点.随着蛋白质组学研究的不断深入,现已形成一个"肿瘤蛋白质组学"的分支.肿瘤蛋白质组学可动态、整体、定量地观察肿瘤发生、进展中蛋白质种类、数量的改变,现已广泛用于各种肿瘤的研究.结直肠癌是人类的一种常见的恶性疾病,肿瘤蛋白质组学在寻找结直肠癌的肿瘤生物标记物,研究结直肠癌发生的分子机制和挖掘药物的抗癌靶点等方面得到了很好的应用.     

MALDI-TOF-MS分析新疆食管鳞状细胞癌的蛋白组学

目的:分析新疆食管鳞状细胞癌和食管正常上皮细胞的差异表达蛋白.方法:运用激光捕获显微切割技术(LCM)分别获取食管鳞状癌细胞和食管正常上皮细胞,应用二维凝胶电泳技术(2-DE)分离纯化细胞,Imagemaster 2D软件比较分析两者电泳图谱的差异,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定分析两者表达的差异蛋白.结果:建立了食管鳞状癌细胞和食管正常上皮细胞的2-DE图谱,获得43个差异蛋白点,通过质谱鉴定出17种蛋白,其中15种蛋白如Trangelin2、HSP27、S100A11、GSTP等在食管鳞状癌细胞中表达明显增高,2种蛋白如SCCA1,在食管鳞状癌细胞中表达明显降低.结论:提示17种差异蛋白可能与食管鳞状细胞癌的发生和发展有关,为筛选食管鳞状细胞癌的特异性分子标志物奠定基础.     

胃癌和慢性胃炎患者幽门螺杆菌蛋白质组学分析

背景：胃癌的发生是一个多因素多步骤的过程,幽门螺杆菌（H．pylori）感染在此过程中发挥重要作用。目的：建立胃癌和慢性胃炎H．pylori的双向凝胶电泳（2-DE）图谱,识别鉴定差异表达的蛋白质．探讨细菌本身因素在胃癌发病过程中的作用。方法：取H.pylori而阳性的胃癌和慢性胃炎患者胃黏膜组织后分离培养H.pylori,收集菌体并采用BCA法行蛋白定量,以2-DE分离Hpylori蛋白．采用PDQuest软件分析差异表达的蛋白质点．应用电喷雾四极杆飞行时间串联质谱（Q—TOF）进行鉴定,并在Mascot数据库中进行检索。结果：胃癌和慢性胃炎H．pylori总蛋白均获得分辨率高、重复性好的2-DE图谱。共6个蛋白质点在胃癌和慢性胃炎中存在表达差异．其中超氧化物歧化酶、尿素酶仪亚单位、分子伴侣60kDa在胃癌Hpylori菌株中高表达,而巯基过氧化物酶、二磷酸核苷激酶、S．核糖基同型半胱氨酸裂解酶在慢性胃炎H．pylori菌株中高表达。结论：成功建立了分辨率高且重复性好的胃癌和慢性胃炎H．pylori蛋白的2-DE图谱,并鉴定出两种疾病相关菌株中差异表达的蛋白质点．这些蛋白质点可能在胃癌的发生中起重要作用。     

New multi protein patterns differentiate liver fibrosis stages and hepatocellular carcinoma in chronic hepatitis C serum samples

~~New multi protein patterns differentiate liver fibrosis stages and hepatocellular carcinoma in chronic hepatitis C serum samples@Thomas Gbel$Klinik für Gastroenterologie,Hepatologie und Infektiologie,Heinrich-Heine-UniversitatDusseldorf,Moorenstr.e,D…     

阿尔茨海默病的蛋白质组学研究进展

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系统性红斑狼疮患者血清蛋白质组学研究

目的 运用蛋白质组学的方法,分析正常人及SLE患者血清蛋白质的差异表达,寻找与SLE疾病发病机制相关的蛋白质.方法 分别收集健康人及SLE患者血清各9例,同组血清等量混合,用试剂盒除去血清中的白蛋白和免疫球蛋白,再经除盐浓缩后,将血清样品采用固相pH梯度（IPG）双向凝胶电泳（2-DE）分离正常人及SLE患者血清的总蛋白质.凝胶经考马斯亮蓝染色显色后,利用Analysis2d软件对获得的蛋白图谱进行分析,寻找差异表达的蛋白质,利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）进行鉴定,分析差异蛋白点.结果 对照组凝胶共检出蛋白点648个,患者组检出639个.对照组凝胶蛋白点匹配率84.5％,患者组凝胶蛋白点匹配率82.5％.通过比较分析,差异表达蛋白质点数为92个,有52个蛋白点在SLE患者组表达上调,40个表达下调,有14个点的表达水平在组间差异有统计学意义,质谱鉴定共鉴定5个蛋白质.通过文献研究显示,我们鉴定的部分蛋白在SLE的发病机制中起潜在的作用.结论 在SLE患者血清中存在着差异血清蛋白质,这些蛋白质可能是SLE发病的内在因素,并且在SLE的疾病发展过程中发挥重要作用,可能作为新的血清标志物和潜在的自身抗原.     

吡那地尔后处理大鼠缺血再灌注损伤心肌线粒体的蛋白质组学研究

 目的: 运用蛋白质组学研究方法探讨吡那地尔后处理对缺血再灌注损伤大鼠心肌的保护作用。方法: 建立Langendorff大鼠离体心脏缺血再灌注损伤模型,随机分为吡那地尔后处理组(Pina组)和缺血再灌注损伤组(I/R组),每组9只。提取心肌线粒体蛋白质行双向凝胶电泳,应用质谱鉴定差异大于2倍的蛋白质点。结果: Pina组与I/R组比较,共发现7个差异蛋白质:Pina组NADH脱氢酶1α亚复合体10亚基(NDUFA10)﹑NADH脱氢酶铁硫蛋白2(NDUFS2)和NADH脱氢酶黄素蛋白2(NDUFV2)表达低于I/R组;Pina组异柠檬酸脱氢酶α亚基(IDHA)和Δ^3,5-Δ^2,4-二烯酰辅酶A异构酶(ECH1)表达高于I/R组;另有2个蛋白质点均被鉴定为ATP合酶δ亚基,一个蛋白质点表达升高,而另一个表达降低。结论:吡那地尔后处理可能抑制了复合体Ⅰ的亚基(NDUFA10﹑NDUFS2和NDUFV2)代偿性增加,但促进了IDHA和ECH1表达并引发了ATP合酶δ亚基发生磷酸化,这些改变可能均与吡那地尔后处理保护心肌的作用有关。